RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472598.5

SYP-205, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 3

Gene SYP, Length 761 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-205ENST00000472598 AFF2P51816 1311 aa27.23■■□□□ 1.95
SYP-205ENST00000472598 NUTM2FA1L443 756 aa27.23■■□□□ 1.95
SYP-205ENST00000472598 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.22■■□□□ 1.95
SYP-205ENST00000472598 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.22■■□□□ 1.95
SYP-205ENST00000472598 ADAMTS2O95450 1211 aa27.21■■□□□ 1.95
SYP-205ENST00000472598 RXRBP28702 533 aa27.21■■□□□ 1.95
SYP-205ENST00000472598 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
SYP-205ENST00000472598 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
SYP-205ENST00000472598 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.19■■□□□ 1.94
SYP-205ENST00000472598 PIK3C2GO75747 1445 aa27.16■■□□□ 1.94
SYP-205ENST00000472598 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
SYP-205ENST00000472598 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.16■■□□□ 1.94
SYP-205ENST00000472598 ABCC11Q96J66 1382 aa27.15■■□□□ 1.94
SYP-205ENST00000472598 FOXO3O43524 673 aa27.15■■□□□ 1.94
SYP-205ENST00000472598 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
SYP-205ENST00000472598 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
SYP-205ENST00000472598 NGLY1Q96IV0 654 aa27.14■■□□□ 1.94
SYP-205ENST00000472598 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
SYP-205ENST00000472598 MYOM2P54296 1465 aa27.13■■□□□ 1.93
SYP-205ENST00000472598 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.13■■□□□ 1.93
SYP-205ENST00000472598 TECPR2O15040 1411 aa27.12■■□□□ 1.93
SYP-205ENST00000472598 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SYP-205ENST00000472598 LAMC1P11047 1609 aa27.09■■□□□ 1.93
SYP-205ENST00000472598 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.09■■□□□ 1.93
SYP-205ENST00000472598 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.08■■□□□ 1.93
SYP-205ENST00000472598 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.08■■□□□ 1.93
SYP-205ENST00000472598 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.08■■□□□ 1.93
SYP-205ENST00000472598 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.06■■□□□ 1.92
SYP-205ENST00000472598 SIRT1Q96EB6 747 aa27.05■■□□□ 1.92
SYP-205ENST00000472598 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
SYP-205ENST00000472598 USP21Q9UK80 565 aa27.04■■□□□ 1.92
SYP-205ENST00000472598 PRAM1Q96QH2 718 aa27.03■■□□□ 1.92
SYP-205ENST00000472598 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.02■■□□□ 1.92
SYP-205ENST00000472598 PXDNQ92626 1479 aa27.01■■□□□ 1.91
SYP-205ENST00000472598 DCAF11Q8TEB1 546 aa27■■□□□ 1.91
SYP-205ENST00000472598 POGKQ9P215 609 aa26.99■■□□□ 1.91
SYP-205ENST00000472598 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.98■■□□□ 1.91
SYP-205ENST00000472598 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.98■■□□□ 1.91
SYP-205ENST00000472598 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SYP-205ENST00000472598 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.97■■□□□ 1.91
SYP-205ENST00000472598 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.97■■□□□ 1.91
SYP-205ENST00000472598 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
SYP-205ENST00000472598 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.96■■□□□ 1.91
SYP-205ENST00000472598 RGS12O14924 1447 aa26.96■■□□□ 1.91
SYP-205ENST00000472598 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.96■■□□□ 1.91
SYP-205ENST00000472598 PLEKHG5O94827 1062 aa26.95■■□□□ 1.9
SYP-205ENST00000472598 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
SYP-205ENST00000472598 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
SYP-205ENST00000472598 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.93■■□□□ 1.9
SYP-205ENST00000472598 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
SYP-205ENST00000472598 ADGRB1O14514 1584 aa26.92■■□□□ 1.9
SYP-205ENST00000472598 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
SYP-205ENST00000472598 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.91■■□□□ 1.9
SYP-205ENST00000472598 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
SYP-205ENST00000472598 PSME1Q06323 249 aa26.88■■□□□ 1.89
SYP-205ENST00000472598 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.88■■□□□ 1.89
SYP-205ENST00000472598 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.88■■□□□ 1.89
SYP-205ENST00000472598 STAC3Q96MF2 364 aa26.88■■□□□ 1.89
SYP-205ENST00000472598 NEUROD1Q13562 356 aa26.87■■□□□ 1.89
SYP-205ENST00000472598 BCL9LQ86UU0 1499 aa26.87■■□□□ 1.89
SYP-205ENST00000472598 ATRNO75882 1429 aa26.86■■□□□ 1.89
SYP-205ENST00000472598 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.85■■□□□ 1.89
SYP-205ENST00000472598 DLC1Q96QB1 1528 aa26.85■■□□□ 1.89
SYP-205ENST00000472598 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SYP-205ENST00000472598 KIF1AQ12756 1690 aa26.84■■□□□ 1.89
SYP-205ENST00000472598 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.84■■□□□ 1.89
SYP-205ENST00000472598 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
SYP-205ENST00000472598 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.8■■□□□ 1.88
SYP-205ENST00000472598 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SYP-205ENST00000472598 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.79■■□□□ 1.88
SYP-205ENST00000472598 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.79■■□□□ 1.88
SYP-205ENST00000472598 WASLO00401 505 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SYP-205ENST00000472598 USP32Q8NFA0 1604 aa26.77■■□□□ 1.88
SYP-205ENST00000472598 SBNO1A3KN83 1393 aa26.77■■□□□ 1.88
SYP-205ENST00000472598 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.76■■□□□ 1.87
SYP-205ENST00000472598 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
SYP-205ENST00000472598 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.75■■□□□ 1.87
SYP-205ENST00000472598 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.74■■□□□ 1.87
SYP-205ENST00000472598 SLIT2O94813 1529 aa26.73■■□□□ 1.87
SYP-205ENST00000472598 ADGRB2O60241 1585 aa26.71■■□□□ 1.87
SYP-205ENST00000472598 FAM83GA6ND36 823 aa26.71■■□□□ 1.87
SYP-205ENST00000472598 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.71■■□□□ 1.87
SYP-205ENST00000472598 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SYP-205ENST00000472598 ARHGEF10O15013 1369 aa26.71■■□□□ 1.87
SYP-205ENST00000472598 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.7■■□□□ 1.86
SYP-205ENST00000472598 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SYP-205ENST00000472598 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
SYP-205ENST00000472598 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.68■■□□□ 1.86
SYP-205ENST00000472598 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SYP-205ENST00000472598 CDK19Q9BWU1 502 aa26.67■■□□□ 1.86
SYP-205ENST00000472598 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SYP-205ENST00000472598 TONSLQ96HA7 1378 aa26.67■■□□□ 1.86
SYP-205ENST00000472598 TULP4Q9NRJ4 1543 aa26.66■■□□□ 1.86
SYP-205ENST00000472598 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.66■■□□□ 1.86
SYP-205ENST00000472598 VPS72Q15906 364 aa26.65■■□□□ 1.86
SYP-205ENST00000472598 GLI3P10071 1580 aa26.65■■□□□ 1.86
SYP-205ENST00000472598 EP400Q96L91 3159 aa26.64■■□□□ 1.85
SYP-205ENST00000472598 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SYP-205ENST00000472598 SEPT12Q8IYM1 358 aa26.63■■□□□ 1.85
SYP-205ENST00000472598 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
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