RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466252.5

SNX21-208, Transcript of sorting nexin family member 21, human

TSL 3

Gene SNX21, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX21-208	ENST00000466252	PRAM1	Q96QH2	718 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SNX21-208	ENST00000466252	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SNX21-208	ENST00000466252	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
SNX21-208	ENST00000466252	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SNX21-208	ENST00000466252	POGK	Q9P215	609 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SNX21-208	ENST00000466252	MST1R	Q04912	1400 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SNX21-208	ENST00000466252	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.95	■■■□□ 2.87
SNX21-208	ENST00000466252	HSPA1L	P34931	641 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SNX21-208	ENST00000466252	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	32.91	■■■□□ 2.86
SNX21-208	ENST00000466252	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.9	■■■□□ 2.86
SNX21-208	ENST00000466252	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SNX21-208	ENST00000466252	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
SNX21-208	ENST00000466252	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SNX21-208	ENST00000466252	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SNX21-208	ENST00000466252	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SNX21-208	ENST00000466252	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
SNX21-208	ENST00000466252	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SNX21-208	ENST00000466252	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SNX21-208	ENST00000466252	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
SNX21-208	ENST00000466252	NUTM2F	A1L443	756 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SNX21-208	ENST00000466252	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		32.8	■■■□□ 2.84
SNX21-208	ENST00000466252	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
SNX21-208	ENST00000466252	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SNX21-208	ENST00000466252	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
SNX21-208	ENST00000466252	ADGRB2	O60241	1585 aa		32.78	■■■□□ 2.84
SNX21-208	ENST00000466252	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.75	■■■□□ 2.83
SNX21-208	ENST00000466252	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
SNX21-208	ENST00000466252	CDK19	Q9BWU1	502 aa		32.72	■■■□□ 2.83
SNX21-208	ENST00000466252	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
SNX21-208	ENST00000466252	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
SNX21-208	ENST00000466252	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SNX21-208	ENST00000466252	PHLPP1	O60346	1717 aa		32.68	■■■□□ 2.82
SNX21-208	ENST00000466252	USP32	Q8NFA0	1604 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SNX21-208	ENST00000466252	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SNX21-208	ENST00000466252	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		32.66	■■■□□ 2.82
SNX21-208	ENST00000466252	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
SNX21-208	ENST00000466252	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		32.65	■■■□□ 2.82
SNX21-208	ENST00000466252	FOXO3	O43524	673 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SNX21-208	ENST00000466252	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
SNX21-208	ENST00000466252	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SNX21-208	ENST00000466252	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
SNX21-208	ENST00000466252	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SNX21-208	ENST00000466252	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SNX21-208	ENST00000466252	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SNX21-208	ENST00000466252	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SNX21-208	ENST00000466252	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
SNX21-208	ENST00000466252	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SNX21-208	ENST00000466252	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SNX21-208	ENST00000466252	CABP2	Q9NPB3	220 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SNX21-208	ENST00000466252	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SNX21-208	ENST00000466252	EVC2	Q86UK5	1308 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SNX21-208	ENST00000466252	ATP7B	P35670	1465 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SNX21-208	ENST00000466252	TESK2	Q96S53	571 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SNX21-208	ENST00000466252	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
SNX21-208	ENST00000466252	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SNX21-208	ENST00000466252	KIF1A	Q12756	1690 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SNX21-208	ENST00000466252	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SNX21-208	ENST00000466252	PXDN	Q92626	1479 aa		32.52	■■■□□ 2.8
SNX21-208	ENST00000466252	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		32.51	■■■□□ 2.79
SNX21-208	ENST00000466252	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
SNX21-208	ENST00000466252	USP47	Q96K76	1375 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SNX21-208	ENST00000466252	PSME1	Q06323	249 aa		32.48	■■■□□ 2.79
SNX21-208	ENST00000466252	SLC24A1	O60721	1099 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SNX21-208	ENST00000466252	ITSN1	Q15811	1721 aa		32.45	■■■□□ 2.78
SNX21-208	ENST00000466252	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
SNX21-208	ENST00000466252	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	32.44	■■■□□ 2.78
SNX21-208	ENST00000466252	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SNX21-208	ENST00000466252	CABP1	Q9NZU7	370 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SNX21-208	ENST00000466252	SHPRH	Q149N8	1683 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SNX21-208	ENST00000466252	ACE	P12821	1306 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SNX21-208	ENST00000466252	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SNX21-208	ENST00000466252	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
SNX21-208	ENST00000466252	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SNX21-208	ENST00000466252	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SNX21-208	ENST00000466252	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		32.4	■■■□□ 2.78
SNX21-208	ENST00000466252	SBNO1	A3KN83	1393 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SNX21-208	ENST00000466252	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.36	■■■□□ 2.77
SNX21-208	ENST00000466252	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		32.35	■■■□□ 2.77
SNX21-208	ENST00000466252	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.33	■■■□□ 2.77
SNX21-208	ENST00000466252	TMF1	P82094	1093 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SNX21-208	ENST00000466252	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.77
SNX21-208	ENST00000466252	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
SNX21-208	ENST00000466252	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SNX21-208	ENST00000466252	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
SNX21-208	ENST00000466252	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SNX21-208	ENST00000466252	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
SNX21-208	ENST00000466252	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
SNX21-208	ENST00000466252	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
SNX21-208	ENST00000466252	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SNX21-208	ENST00000466252	LRP6	O75581	1613 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SNX21-208	ENST00000466252	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
SNX21-208	ENST00000466252	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
SNX21-208	ENST00000466252	ALS2	Q96Q42	1657 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SNX21-208	ENST00000466252	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
SNX21-208	ENST00000466252	ARHGEF10	O15013	1369 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SNX21-208	ENST00000466252	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
SNX21-208	ENST00000466252	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SNX21-208	ENST00000466252	SSH2	Q76I76	1423 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SNX21-208	ENST00000466252	TMC1	Q8TDI8	760 aa		32.22	■■■□□ 2.75
SNX21-208	ENST00000466252	USP6	P35125	1406 aa		32.21	■■■□□ 2.75

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