RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 PRAM1Q96QH2 718 aa23.78■■□□□ 1.4
ATG4B-216ENST00000475195 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.77■■□□□ 1.4
ATG4B-216ENST00000475195 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.77■■□□□ 1.4
ATG4B-216ENST00000475195 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
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ATG4B-216ENST00000475195 PHLPP1O60346 1717 aa23.74■■□□□ 1.39
ATG4B-216ENST00000475195 ORAI2Q96SN7 254 aa23.73■■□□□ 1.39
ATG4B-216ENST00000475195 POGKQ9P215 609 aa23.73■■□□□ 1.39
ATG4B-216ENST00000475195 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
ATG4B-216ENST00000475195 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.7■■□□□ 1.38
ATG4B-216ENST00000475195 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.67■■□□□ 1.38
ATG4B-216ENST00000475195 JCADQ9P266 1359 aa23.67■■□□□ 1.38
ATG4B-216ENST00000475195 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
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ATG4B-216ENST00000475195 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.66■■□□□ 1.38
ATG4B-216ENST00000475195 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
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ATG4B-216ENST00000475195 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
ATG4B-216ENST00000475195 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
ATG4B-216ENST00000475195 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.65■■□□□ 1.38
ATG4B-216ENST00000475195 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
ATG4B-216ENST00000475195 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.64■■□□□ 1.38
ATG4B-216ENST00000475195 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
ATG4B-216ENST00000475195 TONSLQ96HA7 1378 aa23.64■■□□□ 1.37
ATG4B-216ENST00000475195 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.63■■□□□ 1.37
ATG4B-216ENST00000475195 NUTM2FA1L443 756 aa23.62■■□□□ 1.37
ATG4B-216ENST00000475195 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
ATG4B-216ENST00000475195 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
ATG4B-216ENST00000475195 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.6■■□□□ 1.37
ATG4B-216ENST00000475195 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-216ENST00000475195 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-216ENST00000475195 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-216ENST00000475195 SHPRHQ149N8 1683 aa23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-216ENST00000475195 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.59■■□□□ 1.37
ATG4B-216ENST00000475195 FOXO3O43524 673 aa23.58■■□□□ 1.37
ATG4B-216ENST00000475195 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
ATG4B-216ENST00000475195 USP32Q8NFA0 1604 aa23.56■■□□□ 1.36
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ATG4B-216ENST00000475195 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.56■■□□□ 1.36
ATG4B-216ENST00000475195 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-216ENST00000475195 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ATG4B-216ENST00000475195 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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ATG4B-216ENST00000475195 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-216ENST00000475195 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.54■■□□□ 1.36
ATG4B-216ENST00000475195 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-216ENST00000475195 CDK19Q9BWU1 502 aa23.52■■□□□ 1.36
ATG4B-216ENST00000475195 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.49■■□□□ 1.35
ATG4B-216ENST00000475195 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.49■■□□□ 1.35
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ATG4B-216ENST00000475195 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ATG4B-216ENST00000475195 LRP6O75581 1613 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4B-216ENST00000475195 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4B-216ENST00000475195 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4B-216ENST00000475195 ATP7BP35670 1465 aa23.46■■□□□ 1.35
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ATG4B-216ENST00000475195 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.46■■□□□ 1.35
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ATG4B-216ENST00000475195 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-216ENST00000475195 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ATG4B-216ENST00000475195 SBNO1A3KN83 1393 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4B-216ENST00000475195 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4B-216ENST00000475195 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ATG4B-216ENST00000475195 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-216ENST00000475195 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-216ENST00000475195 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ATG4B-216ENST00000475195 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG4B-216ENST00000475195 ITSN1Q15811 1721 aa23.4■■□□□ 1.34
ATG4B-216ENST00000475195 CABP2Q9NPB3 220 aa23.39■■□□□ 1.33
ATG4B-216ENST00000475195 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ATG4B-216ENST00000475195 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4B-216ENST00000475195 EVC2Q86UK5 1308 aa23.38■■□□□ 1.33
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ATG4B-216ENST00000475195 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ATG4B-216ENST00000475195 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.37■■□□□ 1.33
ATG4B-216ENST00000475195 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
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ATG4B-216ENST00000475195 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
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ATG4B-216ENST00000475195 ARHGEF10O15013 1369 aa23.33■■□□□ 1.33
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
ATG4B-216ENST00000475195 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.32■■□□□ 1.32
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ATG4B-216ENST00000475195 SLC24A1O60721 1099 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4B-216ENST00000475195 ADAMTS2O95450 1211 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4B-216ENST00000475195 TESK2Q96S53 571 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4B-216ENST00000475195 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-216ENST00000475195 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-216ENST00000475195 AFF2P51816 1311 aa23.29■■□□□ 1.32
ATG4B-216ENST00000475195 NGLY1Q96IV0 654 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-216ENST00000475195 C8orf37Q96NL8 207 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4B-216ENST00000475195 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ATG4B-216ENST00000475195 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
ATG4B-216ENST00000475195 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.26■■□□□ 1.31
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