RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468570.1

SGIP1-208, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene SGIP1, Length 324 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-208ENST00000468570 VEGFBP49765 207 aa6.89□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 FUT2Q10981 343 aa6.89□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 TRIM32Q13049 653 aa6.89□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.89□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 H3BM21 787 aa6.88□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 ATP6V1AP38606 617 aa6.88□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 IRF7Q92985 503 aa6.88□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.87□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 OATP04181 439 aa6.86□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 SKOR1P84550 965 aa6.86□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 MSS51Q4VC12 460 aa6.86□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.86□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 MMP16P51512 607 aa6.85□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.85□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.85□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 FECHP22830 423 aa6.84□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 GCGRP47871 477 aa6.84□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 KCNMA1Q12791 1236 aa6.84□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.84□□□□□ -1.31
SGIP1-208ENST00000468570 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SGIP1-208ENST00000468570 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SGIP1-208ENST00000468570 SIAH2O43255 324 aa6.82□□□□□ -1.32
SGIP1-208ENST00000468570 BMP1P13497 986 aa6.82□□□□□ -1.32
SGIP1-208ENST00000468570 RDH13Q8NBN7 331 aa6.82□□□□□ -1.32
SGIP1-208ENST00000468570 FCHSD2O94868 740 aa6.8□□□□□ -1.32
SGIP1-208ENST00000468570 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SGIP1-208ENST00000468570 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SGIP1-208ENST00000468570 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.79□□□□□ -1.32
SGIP1-208ENST00000468570 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SGIP1-208ENST00000468570 ALDH1A1P00352 501 aa6.78□□□□□ -1.32
SGIP1-208ENST00000468570 SEMA3EO15041 775 aa6.77□□□□□ -1.33
SGIP1-208ENST00000468570 VSIG8P0DPA2 414 aa6.77□□□□□ -1.33
SGIP1-208ENST00000468570 WNT7BP56706 349 aa6.77□□□□□ -1.33
SGIP1-208ENST00000468570 ZFP42Q96MM3 310 aa6.77□□□□□ -1.33
SGIP1-208ENST00000468570 PHOX2BQ99453 314 aa6.77□□□□□ -1.33
SGIP1-208ENST00000468570 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.77□□□□□ -1.33
SGIP1-208ENST00000468570 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SGIP1-208ENST00000468570 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SGIP1-208ENST00000468570 HIC1Q14526 733 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-208ENST00000468570 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-208ENST00000468570 HLA-CQ95604 372 aa6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-208ENST00000468570 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
SGIP1-208ENST00000468570 RASSF7Q02833 373 aa6.72□□□□□ -1.33
SGIP1-208ENST00000468570 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.72□□□□□ -1.33
SGIP1-208ENST00000468570 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.71□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 SOBPA7XYQ1 873 aa6.7□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 GDF11O95390 407 aa6.7□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 Q3C1V9 767 aa6.7□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 GPR37O15354 613 aa6.69□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.68□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 SULF1Q8IWU6 871 aa6.68□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.67□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 GNPATO15228 680 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 SH3BP2P78314 561 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 KRT76Q01546 638 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 GUCA2AQ02747 115 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 XP32Q5T750 250 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 ADAMTS8Q9UP79 889 aa6.66□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 CD46P15529 392 aa6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SGIP1-208ENST00000468570 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SGIP1-208ENST00000468570 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SGIP1-208ENST00000468570 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SGIP1-208ENST00000468570 PPFIA3O75145 1194 aa6.63□□□□□ -1.35
SGIP1-208ENST00000468570 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SGIP1-208ENST00000468570 KDM4AO75164 1064 aa6.62□□□□□ -1.35
SGIP1-208ENST00000468570 TIMP2P16035 220 aa6.62□□□□□ -1.35
SGIP1-208ENST00000468570 JUNDP17535 347 aa6.62□□□□□ -1.35
SGIP1-208ENST00000468570 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.62□□□□□ -1.35
SGIP1-208ENST00000468570 MPNDQ8N594 471 aa6.61□□□□□ -1.35
SGIP1-208ENST00000468570 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-208ENST00000468570 NNTQ13423 1086 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-208ENST00000468570 SCARF1Q14162 830 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-208ENST00000468570 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.59□□□□□ -1.35
SGIP1-208ENST00000468570 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 HOXA2O43364 376 aa6.57□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.57□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 ARHGEF15O94989 841 aa6.56□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 LINC01559Q495D7 138 aa6.56□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 BAP1Q92560 729 aa6.56□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.56□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.56□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 IGHA1P01876 353 aa6.55□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 USP46P62068 366 aa6.55□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 WHAMMQ8TF30 809 aa6.55□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.55□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.55□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 MAN1A2O60476 641 aa6.54□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 ADH1CP00326 375 aa6.54□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 IRS1P35568 1242 aa6.54□□□□□ -1.36
SGIP1-208ENST00000468570 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
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