RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 GGT6Q6P531 493 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 INSRP06213 1382 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 TULP4Q9NRJ4 1543 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRC-210ENST00000462363 A2ML1A8K2U0 1454 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 PTPRMP28827 1452 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 TMF1P82094 1093 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 IDI1Q13907 227 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 RALBP1Q15311 655 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 ZBED9Q6R2W3 1325 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 ALKQ9UM73 1620 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 MRS2Q9HD23 443 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 DLC1Q96QB1 1528 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 CREBZFQ9NS37 354 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 KNDC1Q76NI1 1749 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 SLC24A1O60721 1099 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 CDCA8Q53HL2 280 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 NLRP13Q86W25 1043 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 PANK3Q9H999 370 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 ZRANB1Q9UGI0 708 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
PTPRC-210ENST00000462363 C3P01024 1663 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 VGFO15240 615 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 CLCN6P51797 869 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 SHPRHQ149N8 1683 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 TECPR2O15040 1411 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 CPS1P31327 1500 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 MMRN1Q13201 1228 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 CARD14Q9BXL6 1004 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 ZMYM3Q14202 1370 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 MED14O60244 1454 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
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PTPRC-210ENST00000462363 NLRP1Q9C000 1473 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP23Q9P227 1491 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 SLIT1O75093 1534 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRB2O60241 1585 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 CHGAP10645 457 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 PPP2R1AP30153 589 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 TMC1Q8TDI8 760 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 STAG3Q9UJ98 1225 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 TNRQ92752 1358 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 ABCC11Q96J66 1382 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-210ENST00000462363 KIF20BQ96Q89 1820 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 NSD3Q9BZ95 1437 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 POTEB2H3BUK9 544 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 KNSTRNQ9Y448 316 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 AKAP12Q02952 1782 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 MON2Q7Z3U7 1717 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 ADAMTSL3P82987 1691 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 NSD2O96028 1365 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF521Q96K83 1311 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 PHF12Q96QT6 1004 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 ATP7BP35670 1465 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 METP08581 1390 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 EVC2Q86UK5 1308 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-210ENST00000462363 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
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