RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.43■■■■□ 3.42
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa36.41■■■■□ 3.42
CERS1-201ENST00000429504 MORC1Q86VD1 984 aa36.4■■■■□ 3.42
CERS1-201ENST00000429504 CGNL1Q0VF96 1302 aa36.4■■■■□ 3.42
CERS1-201ENST00000429504 CCDC146Q8IYE0 955 aa36.39■■■■□ 3.42
CERS1-201ENST00000429504 NSD2O96028 1365 aa36.38■■■■□ 3.41
CERS1-201ENST00000429504 SLFN5Q08AF3 891 aa36.37■■■■□ 3.41
CERS1-201ENST00000429504 NINLQ9Y2I6 1382 aa36.37■■■■□ 3.41
CERS1-201ENST00000429504 PTPRMP28827 1452 aa36.37■■■■□ 3.41
CERS1-201ENST00000429504 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
CERS1-201ENST00000429504 APAF1O14727 1248 aa36.36■■■■□ 3.41
CERS1-201ENST00000429504 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP36.36■■■■□ 3.41
CERS1-201ENST00000429504 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.35■■■■□ 3.41
CERS1-201ENST00000429504 PLIN1O60240 522 aa36.34■■■■□ 3.41
CERS1-201ENST00000429504 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
CERS1-201ENST00000429504 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.31■■■■□ 3.4
CERS1-201ENST00000429504 ALKQ9UM73 1620 aa36.31■■■■□ 3.4
CERS1-201ENST00000429504 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
CERS1-201ENST00000429504 MSH5O43196 834 aa36.3■■■■□ 3.4
CERS1-201ENST00000429504 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
CERS1-201ENST00000429504 CRBNQ96SW2 442 aa36.27■■■■□ 3.4
CERS1-201ENST00000429504 CABP2Q9NPB3 220 aa36.27■■■■□ 3.4
CERS1-201ENST00000429504 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.25■■■■□ 3.39
CERS1-201ENST00000429504 E9PSI1 815 aa36.25■■■■□ 3.39
CERS1-201ENST00000429504 STK26Q9P289 416 aa36.25■■■■□ 3.39
CERS1-201ENST00000429504 ATAD2Q6PL18 1390 aa36.24■■■■□ 3.39
CERS1-201ENST00000429504 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
CERS1-201ENST00000429504 ABCC11Q96J66 1382 aa36.22■■■■□ 3.39
CERS1-201ENST00000429504 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.22■■■■□ 3.39
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa36.21■■■■□ 3.39
CERS1-201ENST00000429504 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
CERS1-201ENST00000429504 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.21■■■■□ 3.39
CERS1-201ENST00000429504 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.21■■■■□ 3.39
CERS1-201ENST00000429504 A0A1W2PP64 1363 aa36.2■■■■□ 3.39
CERS1-201ENST00000429504 CFAP53Q96M91 514 aa36.19■■■■□ 3.38
CERS1-201ENST00000429504 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP36.19■■■■□ 3.38
CERS1-201ENST00000429504 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.19■■■■□ 3.38
CERS1-201ENST00000429504 MTHFSP49914 203 aa36.18■■■■□ 3.38
CERS1-201ENST00000429504 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
CERS1-201ENST00000429504 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
CERS1-201ENST00000429504 PRAM1Q96QH2 718 aa36.17■■■■□ 3.38
CERS1-201ENST00000429504 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
CERS1-201ENST00000429504 C20orf194Q5TEA3 1177 aa36.17■■■■□ 3.38
CERS1-201ENST00000429504 RUNDC1Q96C34 613 aa36.16■■■■□ 3.38
CERS1-201ENST00000429504 DLC1Q96QB1 1528 aa36.16■■■■□ 3.38
CERS1-201ENST00000429504 POGKQ9P215 609 aa36.14■■■■□ 3.38
CERS1-201ENST00000429504 WWC1Q8IX03 1113 aa36.14■■■■□ 3.38
CERS1-201ENST00000429504 MED14O60244 1454 aa36.13■■■■□ 3.37
CERS1-201ENST00000429504 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
CERS1-201ENST00000429504 CD163L1Q9NR16 1453 aa36.11■■■■□ 3.37
CERS1-201ENST00000429504 RIMS2Q9UQ26 1411 aa36.1■■■■□ 3.37
