RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445150.3

SRP19-202, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP19, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-202ENST00000445150 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SRP19-202ENST00000445150 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SRP19-202ENST00000445150 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.03■■□□□ 1.6
SRP19-202ENST00000445150 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SRP19-202ENST00000445150 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25■■□□□ 1.59
SRP19-202ENST00000445150 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.98■■□□□ 1.59
SRP19-202ENST00000445150 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.98■■□□□ 1.59
SRP19-202ENST00000445150 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SRP19-202ENST00000445150 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.97■■□□□ 1.59
SRP19-202ENST00000445150 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.97■■□□□ 1.59
SRP19-202ENST00000445150 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.96■■□□□ 1.59
SRP19-202ENST00000445150 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.95■■□□□ 1.58
SRP19-202ENST00000445150 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SRP19-202ENST00000445150 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.94■■□□□ 1.58
SRP19-202ENST00000445150 MST1RQ04912 1400 aa24.94■■□□□ 1.58
SRP19-202ENST00000445150 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
SRP19-202ENST00000445150 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.9■■□□□ 1.58
SRP19-202ENST00000445150 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
SRP19-202ENST00000445150 BRINP3Q76B58 766 aa24.89■■□□□ 1.58
SRP19-202ENST00000445150 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
SRP19-202ENST00000445150 SLC24A1O60721 1099 aa24.88■■□□□ 1.57
SRP19-202ENST00000445150 HSPA1LP34931 641 aa24.88■■□□□ 1.57
SRP19-202ENST00000445150 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.88■■□□□ 1.57
SRP19-202ENST00000445150 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SRP19-202ENST00000445150 ADGRB2O60241 1585 aa24.86■■□□□ 1.57
SRP19-202ENST00000445150 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.86■■□□□ 1.57
SRP19-202ENST00000445150 NUTM2FA1L443 756 aa24.84■■□□□ 1.57
SRP19-202ENST00000445150 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.83■■□□□ 1.57
SRP19-202ENST00000445150 ORAI2Q96SN7 254 aa24.82■■□□□ 1.56
SRP19-202ENST00000445150 CDK19Q9BWU1 502 aa24.81■■□□□ 1.56
SRP19-202ENST00000445150 EVC2Q86UK5 1308 aa24.81■■□□□ 1.56
SRP19-202ENST00000445150 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.81■■□□□ 1.56
SRP19-202ENST00000445150 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.79■■□□□ 1.56
SRP19-202ENST00000445150 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SRP19-202ENST00000445150 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.78■■□□□ 1.56
SRP19-202ENST00000445150 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.77■■□□□ 1.56
SRP19-202ENST00000445150 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.77■■□□□ 1.56
SRP19-202ENST00000445150 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SRP19-202ENST00000445150 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SRP19-202ENST00000445150 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SRP19-202ENST00000445150 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.75■■□□□ 1.55
SRP19-202ENST00000445150 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.74■■□□□ 1.55
SRP19-202ENST00000445150 PHLPP1O60346 1717 aa24.73■■□□□ 1.55
SRP19-202ENST00000445150 PSME1Q06323 249 aa24.73■■□□□ 1.55
SRP19-202ENST00000445150 USP47Q96K76 1375 aa24.72■■□□□ 1.55
SRP19-202ENST00000445150 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.72■■□□□ 1.55
SRP19-202ENST00000445150 FOXO3O43524 673 aa24.72■■□□□ 1.55
SRP19-202ENST00000445150 KIF1AQ12756 1690 aa24.72■■□□□ 1.55
SRP19-202ENST00000445150 JCADQ9P266 1359 aa24.71■■□□□ 1.55
SRP19-202ENST00000445150 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.69■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.69■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 CABP2Q9NPB3 220 aa24.69■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.68■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.67■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 ATP7BP35670 1465 aa24.66■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.66■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.66■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 TMF1P82094 1093 aa24.65■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 CDCA8Q53HL2 280 aa24.65■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 USP32Q8NFA0 1604 aa24.64■■□□□ 1.54
SRP19-202ENST00000445150 ITSN1Q15811 1721 aa24.64■■□□□ 1.53
SRP19-202ENST00000445150 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.63■■□□□ 1.53
SRP19-202ENST00000445150 TESK2Q96S53 571 aa24.63■■□□□ 1.53
SRP19-202ENST00000445150 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SRP19-202ENST00000445150 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.61■■□□□ 1.53
SRP19-202ENST00000445150 SBNO1A3KN83 1393 aa24.6■■□□□ 1.53
SRP19-202ENST00000445150 PXDNQ92626 1479 aa24.59■■□□□ 1.53
SRP19-202ENST00000445150 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
SRP19-202ENST00000445150 CABP1Q9NZU7 370 aa24.59■■□□□ 1.53
SRP19-202ENST00000445150 ACEP12821 1306 aa24.59■■□□□ 1.53
SRP19-202ENST00000445150 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SRP19-202ENST00000445150 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SRP19-202ENST00000445150 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.58■■□□□ 1.52
SRP19-202ENST00000445150 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
SRP19-202ENST00000445150 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.55■■□□□ 1.52
SRP19-202ENST00000445150 ARHGEF10O15013 1369 aa24.54■■□□□ 1.52
SRP19-202ENST00000445150 SHPRHQ149N8 1683 aa24.54■■□□□ 1.52
SRP19-202ENST00000445150 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SRP19-202ENST00000445150 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.54■■□□□ 1.52
SRP19-202ENST00000445150 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.53■■□□□ 1.52
SRP19-202ENST00000445150 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SRP19-202ENST00000445150 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.53■■□□□ 1.52
SRP19-202ENST00000445150 TMC1Q8TDI8 760 aa24.53■■□□□ 1.52
SRP19-202ENST00000445150 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.52■■□□□ 1.52
SRP19-202ENST00000445150 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SRP19-202ENST00000445150 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.51■■□□□ 1.51
SRP19-202ENST00000445150 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SRP19-202ENST00000445150 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SRP19-202ENST00000445150 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SRP19-202ENST00000445150 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SRP19-202ENST00000445150 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SRP19-202ENST00000445150 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
SRP19-202ENST00000445150 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.46■■□□□ 1.51
SRP19-202ENST00000445150 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms