RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465306.1

TNS1-213, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 393 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-213ENST00000465306 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
TNS1-213ENST00000465306 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
TNS1-213ENST00000465306 SHPRHQ149N8 1683 aa15.42■□□□□ 0.06
TNS1-213ENST00000465306 ADAMTS2O95450 1211 aa15.42■□□□□ 0.06
TNS1-213ENST00000465306 NPHP3Q7Z494 1330 aa15.41■□□□□ 0.06
TNS1-213ENST00000465306 FOXO3O43524 673 aa15.4■□□□□ 0.06
TNS1-213ENST00000465306 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
TNS1-213ENST00000465306 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.06
TNS1-213ENST00000465306 TECPR2O15040 1411 aa15.39■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 PIK3C2GO75747 1445 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 NUTM2FA1L443 756 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 CFAP70Q5T0N1 1121 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 NHSL1Q5SYE7 1610 aa15.38■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 NALCNQ8IZF0 1738 aa15.37■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 PPLO60437 1756 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 HRCP23327 699 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 USP21Q9UK80 565 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa15.36■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
TNS1-213ENST00000465306 STAC3Q96MF2 364 aa15.33■□□□□ 0.04
TNS1-213ENST00000465306 LAMC1P11047 1609 aa15.32■□□□□ 0.04
TNS1-213ENST00000465306 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.32■□□□□ 0.04
TNS1-213ENST00000465306 PRAM1Q96QH2 718 aa15.32■□□□□ 0.04
TNS1-213ENST00000465306 POGKQ9P215 609 aa15.32■□□□□ 0.04
TNS1-213ENST00000465306 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa15.32■□□□□ 0.04
TNS1-213ENST00000465306 PSME1Q06323 249 aa15.31■□□□□ 0.04
TNS1-213ENST00000465306 NRXN1Q9ULB1 1477 aa15.31■□□□□ 0.04
TNS1-213ENST00000465306 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.3■□□□□ 0.04
TNS1-213ENST00000465306 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.3■□□□□ 0.04
TNS1-213ENST00000465306 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.3■□□□□ 0.04
TNS1-213ENST00000465306 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.3■□□□□ 0.04
TNS1-213ENST00000465306 PXDNQ92626 1479 aa15.29■□□□□ 0.04
TNS1-213ENST00000465306 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP15.29■□□□□ 0.04
TNS1-213ENST00000465306 MYOM2P54296 1465 aa15.28■□□□□ 0.04
TNS1-213ENST00000465306 RGS12O14924 1447 aa15.26■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 TRAK1Q9UPV9 953 aa15.26■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 ATRNO75882 1429 aa15.25■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 UNC5CLQ8IV45 518 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 BCL9LQ86UU0 1499 aa15.24■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 IFT172Q9UG01 1749 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.23■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 LMOD2Q6P5Q4 547 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 SBNO1A3KN83 1393 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.22■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 WASLO00401 505 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.21■□□□□ 0.03
TNS1-213ENST00000465306 KNDC1Q76NI1 1749 aa15.2■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.2■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 CCDC125Q86Z20 511 aa15.2■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 DLC1Q96QB1 1528 aa15.2■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 ARHGEF10O15013 1369 aa15.19■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.18■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 ADGRB1O14514 1584 aa15.17■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.17■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 FAM83GA6ND36 823 aa15.17■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 PLEKHG5O94827 1062 aa15.17■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 FMN2Q9NZ56 1722 aa15.17■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 SLIT2O94813 1529 aa15.17■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 VPS72Q15906 364 aa15.16■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.16■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 KIF1AQ12756 1690 aa15.15■□□□□ 0.02
TNS1-213ENST00000465306 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TNS1-213ENST00000465306 SEPT12Q8IYM1 358 aa15.13■□□□□ 0.01
TNS1-213ENST00000465306 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
TNS1-213ENST00000465306 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.13■□□□□ 0.01
TNS1-213ENST00000465306 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
TNS1-213ENST00000465306 CDK19Q9BWU1 502 aa15.12■□□□□ 0.01
TNS1-213ENST00000465306 BTG4Q9NY30 223 aa15.1■□□□□ 0.01
TNS1-213ENST00000465306 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.1■□□□□ 0.01
TNS1-213ENST00000465306 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.1■□□□□ 0.01
TNS1-213ENST00000465306 ADGRB2O60241 1585 aa15.1■□□□□ 0.01
TNS1-213ENST00000465306 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa15.09■□□□□ 0.01
TNS1-213ENST00000465306 NBPF1Q3BBV0 1214 aa15.09■□□□□ 0.01
TNS1-213ENST00000465306 TULP4Q9NRJ4 1543 aa15.08■□□□□ 0.01
TNS1-213ENST00000465306 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.08■□□□□ 0
TNS1-213ENST00000465306 NBPF8Q3BBV2 869 aa15.08■□□□□ 0
TNS1-213ENST00000465306 KRT27Q7Z3Y8 459 aa15.07■□□□□ 0
TNS1-213ENST00000465306 EP400Q96L91 3159 aa15.07■□□□□ 0
TNS1-213ENST00000465306 USP32Q8NFA0 1604 aa15.06■□□□□ 0
TNS1-213ENST00000465306 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
TNS1-213ENST00000465306 PRDM11Q9NQV5 511 aa15.05■□□□□ -0
TNS1-213ENST00000465306 ACEP12821 1306 aa15.05■□□□□ -0
TNS1-213ENST00000465306 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
TNS1-213ENST00000465306 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
TNS1-213ENST00000465306 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms