RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 NSD2O96028 1365 aa21.83■■□□□ 1.08
HCLS1-202ENST00000428394 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.82■■□□□ 1.08
HCLS1-202ENST00000428394 C8orf34Q49A92 452 aa21.82■■□□□ 1.08
HCLS1-202ENST00000428394 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HCLS1-202ENST00000428394 ADGRB1O14514 1584 aa21.79■■□□□ 1.08
HCLS1-202ENST00000428394 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HCLS1-202ENST00000428394 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.78■■□□□ 1.08
HCLS1-202ENST00000428394 APAF1O14727 1248 aa21.78■■□□□ 1.08
HCLS1-202ENST00000428394 KIF3BO15066 747 aa21.78■■□□□ 1.08
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC27Q2M243 656 aa21.78■■□□□ 1.08
HCLS1-202ENST00000428394 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.76■■□□□ 1.07
HCLS1-202ENST00000428394 WDR63Q8IWG1 891 aa21.76■■□□□ 1.07
HCLS1-202ENST00000428394 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HCLS1-202ENST00000428394 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.75■■□□□ 1.07
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HCLS1-202ENST00000428394 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.74■■□□□ 1.07
HCLS1-202ENST00000428394 RICTORQ6R327 1708 aa21.74■■□□□ 1.07
HCLS1-202ENST00000428394 POGZQ7Z3K3 1410 aa21.74■■□□□ 1.07
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HCLS1-202ENST00000428394 ADGRB2O60241 1585 aa21.72■■□□□ 1.07
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HCLS1-202ENST00000428394 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.71■■□□□ 1.07
HCLS1-202ENST00000428394 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.71■■□□□ 1.07
HCLS1-202ENST00000428394 CFAP53Q96M91 514 aa21.7■■□□□ 1.06
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.69■■□□□ 1.06
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HCLS1-202ENST00000428394 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.68■■□□□ 1.06
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
HCLS1-202ENST00000428394 ZFYVE9O95405 1425 aa21.66■■□□□ 1.06
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HCLS1-202ENST00000428394 MORC1Q86VD1 984 aa21.66■■□□□ 1.06
HCLS1-202ENST00000428394 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
HCLS1-202ENST00000428394 ABCC3O15438 1527 aa21.66■■□□□ 1.06
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.66■■□□□ 1.06
HCLS1-202ENST00000428394 BECN1Q14457 450 aa21.65■■□□□ 1.06
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.64■■□□□ 1.06
HCLS1-202ENST00000428394 BCAR3O75815 825 aa21.64■■□□□ 1.05
HCLS1-202ENST00000428394 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.64■■□□□ 1.05
HCLS1-202ENST00000428394 MED14O60244 1454 aa21.64■■□□□ 1.05
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.64■■□□□ 1.05
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HCLS1-202ENST00000428394 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.57■■□□□ 1.04
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HCLS1-202ENST00000428394 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
HCLS1-202ENST00000428394 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.55■■□□□ 1.04
HCLS1-202ENST00000428394 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.53■■□□□ 1.04
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.53■■□□□ 1.04
HCLS1-202ENST00000428394 COG6Q9Y2V7 657 aa21.52■■□□□ 1.04
HCLS1-202ENST00000428394 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.51■■□□□ 1.03
HCLS1-202ENST00000428394 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.51■■□□□ 1.03
HCLS1-202ENST00000428394 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.5■■□□□ 1.03
HCLS1-202ENST00000428394 PANK1Q8TE04 598 aa21.5■■□□□ 1.03
HCLS1-202ENST00000428394 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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HCLS1-202ENST00000428394 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.49■■□□□ 1.03
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HCLS1-202ENST00000428394 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.48■■□□□ 1.03
HCLS1-202ENST00000428394 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.48■■□□□ 1.03
HCLS1-202ENST00000428394 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.48■■□□□ 1.03
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HCLS1-202ENST00000428394 ZNF428Q96B54 188 aa21.45■■□□□ 1.02
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HCLS1-202ENST00000428394 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.44■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 SLC4A3P48751 1232 aa21.44■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.43■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.42■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.4■■□□□ 1.02
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