RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432588.5

ACTB-205, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-205ENST00000432588 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-205ENST00000432588 IFT172Q9UG01 1749 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-205ENST00000432588 TECPR2O15040 1411 aa23.99■■□□□ 1.43
ACTB-205ENST00000432588 PIK3C2GO75747 1445 aa23.98■■□□□ 1.43
ACTB-205ENST00000432588 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-205ENST00000432588 ABCC11Q96J66 1382 aa23.97■■□□□ 1.43
ACTB-205ENST00000432588 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.96■■□□□ 1.43
ACTB-205ENST00000432588 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
ACTB-205ENST00000432588 ADAMTS2O95450 1211 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-205ENST00000432588 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-205ENST00000432588 WAPLQ7Z5K2 1190 aa23.95■■□□□ 1.42
ACTB-205ENST00000432588 NGLY1Q96IV0 654 aa23.94■■□□□ 1.42
ACTB-205ENST00000432588 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
ACTB-205ENST00000432588 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
ACTB-205ENST00000432588 KNDC1Q76NI1 1749 aa23.92■■□□□ 1.42
ACTB-205ENST00000432588 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.91■■□□□ 1.42
ACTB-205ENST00000432588 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
ACTB-205ENST00000432588 FOXO3O43524 673 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-205ENST00000432588 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.41
ACTB-205ENST00000432588 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
ACTB-205ENST00000432588 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.89■■□□□ 1.41
ACTB-205ENST00000432588 MYOM2P54296 1465 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-205ENST00000432588 NUTM2FA1L443 756 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-205ENST00000432588 SIRT1Q96EB6 747 aa23.88■■□□□ 1.41
ACTB-205ENST00000432588 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
ACTB-205ENST00000432588 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
ACTB-205ENST00000432588 PXDNQ92626 1479 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-205ENST00000432588 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.87■■□□□ 1.41
ACTB-205ENST00000432588 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-205ENST00000432588 USP21Q9UK80 565 aa23.85■■□□□ 1.41
ACTB-205ENST00000432588 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
ACTB-205ENST00000432588 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.82■■□□□ 1.4
ACTB-205ENST00000432588 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
ACTB-205ENST00000432588 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
ACTB-205ENST00000432588 RGS12O14924 1447 aa23.82■■□□□ 1.4
ACTB-205ENST00000432588 KIF1AQ12756 1690 aa23.8■■□□□ 1.4
ACTB-205ENST00000432588 PRAM1Q96QH2 718 aa23.78■■□□□ 1.4
ACTB-205ENST00000432588 POGKQ9P215 609 aa23.77■■□□□ 1.4
ACTB-205ENST00000432588 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
ACTB-205ENST00000432588 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.76■■□□□ 1.39
ACTB-205ENST00000432588 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTB-205ENST00000432588 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTB-205ENST00000432588 DLC1Q96QB1 1528 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-205ENST00000432588 HRCP23327 699 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-205ENST00000432588 PSME1Q06323 249 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-205ENST00000432588 STAC3Q96MF2 364 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-205ENST00000432588 ATRNO75882 1429 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-205ENST00000432588 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.72■■□□□ 1.39
ACTB-205ENST00000432588 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
ACTB-205ENST00000432588 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.71■■□□□ 1.39
ACTB-205ENST00000432588 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.71■■□□□ 1.39
ACTB-205ENST00000432588 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-205ENST00000432588 ADGRB1O14514 1584 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-205ENST00000432588 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-205ENST00000432588 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
ACTB-205ENST00000432588 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-205ENST00000432588 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.68■■□□□ 1.38
ACTB-205ENST00000432588 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
ACTB-205ENST00000432588 SBNO1A3KN83 1393 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-205ENST00000432588 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
ACTB-205ENST00000432588 ADGRB2O60241 1585 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-205ENST00000432588 ARHGEF10O15013 1369 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-205ENST00000432588 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-205ENST00000432588 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.65■■□□□ 1.38
ACTB-205ENST00000432588 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
ACTB-205ENST00000432588 USP32Q8NFA0 1604 aa23.64■■□□□ 1.38
ACTB-205ENST00000432588 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
ACTB-205ENST00000432588 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.63■■□□□ 1.37
ACTB-205ENST00000432588 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
ACTB-205ENST00000432588 SLIT2O94813 1529 aa23.63■■□□□ 1.37
ACTB-205ENST00000432588 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
ACTB-205ENST00000432588 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-205ENST00000432588 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ACTB-205ENST00000432588 PLEKHG5O94827 1062 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-205ENST00000432588 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-205ENST00000432588 EP400Q96L91 3159 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-205ENST00000432588 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.58■■□□□ 1.36
ACTB-205ENST00000432588 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-205ENST00000432588 CCDC125Q86Z20 511 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-205ENST00000432588 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ACTB-205ENST00000432588 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-205ENST00000432588 VPS72Q15906 364 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-205ENST00000432588 ABCA3Q99758 1704 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-205ENST00000432588 GLI3P10071 1580 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-205ENST00000432588 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ACTB-205ENST00000432588 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-205ENST00000432588 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ACTB-205ENST00000432588 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ACTB-205ENST00000432588 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-205ENST00000432588 FAM83GA6ND36 823 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-205ENST00000432588 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ACTB-205ENST00000432588 ALS2Q96Q42 1657 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-205ENST00000432588 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.47■■□□□ 1.35
ACTB-205ENST00000432588 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ACTB-205ENST00000432588 ATP7BP35670 1465 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-205ENST00000432588 ITSN1Q15811 1721 aa23.46■■□□□ 1.35
ACTB-205ENST00000432588 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-205ENST00000432588 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ACTB-205ENST00000432588 CDK19Q9BWU1 502 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-205ENST00000432588 BTG4Q9NY30 223 aa23.44■■□□□ 1.34
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