RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.71■■■□□ 2.19
NPAS1-201ENST00000439365 TECPR2O15040 1411 aa28.7■■■□□ 2.19
NPAS1-201ENST00000439365 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
NPAS1-201ENST00000439365 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
NPAS1-201ENST00000439365 NUTM2FA1L443 756 aa28.69■■■□□ 2.18
NPAS1-201ENST00000439365 HRCP23327 699 aa28.69■■■□□ 2.18
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
NPAS1-201ENST00000439365 MYOM2P54296 1465 aa28.68■■■□□ 2.18
NPAS1-201ENST00000439365 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.68■■■□□ 2.18
NPAS1-201ENST00000439365 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
NPAS1-201ENST00000439365 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.67■■■□□ 2.18
NPAS1-201ENST00000439365 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.67■■■□□ 2.18
NPAS1-201ENST00000439365 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.66■■■□□ 2.18
NPAS1-201ENST00000439365 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.65■■■□□ 2.18
NPAS1-201ENST00000439365 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.64■■■□□ 2.17
NPAS1-201ENST00000439365 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.63■■■□□ 2.17
NPAS1-201ENST00000439365 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
NPAS1-201ENST00000439365 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
NPAS1-201ENST00000439365 C8orf37Q96NL8 207 aa28.62■■■□□ 2.17
NPAS1-201ENST00000439365 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.61■■■□□ 2.17
NPAS1-201ENST00000439365 LAMC1P11047 1609 aa28.61■■■□□ 2.17
NPAS1-201ENST00000439365 SIRT1Q96EB6 747 aa28.6■■■□□ 2.17
NPAS1-201ENST00000439365 AFF2P51816 1311 aa28.59■■■□□ 2.17
NPAS1-201ENST00000439365 FOXO3O43524 673 aa28.59■■■□□ 2.17
NPAS1-201ENST00000439365 ADAMTS2O95450 1211 aa28.59■■■□□ 2.17
NPAS1-201ENST00000439365 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
NPAS1-201ENST00000439365 PRAM1Q96QH2 718 aa28.58■■■□□ 2.17
NPAS1-201ENST00000439365 POGKQ9P215 609 aa28.58■■■□□ 2.17
NPAS1-201ENST00000439365 RXRBP28702 533 aa28.54■■■□□ 2.16
NPAS1-201ENST00000439365 NGLY1Q96IV0 654 aa28.53■■■□□ 2.16
NPAS1-201ENST00000439365 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.53■■■□□ 2.16
NPAS1-201ENST00000439365 STAC3Q96MF2 364 aa28.51■■■□□ 2.15
NPAS1-201ENST00000439365 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.5■■■□□ 2.15
NPAS1-201ENST00000439365 PXDNQ92626 1479 aa28.49■■■□□ 2.15
NPAS1-201ENST00000439365 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
NPAS1-201ENST00000439365 ADGRB1O14514 1584 aa28.46■■■□□ 2.15
NPAS1-201ENST00000439365 DLC1Q96QB1 1528 aa28.46■■■□□ 2.15
NPAS1-201ENST00000439365 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
NPAS1-201ENST00000439365 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.45■■■□□ 2.15
NPAS1-201ENST00000439365 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.43■■■□□ 2.14
NPAS1-201ENST00000439365 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
NPAS1-201ENST00000439365 KIF1AQ12756 1690 aa28.42■■■□□ 2.14
NPAS1-201ENST00000439365 USP21Q9UK80 565 aa28.42■■■□□ 2.14
NPAS1-201ENST00000439365 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
NPAS1-201ENST00000439365 PSME1Q06323 249 aa28.4■■■□□ 2.14
NPAS1-201ENST00000439365 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
NPAS1-201ENST00000439365 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.38■■■□□ 2.13
NPAS1-201ENST00000439365 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.38■■■□□ 2.13
NPAS1-201ENST00000439365 PLEKHG5O94827 1062 aa28.37■■■□□ 2.13
NPAS1-201ENST00000439365 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.37■■■□□ 2.13
NPAS1-201ENST00000439365 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
NPAS1-201ENST00000439365 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
NPAS1-201ENST00000439365 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
NPAS1-201ENST00000439365 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
NPAS1-201ENST00000439365 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
NPAS1-201ENST00000439365 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.33■■■□□ 2.13
NPAS1-201ENST00000439365 ADGRB2O60241 1585 aa28.32■■■□□ 2.12
NPAS1-201ENST00000439365 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
NPAS1-201ENST00000439365 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
NPAS1-201ENST00000439365 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.31■■■□□ 2.12
NPAS1-201ENST00000439365 RGS12O14924 1447 aa28.29■■■□□ 2.12
NPAS1-201ENST00000439365 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
NPAS1-201ENST00000439365 USP32Q8NFA0 1604 aa28.28■■■□□ 2.12
NPAS1-201ENST00000439365 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.27■■■□□ 2.12
NPAS1-201ENST00000439365 SBNO1A3KN83 1393 aa28.27■■■□□ 2.12
NPAS1-201ENST00000439365 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.26■■■□□ 2.11
NPAS1-201ENST00000439365 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.26■■■□□ 2.11
NPAS1-201ENST00000439365 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.25■■■□□ 2.11
NPAS1-201ENST00000439365 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
NPAS1-201ENST00000439365 ARHGEF10O15013 1369 aa28.25■■■□□ 2.11
NPAS1-201ENST00000439365 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
NPAS1-201ENST00000439365 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.24■■■□□ 2.11
NPAS1-201ENST00000439365 ATRNO75882 1429 aa28.23■■■□□ 2.11
NPAS1-201ENST00000439365 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
NPAS1-201ENST00000439365 NEUROD1Q13562 356 aa28.22■■■□□ 2.11
NPAS1-201ENST00000439365 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.22■■■□□ 2.11
NPAS1-201ENST00000439365 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.21■■■□□ 2.11
NPAS1-201ENST00000439365 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
NPAS1-201ENST00000439365 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
NPAS1-201ENST00000439365 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.19■■■□□ 2.1
NPAS1-201ENST00000439365 CDK19Q9BWU1 502 aa28.19■■■□□ 2.1
NPAS1-201ENST00000439365 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.19■■■□□ 2.1
NPAS1-201ENST00000439365 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.18■■■□□ 2.1
NPAS1-201ENST00000439365 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
NPAS1-201ENST00000439365 SLIT2O94813 1529 aa28.14■■■□□ 2.1
NPAS1-201ENST00000439365 ATP7BP35670 1465 aa28.13■■■□□ 2.09
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
NPAS1-201ENST00000439365 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.12■■■□□ 2.09
NPAS1-201ENST00000439365 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
NPAS1-201ENST00000439365 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
NPAS1-201ENST00000439365 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
NPAS1-201ENST00000439365 ITSN1Q15811 1721 aa28.09■■■□□ 2.09
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.09■■■□□ 2.09
NPAS1-201ENST00000439365 FAM83GA6ND36 823 aa28.08■■■□□ 2.09
NPAS1-201ENST00000439365 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.07■■■□□ 2.08
NPAS1-201ENST00000439365 ABCA3Q99758 1704 aa28.07■■■□□ 2.08
NPAS1-201ENST00000439365 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
NPAS1-201ENST00000439365 ACEP12821 1306 aa28.06■■■□□ 2.08
NPAS1-201ENST00000439365 ALS2Q96Q42 1657 aa28.05■■■□□ 2.08
NPAS1-201ENST00000439365 VPS72Q15906 364 aa28.04■■■□□ 2.08
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