RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444973.5

NEK6-209, Transcript of NIMA related kinase 6, humanhuman

TSL 5

Gene NEK6, Length 790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK6-209ENST00000444973 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa42.2■■■■■ 4.35
NEK6-209ENST00000444973 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa42.2■■■■■ 4.35
NEK6-209ENST00000444973 IFT172Q9UG01 1749 aa42.2■■■■■ 4.35
NEK6-209ENST00000444973 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
NEK6-209ENST00000444973 NGLY1Q96IV0 654 aa42.17■■■■■ 4.34
NEK6-209ENST00000444973 ESCO1Q5FWF5 840 aa42.16■■■■■ 4.34
NEK6-209ENST00000444973 WAPLQ7Z5K2 1190 aa42.16■■■■■ 4.34
NEK6-209ENST00000444973 TMEM132EQ6IEE7 984 aa42.15■■■■■ 4.34
NEK6-209ENST00000444973 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
NEK6-209ENST00000444973 TECPR2O15040 1411 aa42.14■■■■■ 4.34
NEK6-209ENST00000444973 RGS12O14924 1447 aa42.12■■■■■ 4.33
NEK6-209ENST00000444973 PIK3C2GO75747 1445 aa42.12■■■■■ 4.33
NEK6-209ENST00000444973 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
NEK6-209ENST00000444973 NUTM2FA1L443 756 aa42.1■■■■■ 4.33
NEK6-209ENST00000444973 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa42.1■■■■■ 4.33
NEK6-209ENST00000444973 NPHP3Q7Z494 1330 aa42.09■■■■■ 4.33
NEK6-209ENST00000444973 ABCC11Q96J66 1382 aa42.08■■■■■ 4.33
NEK6-209ENST00000444973 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
NEK6-209ENST00000444973 PXDNQ92626 1479 aa42.05■■■■■ 4.32
NEK6-209ENST00000444973 FOXO3O43524 673 aa42.05■■■■■ 4.32
NEK6-209ENST00000444973 KNDC1Q76NI1 1749 aa42.05■■■■■ 4.32
NEK6-209ENST00000444973 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
NEK6-209ENST00000444973 USP21Q9UK80 565 aa42.02■■■■■ 4.32
NEK6-209ENST00000444973 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
NEK6-209ENST00000444973 MYOM2P54296 1465 aa42■■■■■ 4.31
NEK6-209ENST00000444973 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP41.96■■■■■ 4.31
NEK6-209ENST00000444973 FMN2Q9NZ56 1722 aa41.94■■■■■ 4.3
NEK6-209ENST00000444973 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
NEK6-209ENST00000444973 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
NEK6-209ENST00000444973 CFAP70Q5T0N1 1121 aa41.91■■■■■ 4.3
NEK6-209ENST00000444973 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
NEK6-209ENST00000444973 NRXN1Q9ULB1 1477 aa41.91■■■■■ 4.3
NEK6-209ENST00000444973 ATRNO75882 1429 aa41.88■■■■■ 4.3
NEK6-209ENST00000444973 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.88■■■■■ 4.29
NEK6-209ENST00000444973 SIRT1Q96EB6 747 aa41.84■■■■■ 4.29
NEK6-209ENST00000444973 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
NEK6-209ENST00000444973 KIF1AQ12756 1690 aa41.84■■■■■ 4.29
NEK6-209ENST00000444973 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
NEK6-209ENST00000444973 BCL9LQ86UU0 1499 aa41.82■■■■■ 4.29
NEK6-209ENST00000444973 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP41.81■■■■■ 4.28
NEK6-209ENST00000444973 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa41.8■■■■■ 4.28
NEK6-209ENST00000444973 PRAM1Q96QH2 718 aa41.79■■■■■ 4.28
NEK6-209ENST00000444973 KRT28Q7Z3Y7 464 aa41.78■■■■■ 4.28
NEK6-209ENST00000444973 ATAD2Q6PL18 1390 aa41.77■■■■■ 4.28
NEK6-209ENST00000444973 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
NEK6-209ENST00000444973 PHF8Q9UPP1 1060 aa41.75■■■■■ 4.27
NEK6-209ENST00000444973 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
NEK6-209ENST00000444973 POGKQ9P215 609 aa41.68■■■■■ 4.26
NEK6-209ENST00000444973 DLC1Q96QB1 1528 aa41.68■■■■■ 4.26
NEK6-209ENST00000444973 TNS3Q68CZ2 1445 aa41.68■■■■■ 4.26
NEK6-209ENST00000444973 PLEKHG5O94827 1062 aa41.67■■■■■ 4.26
NEK6-209ENST00000444973 ADGRB1O14514 1584 aa41.66■■■■■ 4.26
NEK6-209ENST00000444973 USP32Q8NFA0 1604 aa41.66■■■■■ 4.26
NEK6-209ENST00000444973 SLIT2O94813 1529 aa41.64■■■■■ 4.26
NEK6-209ENST00000444973 PSME1Q06323 249 aa41.64■■■■■ 4.26
NEK6-209ENST00000444973 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
NEK6-209ENST00000444973 UNC5CLQ8IV45 518 aa41.63■■■■■ 4.25
NEK6-209ENST00000444973 CABLES1Q8TDN4 633 aa41.63■■■■■ 4.25
NEK6-209ENST00000444973 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
NEK6-209ENST00000444973 TRAK1Q9UPV9 953 aa41.62■■■■■ 4.25
NEK6-209ENST00000444973 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.62■■■■■ 4.25
NEK6-209ENST00000444973 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa41.6■■■■■ 4.25
NEK6-209ENST00000444973 LMOD2Q6P5Q4 547 aa41.59■■■■■ 4.25
NEK6-209ENST00000444973 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
NEK6-209ENST00000444973 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.58■■■■■ 4.25
NEK6-209ENST00000444973 SBNO1A3KN83 1393 aa41.58■■■■■ 4.25
NEK6-209ENST00000444973 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.58■■■■■ 4.25
NEK6-209ENST00000444973 ADGRB2O60241 1585 aa41.58■■■■■ 4.25
NEK6-209ENST00000444973 ANKARQ7Z5J8 1434 aa41.57■■■■■ 4.25
NEK6-209ENST00000444973 GLI3P10071 1580 aa41.57■■■■■ 4.25
NEK6-209ENST00000444973 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
NEK6-209ENST00000444973 ARHGEF10O15013 1369 aa41.51■■■■■ 4.24
NEK6-209ENST00000444973 ABCA3Q99758 1704 aa41.51■■■■■ 4.24
NEK6-209ENST00000444973 EP400Q96L91 3159 aa41.49■■■■■ 4.23
NEK6-209ENST00000444973 PRR36Q9H6K5 1346 aa41.47■■■■■ 4.23
NEK6-209ENST00000444973 PLCH1Q4KWH8 1693 aa41.47■■■■■ 4.23
NEK6-209ENST00000444973 TULP4Q9NRJ4 1543 aa41.43■■■■■ 4.22
NEK6-209ENST00000444973 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
NEK6-209ENST00000444973 VPS72Q15906 364 aa41.42■■■■■ 4.22
NEK6-209ENST00000444973 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
NEK6-209ENST00000444973 NWD2Q9ULI1 1742 aa41.41■■■■■ 4.22
NEK6-209ENST00000444973 WASLO00401 505 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
NEK6-209ENST00000444973 CCDC125Q86Z20 511 aa41.4■■■■■ 4.22
NEK6-209ENST00000444973 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
NEK6-209ENST00000444973 GPRASP1Q5JY77 1395 aa41.39■■■■■ 4.22
NEK6-209ENST00000444973 FAM83GA6ND36 823 aa41.39■■■■■ 4.22
NEK6-209ENST00000444973 HRCP23327 699 aa41.38■■■■■ 4.21
NEK6-209ENST00000444973 SEPT12Q8IYM1 358 aa41.38■■■■■ 4.21
NEK6-209ENST00000444973 STAC3Q96MF2 364 aa41.38■■■■■ 4.21
NEK6-209ENST00000444973 BRWD3Q6RI45 1802 aa41.37■■■■■ 4.21
NEK6-209ENST00000444973 ALS2Q96Q42 1657 aa41.35■■■■■ 4.21
NEK6-209ENST00000444973 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
NEK6-209ENST00000444973 ZRANB1Q9UGI0 708 aa41.33■■■■■ 4.21
NEK6-209ENST00000444973 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
NEK6-209ENST00000444973 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
NEK6-209ENST00000444973 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
NEK6-209ENST00000444973 NRAPQ86VF7 1730 aa41.27■■■■■ 4.2
NEK6-209ENST00000444973 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
NEK6-209ENST00000444973 BTG4Q9NY30 223 aa41.26■■■■■ 4.2
NEK6-209ENST00000444973 ATP7BP35670 1465 aa41.25■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms