RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444999.5

UPP1-209, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene UPP1, Length 869 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-209ENST00000444999 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.44■■□□□ 1.98
UPP1-209ENST00000444999 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.43■■□□□ 1.98
UPP1-209ENST00000444999 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
UPP1-209ENST00000444999 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
UPP1-209ENST00000444999 LAMC1P11047 1609 aa27.41■■□□□ 1.98
UPP1-209ENST00000444999 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.41■■□□□ 1.98
UPP1-209ENST00000444999 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.41■■□□□ 1.98
UPP1-209ENST00000444999 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.41■■□□□ 1.98
UPP1-209ENST00000444999 MYOM2P54296 1465 aa27.4■■□□□ 1.98
UPP1-209ENST00000444999 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.4■■□□□ 1.98
UPP1-209ENST00000444999 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
UPP1-209ENST00000444999 HRCP23327 699 aa27.37■■□□□ 1.97
UPP1-209ENST00000444999 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.37■■□□□ 1.97
UPP1-209ENST00000444999 NUTM2FA1L443 756 aa27.36■■□□□ 1.97
UPP1-209ENST00000444999 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
UPP1-209ENST00000444999 SIRT1Q96EB6 747 aa27.32■■□□□ 1.96
UPP1-209ENST00000444999 AFF2P51816 1311 aa27.32■■□□□ 1.96
UPP1-209ENST00000444999 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
UPP1-209ENST00000444999 C8orf37Q96NL8 207 aa27.3■■□□□ 1.96
UPP1-209ENST00000444999 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.3■■□□□ 1.96
UPP1-209ENST00000444999 FOXO3O43524 673 aa27.29■■□□□ 1.96
UPP1-209ENST00000444999 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.28■■□□□ 1.96
UPP1-209ENST00000444999 ADAMTS2O95450 1211 aa27.28■■□□□ 1.96
UPP1-209ENST00000444999 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
UPP1-209ENST00000444999 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.27■■□□□ 1.96
UPP1-209ENST00000444999 PXDNQ92626 1479 aa27.27■■□□□ 1.96
UPP1-209ENST00000444999 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.27■■□□□ 1.96
UPP1-209ENST00000444999 PRAM1Q96QH2 718 aa27.27■■□□□ 1.96
UPP1-209ENST00000444999 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.26■■□□□ 1.95
UPP1-209ENST00000444999 ADGRB1O14514 1584 aa27.24■■□□□ 1.95
UPP1-209ENST00000444999 RXRBP28702 533 aa27.23■■□□□ 1.95
UPP1-209ENST00000444999 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
UPP1-209ENST00000444999 NGLY1Q96IV0 654 aa27.21■■□□□ 1.95
UPP1-209ENST00000444999 DLC1Q96QB1 1528 aa27.21■■□□□ 1.95
UPP1-209ENST00000444999 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.2■■□□□ 1.94
UPP1-209ENST00000444999 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
UPP1-209ENST00000444999 POGKQ9P215 609 aa27.19■■□□□ 1.94
UPP1-209ENST00000444999 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
UPP1-209ENST00000444999 KIF1AQ12756 1690 aa27.15■■□□□ 1.94
UPP1-209ENST00000444999 STAC3Q96MF2 364 aa27.15■■□□□ 1.94
UPP1-209ENST00000444999 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.14■■□□□ 1.94
UPP1-209ENST00000444999 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.14■■□□□ 1.94
UPP1-209ENST00000444999 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
UPP1-209ENST00000444999 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
UPP1-209ENST00000444999 USP21Q9UK80 565 aa27.12■■□□□ 1.93
UPP1-209ENST00000444999 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.12■■□□□ 1.93
UPP1-209ENST00000444999 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
UPP1-209ENST00000444999 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
UPP1-209ENST00000444999 USP32Q8NFA0 1604 aa27.11■■□□□ 1.93
UPP1-209ENST00000444999 ADGRB2O60241 1585 aa27.1■■□□□ 1.93
UPP1-209ENST00000444999 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
UPP1-209ENST00000444999 RGS12O14924 1447 aa27.08■■□□□ 1.93
UPP1-209ENST00000444999 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.07■■□□□ 1.92
UPP1-209ENST00000444999 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.92
UPP1-209ENST00000444999 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.06■■□□□ 1.92
UPP1-209ENST00000444999 PSME1Q06323 249 aa27.04■■□□□ 1.92
UPP1-209ENST00000444999 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
UPP1-209ENST00000444999 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.04■■□□□ 1.92
UPP1-209ENST00000444999 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
UPP1-209ENST00000444999 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.03■■□□□ 1.92
UPP1-209ENST00000444999 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.03■■□□□ 1.92
UPP1-209ENST00000444999 ATRNO75882 1429 aa27.02■■□□□ 1.92
UPP1-209ENST00000444999 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
UPP1-209ENST00000444999 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
UPP1-209ENST00000444999 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.01■■□□□ 1.91
UPP1-209ENST00000444999 SBNO1A3KN83 1393 aa27■■□□□ 1.91
UPP1-209ENST00000444999 PLEKHG5O94827 1062 aa27■■□□□ 1.91
UPP1-209ENST00000444999 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27■■□□□ 1.91
UPP1-209ENST00000444999 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.98■■□□□ 1.91
UPP1-209ENST00000444999 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.98■■□□□ 1.91
UPP1-209ENST00000444999 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
UPP1-209ENST00000444999 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.95■■□□□ 1.9
UPP1-209ENST00000444999 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
UPP1-209ENST00000444999 SLIT2O94813 1529 aa26.94■■□□□ 1.9
UPP1-209ENST00000444999 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
UPP1-209ENST00000444999 ARHGEF10O15013 1369 aa26.93■■□□□ 1.9
UPP1-209ENST00000444999 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.92■■□□□ 1.9
UPP1-209ENST00000444999 UNC5CLQ8IV45 518 aa26.91■■□□□ 1.9
UPP1-209ENST00000444999 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
UPP1-209ENST00000444999 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
UPP1-209ENST00000444999 ABCA3Q99758 1704 aa26.9■■□□□ 1.9
UPP1-209ENST00000444999 ATP7BP35670 1465 aa26.9■■□□□ 1.9
UPP1-209ENST00000444999 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.9■■□□□ 1.9
UPP1-209ENST00000444999 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.9■■□□□ 1.9
UPP1-209ENST00000444999 CDK19Q9BWU1 502 aa26.9■■□□□ 1.9
UPP1-209ENST00000444999 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
UPP1-209ENST00000444999 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
UPP1-209ENST00000444999 ALS2Q96Q42 1657 aa26.87■■□□□ 1.89
UPP1-209ENST00000444999 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.85■■□□□ 1.89
UPP1-209ENST00000444999 GLI3P10071 1580 aa26.84■■□□□ 1.89
UPP1-209ENST00000444999 FAM83GA6ND36 823 aa26.84■■□□□ 1.89
UPP1-209ENST00000444999 ITSN1Q15811 1721 aa26.83■■□□□ 1.89
UPP1-209ENST00000444999 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
UPP1-209ENST00000444999 NEUROD1Q13562 356 aa26.83■■□□□ 1.89
UPP1-209ENST00000444999 ATAD2Q6PL18 1390 aa26.83■■□□□ 1.88
UPP1-209ENST00000444999 EP400Q96L91 3159 aa26.83■■□□□ 1.88
UPP1-209ENST00000444999 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.82■■□□□ 1.88
UPP1-209ENST00000444999 VPS72Q15906 364 aa26.79■■□□□ 1.88
UPP1-209ENST00000444999 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.79■■□□□ 1.88
UPP1-209ENST00000444999 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms