RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427412.5

CITED1-204, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene CITED1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-204ENST00000427412 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CITED1-204ENST00000427412 ORAI2Q96SN7 254 aa22.33■■□□□ 1.17
CITED1-204ENST00000427412 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CITED1-204ENST00000427412 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.33■■□□□ 1.17
CITED1-204ENST00000427412 EP400Q96L91 3159 aa22.33■■□□□ 1.16
CITED1-204ENST00000427412 KIF1AQ12756 1690 aa22.3■■□□□ 1.16
CITED1-204ENST00000427412 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CITED1-204ENST00000427412 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.3■■□□□ 1.16
CITED1-204ENST00000427412 ATRNO75882 1429 aa22.29■■□□□ 1.16
CITED1-204ENST00000427412 ADAMTS2O95450 1211 aa22.28■■□□□ 1.16
CITED1-204ENST00000427412 NGLY1Q96IV0 654 aa22.28■■□□□ 1.16
CITED1-204ENST00000427412 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.27■■□□□ 1.16
CITED1-204ENST00000427412 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.27■■□□□ 1.16
CITED1-204ENST00000427412 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CITED1-204ENST00000427412 PIK3C2GO75747 1445 aa22.25■■□□□ 1.15
CITED1-204ENST00000427412 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.25■■□□□ 1.15
CITED1-204ENST00000427412 USP21Q9UK80 565 aa22.24■■□□□ 1.15
CITED1-204ENST00000427412 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CITED1-204ENST00000427412 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CITED1-204ENST00000427412 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.24■■□□□ 1.15
CITED1-204ENST00000427412 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.23■■□□□ 1.15
CITED1-204ENST00000427412 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CITED1-204ENST00000427412 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.23■■□□□ 1.15
CITED1-204ENST00000427412 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.22■■□□□ 1.15
CITED1-204ENST00000427412 USP32Q8NFA0 1604 aa22.21■■□□□ 1.15
CITED1-204ENST00000427412 ABCA3Q99758 1704 aa22.21■■□□□ 1.15
CITED1-204ENST00000427412 ABCC11Q96J66 1382 aa22.21■■□□□ 1.15
CITED1-204ENST00000427412 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.19■■□□□ 1.14
CITED1-204ENST00000427412 FOXD1Q16676 465 aa22.18■■□□□ 1.14
CITED1-204ENST00000427412 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.17■■□□□ 1.14
CITED1-204ENST00000427412 GLI3P10071 1580 aa22.16■■□□□ 1.14
CITED1-204ENST00000427412 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CITED1-204ENST00000427412 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.16■■□□□ 1.14
CITED1-204ENST00000427412 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.16■■□□□ 1.14
CITED1-204ENST00000427412 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.16■■□□□ 1.14
CITED1-204ENST00000427412 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.16■■□□□ 1.14
CITED1-204ENST00000427412 SLIT2O94813 1529 aa22.16■■□□□ 1.14
CITED1-204ENST00000427412 FOXO3O43524 673 aa22.14■■□□□ 1.13
CITED1-204ENST00000427412 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.13■■□□□ 1.13
CITED1-204ENST00000427412 ADGRB2O60241 1585 aa22.12■■□□□ 1.13
CITED1-204ENST00000427412 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CITED1-204ENST00000427412 RGL3Q3MIN7 710 aa22.11■■□□□ 1.13
CITED1-204ENST00000427412 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.11■■□□□ 1.13
CITED1-204ENST00000427412 STK26Q9P289 416 aa22.11■■□□□ 1.13
CITED1-204ENST00000427412 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.1■■□□□ 1.13
CITED1-204ENST00000427412 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.09■■□□□ 1.13
CITED1-204ENST00000427412 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.09■■□□□ 1.13
CITED1-204ENST00000427412 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.09■■□□□ 1.13
CITED1-204ENST00000427412 DLC1Q96QB1 1528 aa22.09■■□□□ 1.13
CITED1-204ENST00000427412 SIRT1Q96EB6 747 aa22.08■■□□□ 1.13
CITED1-204ENST00000427412 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CITED1-204ENST00000427412 NUTM2FA1L443 756 aa22.07■■□□□ 1.12
CITED1-204ENST00000427412 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CITED1-204ENST00000427412 NRAPQ86VF7 1730 aa22.06■■□□□ 1.12
CITED1-204ENST00000427412 CCDC125Q86Z20 511 aa22.04■■□□□ 1.12
CITED1-204ENST00000427412 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.04■■□□□ 1.12
CITED1-204ENST00000427412 ALS2Q96Q42 1657 aa22.04■■□□□ 1.12
CITED1-204ENST00000427412 ADGRB1O14514 1584 aa22.04■■□□□ 1.12
CITED1-204ENST00000427412 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CITED1-204ENST00000427412 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CITED1-204ENST00000427412 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.03■■□□□ 1.12
CITED1-204ENST00000427412 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.02■■□□□ 1.12
CITED1-204ENST00000427412 SBNO1A3KN83 1393 aa22.01■■□□□ 1.11
CITED1-204ENST00000427412 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.01■■□□□ 1.11
CITED1-204ENST00000427412 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CITED1-204ENST00000427412 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CITED1-204ENST00000427412 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22■■□□□ 1.11
CITED1-204ENST00000427412 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.99■■□□□ 1.11
CITED1-204ENST00000427412 ARHGEF10O15013 1369 aa21.99■■□□□ 1.11
CITED1-204ENST00000427412 ZRANB1Q9UGI0 708 aa21.97■■□□□ 1.11
CITED1-204ENST00000427412 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.96■■□□□ 1.11
CITED1-204ENST00000427412 ITSN1Q15811 1721 aa21.96■■□□□ 1.11
CITED1-204ENST00000427412 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CITED1-204ENST00000427412 PSME1Q06323 249 aa21.95■■□□□ 1.1
CITED1-204ENST00000427412 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.95■■□□□ 1.1
CITED1-204ENST00000427412 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CITED1-204ENST00000427412 VPS72Q15906 364 aa21.94■■□□□ 1.1
CITED1-204ENST00000427412 PRAM1Q96QH2 718 aa21.94■■□□□ 1.1
CITED1-204ENST00000427412 LRP5O75197 1615 aa21.93■■□□□ 1.1
CITED1-204ENST00000427412 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.9■■□□□ 1.1
CITED1-204ENST00000427412 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CITED1-204ENST00000427412 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CITED1-204ENST00000427412 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.9■■□□□ 1.1
CITED1-204ENST00000427412 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
CITED1-204ENST00000427412 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CITED1-204ENST00000427412 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
CITED1-204ENST00000427412 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.88■■□□□ 1.09
CITED1-204ENST00000427412 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.88■■□□□ 1.09
CITED1-204ENST00000427412 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CITED1-204ENST00000427412 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.86■■□□□ 1.09
CITED1-204ENST00000427412 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CITED1-204ENST00000427412 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.84■■□□□ 1.09
CITED1-204ENST00000427412 POGKQ9P215 609 aa21.84■■□□□ 1.09
CITED1-204ENST00000427412 ATP7BP35670 1465 aa21.83■■□□□ 1.09
CITED1-204ENST00000427412 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.83■■□□□ 1.09
CITED1-204ENST00000427412 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.83■■□□□ 1.09
CITED1-204ENST00000427412 FAM83GA6ND36 823 aa21.82■■□□□ 1.08
CITED1-204ENST00000427412 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.82■■□□□ 1.08
CITED1-204ENST00000427412 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.82■■□□□ 1.08
CITED1-204ENST00000427412 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.82■■□□□ 1.08
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