RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 DNAJB2P25686 324 aa7.24□□□□□ -1.25
SHQ1-204ENST00000468347 KANK3Q6NY19 840 aa7.24□□□□□ -1.25
SHQ1-204ENST00000468347 TRIM32Q13049 653 aa7.23□□□□□ -1.25
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.23□□□□□ -1.25
SHQ1-204ENST00000468347 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SHQ1-204ENST00000468347 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SHQ1-204ENST00000468347 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SHQ1-204ENST00000468347 MSTNO14793 375 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 SLC10A3P09131 477 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 ZFP42Q96MM3 310 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.2□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 THAP11Q96EK4 314 aa7.19□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 OSBPP22059 807 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.18□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 ALDH1A1P00352 501 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 KRT76Q01546 638 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-204ENST00000468347 SOBPA7XYQ1 873 aa7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.14□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 SVOPQ8N4V2 548 aa7.13□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.13□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.13□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 RCCD1A6NED2 376 aa7.11□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 PPFIA3O75145 1194 aa7.11□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 ARHGEF15O94989 841 aa7.11□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 MARSP56192 900 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 SKOR1P84550 965 aa7.11□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 MORN1Q5T089 497 aa7.11□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 PROCP04070 461 aa7.1□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 ITGB2P05107 769 aa7.09□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 WNT7BP56706 349 aa7.09□□□□□ -1.27
SHQ1-204ENST00000468347 MSS51Q4VC12 460 aa7.08□□□□□ -1.28
SHQ1-204ENST00000468347 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
SHQ1-204ENST00000468347 SCARF1Q14162 830 aa7.07□□□□□ -1.28
SHQ1-204ENST00000468347 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
SHQ1-204ENST00000468347 GALNT6Q8NCL4 622 aa7.07□□□□□ -1.28
SHQ1-204ENST00000468347 WHAMMQ8TF30 809 aa7.07□□□□□ -1.28
SHQ1-204ENST00000468347 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
SHQ1-204ENST00000468347 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.07□□□□□ -1.28
SHQ1-204ENST00000468347 FECHP22830 423 aa7.06□□□□□ -1.28
SHQ1-204ENST00000468347 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
SHQ1-204ENST00000468347 SIAH2O43255 324 aa7.05□□□□□ -1.28
SHQ1-204ENST00000468347 BRICD5Q6PL45 260 aa7.05□□□□□ -1.28
SHQ1-204ENST00000468347 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.05□□□□□ -1.28
SHQ1-204ENST00000468347 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.05□□□□□ -1.28
SHQ1-204ENST00000468347 DCAF5Q96JK2 942 aa7.04□□□□□ -1.28
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SHQ1-204ENST00000468347 MMP16P51512 607 aa7.02□□□□□ -1.29
SHQ1-204ENST00000468347 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.02□□□□□ -1.29
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.02□□□□□ -1.29
SHQ1-204ENST00000468347 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
SHQ1-204ENST00000468347 MAN1A2O60476 641 aa7.01□□□□□ -1.29
SHQ1-204ENST00000468347 FUT2Q10981 343 aa7.01□□□□□ -1.29
SHQ1-204ENST00000468347 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SHQ1-204ENST00000468347 ATP6V1AP38606 617 aa7□□□□□ -1.29
SHQ1-204ENST00000468347 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.99□□□□□ -1.29
SHQ1-204ENST00000468347 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.99□□□□□ -1.29
SHQ1-204ENST00000468347 FAM161AQ3B820 660 aa6.97□□□□□ -1.29
SHQ1-204ENST00000468347 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.97□□□□□ -1.29
SHQ1-204ENST00000468347 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SHQ1-204ENST00000468347 BAG6P46379 1132 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-204ENST00000468347 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-204ENST00000468347 FURINP09958 794 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-204ENST00000468347 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-204ENST00000468347 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-204ENST00000468347 TIMP2P16035 220 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-204ENST00000468347 PTGDRQ13258 359 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-204ENST00000468347 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-204ENST00000468347 LCE1DQ5T752 114 aa6.91□□□□□ -1.3
SHQ1-204ENST00000468347 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.9□□□□□ -1.3
SHQ1-204ENST00000468347 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.9□□□□□ -1.3
SHQ1-204ENST00000468347 ADH1CP00326 375 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 NNTQ13423 1086 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 RDH13Q8NBN7 331 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 MAP3K10Q02779 954 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.87□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 Q3C1V9 767 aa6.86□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 ADAMTS2O95450 1211 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 GCGRP47871 477 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 E2F4Q16254 413 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SHQ1-204ENST00000468347 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
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