RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 EVC2Q86UK5 1308 aa13.11□□□□□ -0.31
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SH3BP4-208ENST00000462602 C14orf37Q86TY3 774 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-208ENST00000462602 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP4-208ENST00000462602 WASLO00401 505 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-208ENST00000462602 QRICH2Q9H0J4 1663 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM94Q12767 1356 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP4-208ENST00000462602 CDK19Q9BWU1 502 aa13.06□□□□□ -0.32
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SH3BP4-208ENST00000462602 DISP3Q9P2K9 1392 aa13.05□□□□□ -0.32
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SH3BP4-208ENST00000462602 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.04□□□□□ -0.32
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SH3BP4-208ENST00000462602 LTBP4Q8N2S1 1624 aa13.01□□□□□ -0.33
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SH3BP4-208ENST00000462602 TERF2IPQ9NYB0 399 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP7BP35670 1465 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP4-208ENST00000462602 FMN2Q9NZ56 1722 aa12.94□□□□□ -0.34
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SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf167Q5SNV9 1468 aa12.93□□□□□ -0.34
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SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa12.92□□□□□ -0.34
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SH3BP4-208ENST00000462602 USP6P35125 1406 aa12.84□□□□□ -0.35
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SH3BP4-208ENST00000462602 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC21AQ8NDW8 1320 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP12.82□□□□□ -0.366e-9■■■□□ 16.8
SH3BP4-208ENST00000462602 SSH2Q76I76 1423 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 ANP32CO43423 234 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 PIP4K2BP78356 416 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP4-208ENST00000462602 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
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