RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
NISCH-206ENST00000474188 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
NISCH-206ENST00000474188 TMEM132EQ6IEE7 984 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-206ENST00000474188 MYOM2P54296 1465 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-206ENST00000474188 PXDNQ92626 1479 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-206ENST00000474188 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.4■□□□□ 0.22
NISCH-206ENST00000474188 RGL3Q3MIN7 710 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-206ENST00000474188 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
NISCH-206ENST00000474188 NGLY1Q96IV0 654 aa16.39■□□□□ 0.21
NISCH-206ENST00000474188 NUTM2FA1L443 756 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-206ENST00000474188 STK26Q9P289 416 aa16.38■□□□□ 0.21
NISCH-206ENST00000474188 TECPR2O15040 1411 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-206ENST00000474188 ATRNO75882 1429 aa16.37■□□□□ 0.21
NISCH-206ENST00000474188 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
NISCH-206ENST00000474188 BCL9LQ86UU0 1499 aa16.36■□□□□ 0.21
NISCH-206ENST00000474188 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa16.36■□□□□ 0.21
NISCH-206ENST00000474188 FOXO3O43524 673 aa16.36■□□□□ 0.21
NISCH-206ENST00000474188 ESCO1Q5FWF5 840 aa16.36■□□□□ 0.21
NISCH-206ENST00000474188 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.36■□□□□ 0.21
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NISCH-206ENST00000474188 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
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NISCH-206ENST00000474188 ABCC11Q96J66 1382 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-206ENST00000474188 PIK3C2GO75747 1445 aa16.34■□□□□ 0.21
NISCH-206ENST00000474188 CCDC144AA2RUR9 1427 aa16.32■□□□□ 0.2
NISCH-206ENST00000474188 NPHP3Q7Z494 1330 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-206ENST00000474188 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
NISCH-206ENST00000474188 EP400Q96L91 3159 aa16.31■□□□□ 0.2
NISCH-206ENST00000474188 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
NISCH-206ENST00000474188 CFAP70Q5T0N1 1121 aa16.29■□□□□ 0.2
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NISCH-206ENST00000474188 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa16.27■□□□□ 0.2
NISCH-206ENST00000474188 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.27■□□□□ 0.19
NISCH-206ENST00000474188 SLIT2O94813 1529 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-206ENST00000474188 GLI3P10071 1580 aa16.26■□□□□ 0.19
NISCH-206ENST00000474188 CABLES1Q8TDN4 633 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-206ENST00000474188 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
NISCH-206ENST00000474188 ATAD2Q6PL18 1390 aa16.25■□□□□ 0.19
NISCH-206ENST00000474188 KRT28Q7Z3Y7 464 aa16.24■□□□□ 0.19
NISCH-206ENST00000474188 SIRT1Q96EB6 747 aa16.24■□□□□ 0.19
NISCH-206ENST00000474188 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
NISCH-206ENST00000474188 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
NISCH-206ENST00000474188 RALGAPBQ86X10 1494 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-206ENST00000474188 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
NISCH-206ENST00000474188 UNC5CLQ8IV45 518 aa16.22■□□□□ 0.19
NISCH-206ENST00000474188 PRAM1Q96QH2 718 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-206ENST00000474188 PHF8Q9UPP1 1060 aa16.21■□□□□ 0.19
NISCH-206ENST00000474188 USP32Q8NFA0 1604 aa16.2■□□□□ 0.18
NISCH-206ENST00000474188 ADGRB1O14514 1584 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-206ENST00000474188 PLEKHG5O94827 1062 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-206ENST00000474188 TNS3Q68CZ2 1445 aa16.19■□□□□ 0.18
NISCH-206ENST00000474188 PRR36Q9H6K5 1346 aa16.19■□□□□ 0.18
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NISCH-206ENST00000474188 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.17■□□□□ 0.18
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NISCH-206ENST00000474188 DEFB132Q7Z7B7 95 aa16.16■□□□□ 0.18
NISCH-206ENST00000474188 SBNO1A3KN83 1393 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-206ENST00000474188 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
NISCH-206ENST00000474188 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.15■□□□□ 0.18
NISCH-206ENST00000474188 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
NISCH-206ENST00000474188 ABCA3Q99758 1704 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 DLC1Q96QB1 1528 aa16.14■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 VPS72Q15906 364 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.13■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 ADGRB2O60241 1585 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 PLCH1Q4KWH8 1693 aa16.11■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 ANKARQ7Z5J8 1434 aa16.1■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 PSME1Q06323 249 aa16.09■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 LMOD2Q6P5Q4 547 aa16.09■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 POGKQ9P215 609 aa16.09■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa16.09■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 NRAPQ86VF7 1730 aa16.08■□□□□ 0.17
NISCH-206ENST00000474188 CCDC125Q86Z20 511 aa16.08■□□□□ 0.16
NISCH-206ENST00000474188 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.08■□□□□ 0.16
NISCH-206ENST00000474188 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
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NISCH-206ENST00000474188 NWD2Q9ULI1 1742 aa16.06■□□□□ 0.16
NISCH-206ENST00000474188 ARHGEF10O15013 1369 aa16.06■□□□□ 0.16
NISCH-206ENST00000474188 WASLO00401 505 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NISCH-206ENST00000474188 DCAF11Q8TEB1 546 aa16.06■□□□□ 0.16
NISCH-206ENST00000474188 FAM182BQ5T319 152 aa16.05■□□□□ 0.16
NISCH-206ENST00000474188 BTG4Q9NY30 223 aa16.05■□□□□ 0.16
NISCH-206ENST00000474188 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa16.05■□□□□ 0.16
NISCH-206ENST00000474188 TULP4Q9NRJ4 1543 aa16.04■□□□□ 0.16
NISCH-206ENST00000474188 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
NISCH-206ENST00000474188 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NISCH-206ENST00000474188 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.03■□□□□ 0.16
NISCH-206ENST00000474188 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NISCH-206ENST00000474188 ATP7BP35670 1465 aa16.02■□□□□ 0.15
NISCH-206ENST00000474188 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa16■□□□□ 0.15
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