RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21■□□□□ 0.95
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYOM1P52179 1685 aa20.98■□□□□ 0.95
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.7■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DCCP43146 1447 aa20.68■□□□□ 0.9
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF20BQ96Q89 1820 aa20.66■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NSD2O96028 1365 aa20.65■□□□□ 0.9
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa20.64■□□□□ 0.9
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ACEP12821 1306 aa20.64■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MSH6P52701 1360 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATF3P18847 181 aa20.63■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 USP6P35125 1406 aa20.6■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.59■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF1AQ12756 1690 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C1orf167Q5SNV9 1468 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MORC1Q86VD1 984 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NLRP13Q86W25 1043 aa20.58■□□□□ 0.89
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FYB1O15117 783 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MST1RQ04912 1400 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
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