RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469025.1

OPTN-209, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 642 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-209ENST00000469025 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.05□□□□□ -0.8
OPTN-209ENST00000469025 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
OPTN-209ENST00000469025 UGGT2Q9NYU1 1516 aa10.05□□□□□ -0.8
OPTN-209ENST00000469025 KDM5CP41229 1560 aa10.05□□□□□ -0.8
OPTN-209ENST00000469025 REREQ9P2R6 1566 aa10.05□□□□□ -0.8
OPTN-209ENST00000469025 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa10.05□□□□□ -0.8
OPTN-209ENST00000469025 HRCP23327 699 aa10.04□□□□□ -0.8
OPTN-209ENST00000469025 PTGER2P43116 358 aa10.04□□□□□ -0.8
OPTN-209ENST00000469025 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
OPTN-209ENST00000469025 BCL9LQ86UU0 1499 aa10.04□□□□□ -0.8
OPTN-209ENST00000469025 NWD1Q149M9 1564 aa10.03□□□□□ -0.8
OPTN-209ENST00000469025 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa10.03□□□□□ -0.8
OPTN-209ENST00000469025 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.03□□□□□ -0.8
OPTN-209ENST00000469025 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
OPTN-209ENST00000469025 PHLPP1O60346 1717 aa10.02□□□□□ -0.8
OPTN-209ENST00000469025 ARHGAP33O14559 1287 aa10.02□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.02□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 PRELPP51888 382 aa10.01□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 EVI5O60447 810 aa10□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 MYT1LQ9UL68 1186 aa10□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 MAP3K9P80192 1104 aa9.99□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 CAMK2BQ13554 666 aa9.99□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.99□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 CFAP44Q96MT7 982 aa9.99□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.99□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 MED14O60244 1454 aa9.98□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 A2ML1A8K2U0 1454 aa9.98□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 FOSBP53539 338 aa9.97□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 IGF1RP08069 1367 aa9.97□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 ATP10BO94823 1461 aa9.97□□□□□ -0.81
OPTN-209ENST00000469025 ZMYM3Q14202 1370 aa9.96□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 DEPDC5O75140 1603 aa9.96□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 PSEN2P49810 448 aa9.95□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 AFF2P51816 1311 aa9.95□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 IQGAP1P46940 1657 aa9.95□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 SHPRHQ149N8 1683 aa9.95□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa9.94□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.94□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 TK2O00142 265 aa9.94□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.94□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.94□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 KCNK17Q96T54 332 aa9.94□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.94□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 SCAPERQ9BY12 1400 aa9.93□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 NGLY1Q96IV0 654 aa9.92□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 KDM5DQ9BY66 1539 aa9.92□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 DPYSL4O14531 572 aa9.91□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 CHD4Q14839 1912 aa9.9□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 ANKLE2Q86XL3 938 aa9.9□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.9□□□□□ -0.82
OPTN-209ENST00000469025 PTPREP23469 700 aa9.88□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 ADAM33Q9BZ11 813 aa9.88□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.88□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 ABCA6Q8N139 1617 aa9.87□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 HRO43593 1189 aa9.87□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 DEFB132Q7Z7B7 95 aa9.87□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 PHF14O94880 888 aa9.86□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.86□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa9.85□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 UTRNP46939 3433 aa9.85□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 E2F4Q16254 413 aa9.85□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.85□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 FBXW7Q969H0 707 aa9.85□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 WDR70Q9NW82 654 aa9.85□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.85□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 ABCC1P33527 1531 aa9.85□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.85□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 KIF14Q15058 1648 aa9.85□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 ARID3CA6NKF2 412 aa9.84□□□□□ -0.83
OPTN-209ENST00000469025 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa9.83□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 PDIA6Q15084 440 aa9.83□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 ITSN2Q9NZM3 1697 aa9.83□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.83□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 EPAS1Q99814 870 aa9.82□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.82□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.82□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 GOLGA3Q08378 1498 aa9.82□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.8□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 TNS4Q8IZW8 715 aa9.8□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 STAC3Q96MF2 364 aa9.8□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 MAP3K1Q13233 1512 aa9.8□□□□□ -0.84
OPTN-209ENST00000469025 MLH3Q9UHC1 1453 aa9.79□□□□□ -0.84
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