RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.78■■□□□ 1.24
FAAP20-211ENST00000469733 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.78■■□□□ 1.24
FAAP20-211ENST00000469733 ZMYM3Q14202 1370 aa22.78■■□□□ 1.24
FAAP20-211ENST00000469733 MORC1Q86VD1 984 aa22.78■■□□□ 1.24
FAAP20-211ENST00000469733 CABP2Q9NPB3 220 aa22.78■■□□□ 1.24
FAAP20-211ENST00000469733 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-211ENST00000469733 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.77■■□□□ 1.24
FAAP20-211ENST00000469733 PRAM1Q96QH2 718 aa22.77■■□□□ 1.23
FAAP20-211ENST00000469733 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-211ENST00000469733 POGKQ9P215 609 aa22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-211ENST00000469733 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
FAAP20-211ENST00000469733 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-211ENST00000469733 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
FAAP20-211ENST00000469733 NSD2O96028 1365 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-211ENST00000469733 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-211ENST00000469733 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.73■■□□□ 1.23
FAAP20-211ENST00000469733 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-211ENST00000469733 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
FAAP20-211ENST00000469733 DLC1Q96QB1 1528 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-211ENST00000469733 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF521Q96K83 1311 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-211ENST00000469733 TNRQ92752 1358 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-211ENST00000469733 A0A1W2PP64 1363 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-211ENST00000469733 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-211ENST00000469733 SHPRHQ149N8 1683 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-211ENST00000469733 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.67■■□□□ 1.22
FAAP20-211ENST00000469733 GOLGA2Q08379 1002 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-211ENST00000469733 ABCC11Q96J66 1382 aa22.66■■□□□ 1.22
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-211ENST00000469733 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.65■■□□□ 1.22
FAAP20-211ENST00000469733 APAF1O14727 1248 aa22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-211ENST00000469733 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
FAAP20-211ENST00000469733 NGEFQ8N5V2 710 aa22.64■■□□□ 1.21
FAAP20-211ENST00000469733 CDK19Q9BWU1 502 aa22.63■■□□□ 1.21
FAAP20-211ENST00000469733 CFAP53Q96M91 514 aa22.62■■□□□ 1.21
FAAP20-211ENST00000469733 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-211ENST00000469733 MTHFSP49914 203 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-211ENST00000469733 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-211ENST00000469733 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.61■■□□□ 1.21
FAAP20-211ENST00000469733 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.6■■□□□ 1.21
FAAP20-211ENST00000469733 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-211ENST00000469733 SLFN5Q08AF3 891 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-211ENST00000469733 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-211ENST00000469733 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.59■■□□□ 1.21
FAAP20-211ENST00000469733 MED14O60244 1454 aa22.58■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 METP08581 1390 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.57■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 RUNDC1Q96C34 613 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 CABP1Q9NZU7 370 aa22.55■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 NLRP1Q9C000 1473 aa22.54■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 ATP7BP35670 1465 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 TECPR2O15040 1411 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 E9PSI1 815 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 FYB1O15117 783 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.53■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 PLIN1O60240 522 aa22.52■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 SIRT1Q96EB6 747 aa22.52■■□□□ 1.2
FAAP20-211ENST00000469733 CPS1P31327 1500 aa22.51■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.51■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.5■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 WWC1Q8IX03 1113 aa22.48■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 C3P01024 1663 aa22.48■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.47■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.46■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.46■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.46■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
FAAP20-211ENST00000469733 MYT1Q01538 1121 aa22.45■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 CRBNQ96SW2 442 aa22.45■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.45■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.44■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 NEUROD2Q15784 382 aa22.43■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 LTKP29376 864 aa22.42■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC27Q2M243 656 aa22.42■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 ADGRB2O60241 1585 aa22.42■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.4■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.4■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 WDR63Q8IWG1 891 aa22.4■■□□□ 1.18
FAAP20-211ENST00000469733 EID1Q9Y6B2 187 aa22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms