RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454996.5

TTC28-AS1-220, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 837 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PNPLA6Q8IY17 1366 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PIK3C2GO75747 1445 aa11.35□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FOXO3O43524 673 aa11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-220ENST00000454996 C8orf37Q96NL8 207 aa11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-220ENST00000454996 AFF2P51816 1311 aa11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.33□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ABCC11Q96J66 1382 aa11.32□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.32□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-220ENST00000454996 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RXRBP28702 533 aa11.31□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TECPR2O15040 1411 aa11.3□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-220ENST00000454996 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NRXN1Q9ULB1 1477 aa11.3□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LAMC1P11047 1609 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DCAF11Q8TEB1 546 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NGLY1Q96IV0 654 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRAM1Q96QH2 718 aa11.29□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PXDNQ92626 1479 aa11.28□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PLEKHG5O94827 1062 aa11.27□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SIRT1Q96EB6 747 aa11.27□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.27□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa11.27□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KNDC1Q76NI1 1749 aa11.26□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MYOM2P54296 1465 aa11.25□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KRT28Q7Z3Y7 464 aa11.25□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CABLES1Q8TDN4 633 aa11.25□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 USP21Q9UK80 565 aa11.25□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NPHP3Q7Z494 1330 aa11.25□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FMN2Q9NZ56 1722 aa11.24□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HRCP23327 699 aa11.24□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa11.24□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 POGKQ9P215 609 aa11.24□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ADGRB1O14514 1584 aa11.24□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RGS12O14924 1447 aa11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PRR36Q9H6K5 1346 aa11.22□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 USP32Q8NFA0 1604 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NBPF1Q3BBV0 1214 aa11.21□□□□□ -0.61
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PSME1Q06323 249 aa11.2□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-220ENST00000454996 LMOD2Q6P5Q4 547 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-220ENST00000454996 DLC1Q96QB1 1528 aa11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATRNO75882 1429 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-220ENST00000454996 WASLO00401 505 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SIN3AQ96ST3 1273 aa11.18□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-220ENST00000454996 FAM83GA6ND36 823 aa11.17□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-220ENST00000454996 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-220ENST00000454996 KIF1AQ12756 1690 aa11.16□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-220ENST00000454996 UNC5CLQ8IV45 518 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CDK19Q9BWU1 502 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.15□□□□□ -0.62
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SBNO1A3KN83 1393 aa11.15□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SLIT2O94813 1529 aa11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ADGRB2O60241 1585 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ANKARQ7Z5J8 1434 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NEUROD1Q13562 356 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NUTM2GQ5VZR2 741 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.13□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GLI3P10071 1580 aa11.12□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 STAC3Q96MF2 364 aa11.12□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 RALGAPBQ86X10 1494 aa11.12□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 TULP4Q9NRJ4 1543 aa11.11□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 SEPT12Q8IYM1 358 aa11.1□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CABP2Q9NPB3 220 aa11.1□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 BTG4Q9NY30 223 aa11.1□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ABCA3Q99758 1704 aa11.09□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ALS2Q96Q42 1657 aa11.09□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATP7BP35670 1465 aa11.09□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ARHGEF10O15013 1369 aa11.09□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 GPRASP1Q5JY77 1395 aa11.09□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 VPS72Q15906 364 aa11.09□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 NBPF8Q3BBV2 869 aa11.09□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ACEP12821 1306 aa11.09□□□□□ -0.63
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.08□□□□□ -0.64
TTC28-AS1-220ENST00000454996 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms