RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 SERINC4A6NH21 518 aa-0.59□□□□□ -2.5
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SNORD54-201ENST00000459159 AXIN2Q9Y2T1 843 aa-0.59□□□□□ -2.5
SNORD54-201ENST00000459159 NOTCH4Q99466 2003 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD54-201ENST00000459159 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa-0.6□□□□□ -2.51
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SNORD54-201ENST00000459159 KRT2P35908 639 aa-0.6□□□□□ -2.51
SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP10-2P60368 255 aa-0.6□□□□□ -2.51
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SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa-0.66□□□□□ -2.52
SNORD54-201ENST00000459159 NKX2-3Q8TAU0 364 aa-0.66□□□□□ -2.52
SNORD54-201ENST00000459159 TSG101Q99816 390 aa-0.66□□□□□ -2.52
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SNORD54-201ENST00000459159 CSPG4Q6UVK1 2322 aa-0.66□□□□□ -2.52
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SNORD54-201ENST00000459159 KRTAP10-11P60412 298 aa-0.67□□□□□ -2.52
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SNORD54-201ENST00000459159 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
SNORD54-201ENST00000459159 PRR13Q9NZ81 148 aa-0.67□□□□□ -2.52
SNORD54-201ENST00000459159 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.67□□□□□ -2.52
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SNORD54-201ENST00000459159 WIPF1O43516 503 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD54-201ENST00000459159 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD54-201ENST00000459159 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD54-201ENST00000459159 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
SNORD54-201ENST00000459159 CAMKK2Q96RR4 588 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD54-201ENST00000459159 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD54-201ENST00000459159 DNAH8Q96JB1 4490 aa-0.68□□□□□ -2.52
SNORD54-201ENST00000459159 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.68□□□□□ -2.52
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