CERS1-201ENST00000429504 TERF2IPQ9NYB0 399 aa36.1■■■■□ 3.37
CERS1-201ENST00000429504 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.1■■■■□ 3.37
CERS1-201ENST00000429504 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
CERS1-201ENST00000429504 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
CERS1-201ENST00000429504 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
CERS1-201ENST00000429504 MS4A1P11836 297 aa36.07■■■■□ 3.36
CERS1-201ENST00000429504 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
CERS1-201ENST00000429504 NLRP1Q9C000 1473 aa36.05■■■■□ 3.36
CERS1-201ENST00000429504 TCP11L2Q8N4U5 519 aa36.04■■■■□ 3.36
CERS1-201ENST00000429504 ADGRB2O60241 1585 aa36.04■■■■□ 3.36
CERS1-201ENST00000429504 KIF20BQ96Q89 1820 aa36.04■■■■□ 3.36
CERS1-201ENST00000429504 CCDC27Q2M243 656 aa36.03■■■■□ 3.36
CERS1-201ENST00000429504 KDM2BQ8NHM5 1336 aa36.02■■■■□ 3.36
CERS1-201ENST00000429504 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa36.02■■■■□ 3.36
CERS1-201ENST00000429504 WDR63Q8IWG1 891 aa36■■■■□ 3.35
CERS1-201ENST00000429504 MLECQ14165 292 aa35.99■■■■□ 3.35
CERS1-201ENST00000429504 CDK19Q9BWU1 502 aa35.99■■■■□ 3.35
CERS1-201ENST00000429504 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
CERS1-201ENST00000429504 ERICH6Q7L0X2 663 aa35.98■■■■□ 3.35
CERS1-201ENST00000429504 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
CERS1-201ENST00000429504 FYB1O15117 783 aa35.96■■■■□ 3.35
CERS1-201ENST00000429504 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
CERS1-201ENST00000429504 BCAR3O75815 825 aa35.96■■■■□ 3.35
CERS1-201ENST00000429504 GGNBP2Q9H3C7 697 aa35.96■■■■□ 3.35
CERS1-201ENST00000429504 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
CERS1-201ENST00000429504 ZMYM3Q14202 1370 aa35.95■■■■□ 3.35
CERS1-201ENST00000429504 ATP7BP35670 1465 aa35.94■■■■□ 3.34
CERS1-201ENST00000429504 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
CERS1-201ENST00000429504 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
CERS1-201ENST00000429504 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP35.93■■■■□ 3.34
CERS1-201ENST00000429504 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.93■■■■□ 3.34
CERS1-201ENST00000429504 NEUROD2Q15784 382 aa35.93■■■■□ 3.34
CERS1-201ENST00000429504 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.92■■■■□ 3.34
CERS1-201ENST00000429504 PDE4AP27815 886 aa35.9■■■■□ 3.34
CERS1-201ENST00000429504 PDE3AQ14432 1141 aa35.9■■■■□ 3.34
CERS1-201ENST00000429504 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
CERS1-201ENST00000429504 BACH2Q9BYV9 841 aa35.89■■■■□ 3.34
CERS1-201ENST00000429504 CABP1Q9NZU7 370 aa35.88■■■■□ 3.34
CERS1-201ENST00000429504 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.85■■■■□ 3.33
CERS1-201ENST00000429504 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.84■■■■□ 3.33
CERS1-201ENST00000429504 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
CERS1-201ENST00000429504 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
CERS1-201ENST00000429504 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.82■■■■□ 3.32
CERS1-201ENST00000429504 TECPR2O15040 1411 aa35.81■■■■□ 3.32
CERS1-201ENST00000429504 PLEKHF1Q96S99 279 aa35.81■■■■□ 3.32
CERS1-201ENST00000429504 MYH16Q9H6N6 1097 aa35.81■■■■□ 3.32
CERS1-201ENST00000429504 TNRQ92752 1358 aa35.81■■■■□ 3.32
CERS1-201ENST00000429504 METP08581 1390 aa35.8■■■■□ 3.32
CERS1-201ENST00000429504 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.8■■■■□ 3.32
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