RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 POGKQ9P215 609 aa15.76■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM135BQ49AJ0 1406 aa15.76■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa15.76■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 NUTM2FA1L443 756 aa15.75■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.74■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 ATF3P18847 181 aa15.74■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 SIRT1Q96EB6 747 aa15.74■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 SLAIN2Q9P270 581 aa15.74■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 MST1RQ04912 1400 aa15.73■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa15.72■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.71■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.71■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.71■□□□□ 0.11
RPRD1B-202ENST00000449186 HSPA1LP34931 641 aa15.7■□□□□ 0.1
RPRD1B-202ENST00000449186 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
RPRD1B-202ENST00000449186 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa15.7■□□□□ 0.1
RPRD1B-202ENST00000449186 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
RPRD1B-202ENST00000449186 DCCP43146 1447 aa15.69■□□□□ 0.1
RPRD1B-202ENST00000449186 FMN2Q9NZ56 1722 aa15.69■□□□□ 0.1
RPRD1B-202ENST00000449186 ORAI2Q96SN7 254 aa15.69■□□□□ 0.1
RPRD1B-202ENST00000449186 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.69■□□□□ 0.1
RPRD1B-202ENST00000449186 QRICH2Q9H0J4 1663 aa15.69■□□□□ 0.1
RPRD1B-202ENST00000449186 C1orf167Q5SNV9 1468 aa15.68■□□□□ 0.1
RPRD1B-202ENST00000449186 BRINP3Q76B58 766 aa15.68■□□□□ 0.1
RPRD1B-202ENST00000449186 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
RPRD1B-202ENST00000449186 USP32Q8NFA0 1604 aa15.67■□□□□ 0.1
RPRD1B-202ENST00000449186 ADGRB2O60241 1585 aa15.66■□□□□ 0.1
RPRD1B-202ENST00000449186 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.66■□□□□ 0.1
RPRD1B-202ENST00000449186 WASLO00401 505 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
RPRD1B-202ENST00000449186 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.63■□□□□ 0.09
RPRD1B-202ENST00000449186 CDK19Q9BWU1 502 aa15.63■□□□□ 0.09
RPRD1B-202ENST00000449186 TULP4Q9NRJ4 1543 aa15.63■□□□□ 0.09
RPRD1B-202ENST00000449186 PHLPP1O60346 1717 aa15.61■□□□□ 0.09
RPRD1B-202ENST00000449186 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.61■□□□□ 0.09
RPRD1B-202ENST00000449186 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
RPRD1B-202ENST00000449186 CABP2Q9NPB3 220 aa15.61■□□□□ 0.09
RPRD1B-202ENST00000449186 USP47Q96K76 1375 aa15.61■□□□□ 0.09
RPRD1B-202ENST00000449186 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa15.6■□□□□ 0.09
RPRD1B-202ENST00000449186 NHSL1Q5SYE7 1610 aa15.59■□□□□ 0.09
RPRD1B-202ENST00000449186 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
RPRD1B-202ENST00000449186 ATP7BP35670 1465 aa15.59■□□□□ 0.09
RPRD1B-202ENST00000449186 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
RPRD1B-202ENST00000449186 FOXO3O43524 673 aa15.58■□□□□ 0.08
RPRD1B-202ENST00000449186 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RPRD1B-202ENST00000449186 TESK2Q96S53 571 aa15.58■□□□□ 0.08
RPRD1B-202ENST00000449186 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
RPRD1B-202ENST00000449186 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
RPRD1B-202ENST00000449186 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.56■□□□□ 0.08
RPRD1B-202ENST00000449186 ANKARQ7Z5J8 1434 aa15.55■□□□□ 0.08
RPRD1B-202ENST00000449186 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa15.54■□□□□ 0.08
RPRD1B-202ENST00000449186 DISP3Q9P2K9 1392 aa15.53■□□□□ 0.08
RPRD1B-202ENST00000449186 EVC2Q86UK5 1308 aa15.53■□□□□ 0.08
RPRD1B-202ENST00000449186 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
RPRD1B-202ENST00000449186 PXDNQ92626 1479 aa15.52■□□□□ 0.08
RPRD1B-202ENST00000449186 KIF1AQ12756 1690 aa15.52■□□□□ 0.08
RPRD1B-202ENST00000449186 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa15.51■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 CABP1Q9NZU7 370 aa15.51■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 ITSN1Q15811 1721 aa15.51■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa15.51■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.5■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.5■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 PLEKHG5O94827 1062 aa15.49■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 ACEP12821 1306 aa15.48■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 NPHP3Q7Z494 1330 aa15.48■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 PSME1Q06323 249 aa15.48■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.47■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa15.46■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 PNPLA6Q8IY17 1366 aa15.46■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 JCADQ9P266 1359 aa15.46■□□□□ 0.07
RPRD1B-202ENST00000449186 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 TMC1Q8TDI8 760 aa15.45■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 LRP6O75581 1613 aa15.45■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 SHPRHQ149N8 1683 aa15.44■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa15.44■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 TMF1P82094 1093 aa15.44■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 LMOD2Q6P5Q4 547 aa15.44■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 CD163L1Q9NR16 1453 aa15.44■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 NUTM2GQ5VZR2 741 aa15.43■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 CABLES1Q8TDN4 633 aa15.43■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.43■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 ATAD2Q6PL18 1390 aa15.43■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 TNS3Q68CZ2 1445 aa15.42■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 AKAP12Q02952 1782 aa15.41■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 ALS2Q96Q42 1657 aa15.41■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 SBNO1A3KN83 1393 aa15.4■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 MYOM1P52179 1685 aa15.4■□□□□ 0.06
RPRD1B-202ENST00000449186 USP6P35125 1406 aa15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms