RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439372.5

ATP6AP1-204, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, human

TSL 4

Gene ATP6AP1, Length 604 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	32.88	■■■□□ 2.85
ATP6AP1-204	ENST00000439372	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.87	■■■□□ 2.85
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DCC	P43146	1447 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ATP6AP1-204	ENST00000439372	POGK	Q9P215	609 aa		32.86	■■■□□ 2.85
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.84	■■■□□ 2.85
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		32.83	■■■□□ 2.85
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ATF3	P18847	181 aa		32.83	■■■□□ 2.85
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		32.82	■■■□□ 2.84
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MST1R	Q04912	1400 aa		32.78	■■■□□ 2.84
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		32.78	■■■□□ 2.84
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ADGRB2	O60241	1585 aa		32.78	■■■□□ 2.84
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SLAIN2	Q9P270	581 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ATP6AP1-204	ENST00000439372	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		32.77	■■■□□ 2.84
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	32.76	■■■□□ 2.83
ATP6AP1-204	ENST00000439372	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	32.72	■■■□□ 2.83
ATP6AP1-204	ENST00000439372	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		32.7	■■■□□ 2.83
ATP6AP1-204	ENST00000439372	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NUTM2F	A1L443	756 aa		32.66	■■■□□ 2.82
ATP6AP1-204	ENST00000439372	USP32	Q8NFA0	1604 aa		32.65	■■■□□ 2.82
ATP6AP1-204	ENST00000439372	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
ATP6AP1-204	ENST00000439372	BRINP3	Q76B58	766 aa		32.62	■■■□□ 2.81
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ORAI2	Q96SN7	254 aa		32.6	■■■□□ 2.81
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		32.59	■■■□□ 2.81
ATP6AP1-204	ENST00000439372	HSPA1L	P34931	641 aa		32.58	■■■□□ 2.81
ATP6AP1-204	ENST00000439372	USP47	Q96K76	1375 aa		32.58	■■■□□ 2.81
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PHLPP1	O60346	1717 aa		32.57	■■■□□ 2.8
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		32.56	■■■□□ 2.8
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		32.56	■■■□□ 2.8
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CDK19	Q9BWU1	502 aa		32.56	■■■□□ 2.8
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		32.55	■■■□□ 2.8
ATP6AP1-204	ENST00000439372	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		32.54	■■■□□ 2.8
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		32.53	■■■□□ 2.8
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ATP7B	P35670	1465 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
ATP6AP1-204	ENST00000439372	KIF1A	Q12756	1690 aa		32.5	■■■□□ 2.79
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ITSN1	Q15811	1721 aa		32.5	■■■□□ 2.79
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		32.5	■■■□□ 2.79
ATP6AP1-204	ENST00000439372	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	32.49	■■■□□ 2.79
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TESK2	Q96S53	571 aa		32.47	■■■□□ 2.79
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CABP2	Q9NPB3	220 aa		32.47	■■■□□ 2.79
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EVC2	Q86UK5	1308 aa		32.47	■■■□□ 2.79
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
ATP6AP1-204	ENST00000439372	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.45	■■■□□ 2.79
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		32.44	■■■□□ 2.78
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		32.41	■■■□□ 2.78
ATP6AP1-204	ENST00000439372	FOXO3	O43524	673 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SLC24A1	O60721	1099 aa		32.4	■■■□□ 2.78
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PXDN	Q92626	1479 aa		32.38	■■■□□ 2.77
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ATP6AP1-204	ENST00000439372	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.37	■■■□□ 2.77
ATP6AP1-204	ENST00000439372	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		32.36	■■■□□ 2.77
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ATP6AP1-204	ENST00000439372	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		32.34	■■■□□ 2.77
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		32.3	■■■□□ 2.76
ATP6AP1-204	ENST00000439372	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SHPRH	Q149N8	1683 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TMF1	P82094	1093 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CABP1	Q9NZU7	370 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ACE	P12821	1306 aa		32.27	■■■□□ 2.76
ATP6AP1-204	ENST00000439372	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PSME1	Q06323	249 aa		32.26	■■■□□ 2.75
ATP6AP1-204	ENST00000439372	JCAD	Q9P266	1359 aa		32.26	■■■□□ 2.75
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
ATP6AP1-204	ENST00000439372	AKAP12	Q02952	1782 aa		32.24	■■■□□ 2.75
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		32.21	■■■□□ 2.75
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CDCA8	Q53HL2	280 aa		32.2	■■■□□ 2.75
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SBNO1	A3KN83	1393 aa		32.19	■■■□□ 2.74
ATP6AP1-204	ENST00000439372	ALS2	Q96Q42	1657 aa		32.19	■■■□□ 2.74
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		32.19	■■■□□ 2.74
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		32.18	■■■□□ 2.74
ATP6AP1-204	ENST00000439372	TMC1	Q8TDI8	760 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ATP6AP1-204	ENST00000439372	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ATP6AP1-204	ENST00000439372	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MYOM1	P52179	1685 aa		32.16	■■■□□ 2.74
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		32.16	■■■□□ 2.74
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		32.15	■■■□□ 2.74
ATP6AP1-204	ENST00000439372	USP6	P35125	1406 aa		32.14	■■■□□ 2.74
ATP6AP1-204	ENST00000439372	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
ATP6AP1-204	ENST00000439372	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
ATP6AP1-204	ENST00000439372	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ATP6AP1-204	ENST00000439372	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
ATP6AP1-204	ENST00000439372	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LRP6	O75581	1613 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ATP6AP1-204	ENST00000439372	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		32.1	■■■□□ 2.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.8 ms