RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462351.5

PTPRN-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 5,099 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRN-211ENST00000462351 TSPY26PQ9H489 355 aa17.36■□□□□ 0.37
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PTPRN-211ENST00000462351 AAMPQ13685 434 aa17.33■□□□□ 0.36
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PTPRN-211ENST00000462351 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
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PTPRN-211ENST00000462351 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
PTPRN-211ENST00000462351 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
PTPRN-211ENST00000462351 DAPK1P53355 1430 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRN-211ENST00000462351 GOLGA6L10A6NI86 522 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRN-211ENST00000462351 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.36
PTPRN-211ENST00000462351 GIMAP7Q8NHV1 300 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRN-211ENST00000462351 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
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