RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.45■■■□□ 2.47
SIKE1-204ENST00000462123 ORAI2Q96SN7 254 aa30.44■■■□□ 2.46
SIKE1-204ENST00000462123 LAMC1P11047 1609 aa30.44■■■□□ 2.46
SIKE1-204ENST00000462123 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
SIKE1-204ENST00000462123 NHSL1Q5SYE7 1610 aa30.41■■■□□ 2.46
SIKE1-204ENST00000462123 KNDC1Q76NI1 1749 aa30.41■■■□□ 2.46
SIKE1-204ENST00000462123 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.4■■■□□ 2.46
SIKE1-204ENST00000462123 SHPRHQ149N8 1683 aa30.39■■■□□ 2.46
SIKE1-204ENST00000462123 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.38■■■□□ 2.45
SIKE1-204ENST00000462123 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.37■■■□□ 2.45
SIKE1-204ENST00000462123 NPHP3Q7Z494 1330 aa30.37■■■□□ 2.45
SIKE1-204ENST00000462123 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
SIKE1-204ENST00000462123 DLC1Q96QB1 1528 aa30.36■■■□□ 2.45
SIKE1-204ENST00000462123 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
SIKE1-204ENST00000462123 POTEAQ6S8J7 498 aa30.35■■■□□ 2.45
SIKE1-204ENST00000462123 LRP6O75581 1613 aa30.35■■■□□ 2.45
SIKE1-204ENST00000462123 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.34■■■□□ 2.45
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
SIKE1-204ENST00000462123 PRAM1Q96QH2 718 aa30.34■■■□□ 2.45
SIKE1-204ENST00000462123 ADGRB1O14514 1584 aa30.33■■■□□ 2.45
SIKE1-204ENST00000462123 POGKQ9P215 609 aa30.31■■■□□ 2.44
SIKE1-204ENST00000462123 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
SIKE1-204ENST00000462123 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
SIKE1-204ENST00000462123 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
SIKE1-204ENST00000462123 FOXO3O43524 673 aa30.26■■■□□ 2.43
SIKE1-204ENST00000462123 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.26■■■□□ 2.43
SIKE1-204ENST00000462123 NUTM2FA1L443 756 aa30.23■■■□□ 2.43
SIKE1-204ENST00000462123 PXDNQ92626 1479 aa30.21■■■□□ 2.43
SIKE1-204ENST00000462123 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.21■■■□□ 2.43
SIKE1-204ENST00000462123 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
SIKE1-204ENST00000462123 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.2■■■□□ 2.43
SIKE1-204ENST00000462123 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.19■■■□□ 2.42
SIKE1-204ENST00000462123 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.18■■■□□ 2.42
SIKE1-204ENST00000462123 AFF2P51816 1311 aa30.16■■■□□ 2.42
SIKE1-204ENST00000462123 ADGRB2O60241 1585 aa30.15■■■□□ 2.42
SIKE1-204ENST00000462123 PSME1Q06323 249 aa30.15■■■□□ 2.42
SIKE1-204ENST00000462123 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
SIKE1-204ENST00000462123 KRT28Q7Z3Y7 464 aa30.14■■■□□ 2.42
SIKE1-204ENST00000462123 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa30.14■■■□□ 2.42
SIKE1-204ENST00000462123 KIF1AQ12756 1690 aa30.13■■■□□ 2.41
SIKE1-204ENST00000462123 C8orf37Q96NL8 207 aa30.12■■■□□ 2.41
SIKE1-204ENST00000462123 RXRBP28702 533 aa30.11■■■□□ 2.41
SIKE1-204ENST00000462123 NGLY1Q96IV0 654 aa30.11■■■□□ 2.41
SIKE1-204ENST00000462123 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
SIKE1-204ENST00000462123 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
SIKE1-204ENST00000462123 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
SIKE1-204ENST00000462123 SBNO1A3KN83 1393 aa30.09■■■□□ 2.41
SIKE1-204ENST00000462123 ADAMTS2O95450 1211 aa30.09■■■□□ 2.41
SIKE1-204ENST00000462123 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
SIKE1-204ENST00000462123 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.09■■■□□ 2.41
SIKE1-204ENST00000462123 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
SIKE1-204ENST00000462123 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.07■■■□□ 2.4
SIKE1-204ENST00000462123 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
SIKE1-204ENST00000462123 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
SIKE1-204ENST00000462123 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
SIKE1-204ENST00000462123 NBPF1Q3BBV0 1214 aa30.04■■■□□ 2.4
SIKE1-204ENST00000462123 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.04■■■□□ 2.4
SIKE1-204ENST00000462123 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.04■■■□□ 2.4
SIKE1-204ENST00000462123 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
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SIKE1-204ENST00000462123 TNS3Q68CZ2 1445 aa30.02■■■□□ 2.4
SIKE1-204ENST00000462123 ARHGEF10O15013 1369 aa30.02■■■□□ 2.4
SIKE1-204ENST00000462123 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa30■■■□□ 2.39
SIKE1-204ENST00000462123 USP21Q9UK80 565 aa30■■■□□ 2.39
SIKE1-204ENST00000462123 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.99■■■□□ 2.39
SIKE1-204ENST00000462123 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SIKE1-204ENST00000462123 NEUROD1Q13562 356 aa29.97■■■□□ 2.39
SIKE1-204ENST00000462123 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
SIKE1-204ENST00000462123 USP32Q8NFA0 1604 aa29.96■■■□□ 2.39
SIKE1-204ENST00000462123 CDK19Q9BWU1 502 aa29.96■■■□□ 2.39
SIKE1-204ENST00000462123 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
SIKE1-204ENST00000462123 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
SIKE1-204ENST00000462123 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.94■■■□□ 2.38
SIKE1-204ENST00000462123 ATP7BP35670 1465 aa29.91■■■□□ 2.38
SIKE1-204ENST00000462123 ATRNO75882 1429 aa29.89■■■□□ 2.38
SIKE1-204ENST00000462123 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.89■■■□□ 2.38
SIKE1-204ENST00000462123 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.89■■■□□ 2.38
SIKE1-204ENST00000462123 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
SIKE1-204ENST00000462123 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.88■■■□□ 2.37
SIKE1-204ENST00000462123 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
SIKE1-204ENST00000462123 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.86■■■□□ 2.37
SIKE1-204ENST00000462123 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
SIKE1-204ENST00000462123 SLIT2O94813 1529 aa29.85■■■□□ 2.37
SIKE1-204ENST00000462123 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
SIKE1-204ENST00000462123 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.83■■■□□ 2.37
SIKE1-204ENST00000462123 RGS12O14924 1447 aa29.81■■■□□ 2.36
SIKE1-204ENST00000462123 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.81■■■□□ 2.36
SIKE1-204ENST00000462123 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
SIKE1-204ENST00000462123 ACEP12821 1306 aa29.8■■■□□ 2.36
SIKE1-204ENST00000462123 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
SIKE1-204ENST00000462123 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.8■■■□□ 2.36
SIKE1-204ENST00000462123 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
SIKE1-204ENST00000462123 TONSLQ96HA7 1378 aa29.78■■■□□ 2.36
SIKE1-204ENST00000462123 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
SIKE1-204ENST00000462123 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.77■■■□□ 2.36
SIKE1-204ENST00000462123 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.77■■■□□ 2.36
SIKE1-204ENST00000462123 EVC2Q86UK5 1308 aa29.76■■■□□ 2.36
SIKE1-204ENST00000462123 ITSN1Q15811 1721 aa29.76■■■□□ 2.35
SIKE1-204ENST00000462123 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
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