RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 FBXO41Q8TF61 875 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXA4-202ENST00000428284 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
HOXA4-202ENST00000428284 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXA4-202ENST00000428284 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
HOXA4-202ENST00000428284 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
HOXA4-202ENST00000428284 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM94Q12767 1356 aa28.89■■■□□ 2.21
HOXA4-202ENST00000428284 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.89■■■□□ 2.21
HOXA4-202ENST00000428284 C14orf37Q86TY3 774 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXA4-202ENST00000428284 TESK2Q96S53 571 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXA4-202ENST00000428284 ADGRB2O60241 1585 aa28.87■■■□□ 2.21
HOXA4-202ENST00000428284 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXA4-202ENST00000428284 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.84■■■□□ 2.21
HOXA4-202ENST00000428284 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.83■■■□□ 2.21
HOXA4-202ENST00000428284 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.83■■■□□ 2.21
HOXA4-202ENST00000428284 SLC24A1O60721 1099 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXA4-202ENST00000428284 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.81■■■□□ 2.2
HOXA4-202ENST00000428284 TMF1P82094 1093 aa28.8■■■□□ 2.2
HOXA4-202ENST00000428284 EVC2Q86UK5 1308 aa28.79■■■□□ 2.2
HOXA4-202ENST00000428284 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.79■■■□□ 2.2
HOXA4-202ENST00000428284 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.77■■■□□ 2.2
HOXA4-202ENST00000428284 MSH6P52701 1360 aa28.76■■■□□ 2.2
HOXA4-202ENST00000428284 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
HOXA4-202ENST00000428284 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXA4-202ENST00000428284 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
HOXA4-202ENST00000428284 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
HOXA4-202ENST00000428284 CDK19Q9BWU1 502 aa28.73■■■□□ 2.19
HOXA4-202ENST00000428284 CDCA8Q53HL2 280 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXA4-202ENST00000428284 DCCP43146 1447 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXA4-202ENST00000428284 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
HOXA4-202ENST00000428284 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXA4-202ENST00000428284 CABP2Q9NPB3 220 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
HOXA4-202ENST00000428284 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.7■■■□□ 2.18
HOXA4-202ENST00000428284 ATF3P18847 181 aa28.69■■■□□ 2.18
HOXA4-202ENST00000428284 ITSN1Q15811 1721 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXA4-202ENST00000428284 USP32Q8NFA0 1604 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXA4-202ENST00000428284 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXA4-202ENST00000428284 NUTM2FA1L443 756 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXA4-202ENST00000428284 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXA4-202ENST00000428284 ATP7BP35670 1465 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC7Q96M83 1385 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXA4-202ENST00000428284 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXA4-202ENST00000428284 TOM1O60784 492 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXA4-202ENST00000428284 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXA4-202ENST00000428284 MYOM1P52179 1685 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXA4-202ENST00000428284 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.64■■■□□ 2.17
HOXA4-202ENST00000428284 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.63■■■□□ 2.17
HOXA4-202ENST00000428284 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
HOXA4-202ENST00000428284 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
HOXA4-202ENST00000428284 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.61■■■□□ 2.17
HOXA4-202ENST00000428284 MST1RQ04912 1400 aa28.6■■■□□ 2.17
HOXA4-202ENST00000428284 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXA4-202ENST00000428284 TMC1Q8TDI8 760 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXA4-202ENST00000428284 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.57■■■□□ 2.16
HOXA4-202ENST00000428284 PIP4K2BP78356 416 aa28.54■■■□□ 2.16
HOXA4-202ENST00000428284 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
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HOXA4-202ENST00000428284 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXA4-202ENST00000428284 SLAIN2Q9P270 581 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXA4-202ENST00000428284 CABP1Q9NZU7 370 aa28.51■■■□□ 2.15
HOXA4-202ENST00000428284 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.5■■■□□ 2.15
HOXA4-202ENST00000428284 AKAP12Q02952 1782 aa28.5■■■□□ 2.15
HOXA4-202ENST00000428284 ORAI2Q96SN7 254 aa28.49■■■□□ 2.15
HOXA4-202ENST00000428284 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.48■■■□□ 2.15
HOXA4-202ENST00000428284 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.47■■■□□ 2.15
HOXA4-202ENST00000428284 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.46■■■□□ 2.15
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.45■■■□□ 2.14
HOXA4-202ENST00000428284 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.44■■■□□ 2.14
HOXA4-202ENST00000428284 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXA4-202ENST00000428284 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
HOXA4-202ENST00000428284 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
HOXA4-202ENST00000428284 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.43■■■□□ 2.14
HOXA4-202ENST00000428284 ACEP12821 1306 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXA4-202ENST00000428284 A0A1W2PP64 1363 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXA4-202ENST00000428284 BRINP3Q76B58 766 aa28.41■■■□□ 2.14
HOXA4-202ENST00000428284 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
HOXA4-202ENST00000428284 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
HOXA4-202ENST00000428284 PANK3Q9H999 370 aa28.4■■■□□ 2.14
HOXA4-202ENST00000428284 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
HOXA4-202ENST00000428284 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
HOXA4-202ENST00000428284 FOXO3O43524 673 aa28.37■■■□□ 2.13
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HOXA4-202ENST00000428284 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.35■■■□□ 2.13
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
HOXA4-202ENST00000428284 USP6P35125 1406 aa28.34■■■□□ 2.13
HOXA4-202ENST00000428284 PSME1Q06323 249 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXA4-202ENST00000428284 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXA4-202ENST00000428284 NSD3Q9BZ95 1437 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXA4-202ENST00000428284 HSPA1LP34931 641 aa28.33■■■□□ 2.12
HOXA4-202ENST00000428284 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
HOXA4-202ENST00000428284 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXA4-202ENST00000428284 CARD14Q9BXL6 1004 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXA4-202ENST00000428284 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
HOXA4-202ENST00000428284 KIF20BQ96Q89 1820 aa28.31■■■□□ 2.12
HOXA4-202ENST00000428284 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
HOXA4-202ENST00000428284 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
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