RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468576.1

PTPRG-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRG, Length 854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-202ENST00000468576 CLCN1P35523 988 aa13□□□□□ -0.33
PTPRG-202ENST00000468576 FAM187AA6NFU0 413 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-202ENST00000468576 MMP16P51512 607 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-202ENST00000468576 USP46P62068 366 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-202ENST00000468576 FOXC1Q12948 553 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRG-202ENST00000468576 GUCA2AQ02747 115 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRG-202ENST00000468576 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF787Q6DD87 383 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRG-202ENST00000468576 DXOO77932 396 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRG-202ENST00000468576 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRG-202ENST00000468576 BARGINQ6ZT62 677 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRG-202ENST00000468576 ZMYND10O75800 440 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRG-202ENST00000468576 TOR4AQ9NXH8 423 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRG-202ENST00000468576 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
PTPRG-202ENST00000468576 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
PTPRG-202ENST00000468576 ST8SIA5O15466 376 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-202ENST00000468576 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PTPRG-202ENST00000468576 POTECB2RU33 542 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-202ENST00000468576 TRIM32Q13049 653 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-202ENST00000468576 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-202ENST00000468576 AAASQ9NRG9 546 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRG-202ENST00000468576 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRG-202ENST00000468576 AMHR2Q16671 573 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRG-202ENST00000468576 NUTM1Q86Y26 1132 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRG-202ENST00000468576 PCDHGC3Q9UN70 934 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRG-202ENST00000468576 AVPP01185 164 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRG-202ENST00000468576 CYP4X1Q8N118 509 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRG-202ENST00000468576 WNT7AO00755 349 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRG-202ENST00000468576 JUNDP17535 347 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRG-202ENST00000468576 SPIRE2Q8WWL2 714 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRG-202ENST00000468576 FDX1P10109 184 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRG-202ENST00000468576 CRIPAKQ8N1N5 446 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PTPRG-202ENST00000468576 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
PTPRG-202ENST00000468576 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
PTPRG-202ENST00000468576 RETREG3Q86VR2 466 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRG-202ENST00000468576 CCDC24Q8N4L8 307 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRG-202ENST00000468576 SKOR1P84550 965 aa12.8□□□□□ -0.36
PTPRG-202ENST00000468576 MRGPRX2Q96LB1 330 aa12.8□□□□□ -0.36
PTPRG-202ENST00000468576 DACH1Q9UI36 760 aa12.8□□□□□ -0.36
PTPRG-202ENST00000468576 MOXD2PA6NHM9 499 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRG-202ENST00000468576 NDUFV2P19404 249 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRG-202ENST00000468576 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
PTPRG-202ENST00000468576 SMPD1P17405 629 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRG-202ENST00000468576 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
PTPRG-202ENST00000468576 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
PTPRG-202ENST00000468576 C6orf229H3BNL8 230 aa12.76□□□□□ -0.37
PTPRG-202ENST00000468576 PARP9Q8IXQ6 854 aa12.76□□□□□ -0.37
PTPRG-202ENST00000468576 NUDT12Q9BQG2 462 aa12.76□□□□□ -0.37
PTPRG-202ENST00000468576 J3QL48 77 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRG-202ENST00000468576 TRIM66O15016 1216 aa12.75□□□□□ -0.37
PTPRG-202ENST00000468576 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
PTPRG-202ENST00000468576 WNT7BP56706 349 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRG-202ENST00000468576 CTC1Q2NKJ3 1217 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRG-202ENST00000468576 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
PTPRG-202ENST00000468576 BEGAINQ9BUH8 593 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRG-202ENST00000468576 AXIN1O15169 862 aa12.73□□□□□ -0.37
PTPRG-202ENST00000468576 MS4A1P11836 297 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRG-202ENST00000468576 TBC1D2Q9BYX2 928 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRG-202ENST00000468576 AK7Q96M32 723 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRG-202ENST00000468576 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRG-202ENST00000468576 CCNYL3P0C7X3 344 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRG-202ENST00000468576 PRR7Q8TB68 274 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRG-202ENST00000468576 MTMR2Q13614 643 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRG-202ENST00000468576 PTPRNQ16849 979 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRG-202ENST00000468576 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
PTPRG-202ENST00000468576 HPS1Q92902 700 aa12.67□□□□□ -0.38
PTPRG-202ENST00000468576 SIAH2O43255 324 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRG-202ENST00000468576 GJA5P36382 358 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRG-202ENST00000468576 EVA1BQ9NVM1 165 aa12.65□□□□□ -0.38
PTPRG-202ENST00000468576 SH3BP2P78314 561 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRG-202ENST00000468576 DESI1Q6ICB0 168 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRG-202ENST00000468576 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa12.64□□□□□ -0.39
PTPRG-202ENST00000468576 UNC93B1Q9H1C4 597 aa12.63□□□□□ -0.39
PTPRG-202ENST00000468576 SPDYE5A6NIY4 337 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRG-202ENST00000468576 SPTLC1O15269 473 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRG-202ENST00000468576 KCNH2Q12809 1159 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRG-202ENST00000468576 DIXDC1Q155Q3 683 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRG-202ENST00000468576 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
PTPRG-202ENST00000468576 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRG-202ENST00000468576 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-202ENST00000468576 CFAP99D6REC4 459 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-202ENST00000468576 ALDH1A1P00352 501 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-202ENST00000468576 PDE4DQ08499 809 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-202ENST00000468576 EHBP1Q8NDI1 1231 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRG-202ENST00000468576 HRCP23327 699 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-202ENST00000468576 LINC01559Q495D7 138 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-202ENST00000468576 BAP1Q92560 729 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-202ENST00000468576 SLC24A3Q9HC58 644 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRG-202ENST00000468576 LYPD8Q6UX82 237 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRG-202ENST00000468576 RIC3Q7Z5B4 369 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRG-202ENST00000468576 TREML4Q6UXN2 200 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRG-202ENST00000468576 CABLES1Q8TDN4 633 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRG-202ENST00000468576 ZBTB3Q9H5J0 574 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRG-202ENST00000468576 LIMD1Q9UGP4 676 aa12.55□□□□□ -0.4
PTPRG-202ENST00000468576 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
PTPRG-202ENST00000468576 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
PTPRG-202ENST00000468576 MYSM1Q5VVJ2 828 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRG-202ENST00000468576 ZNF511Q8NB15 262 aa12.54□□□□□ -0.4
PTPRG-202ENST00000468576 F12P00748 615 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms