RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.4■■□□□ 1.66
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.38■■□□□ 1.65
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HFM1A2PYH4 1435 aa25.37■■□□□ 1.65
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.35■■□□□ 1.65
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.34■■□□□ 1.65
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PXDNQ92626 1479 aa25.34■■□□□ 1.65
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRP5O75197 1615 aa25.31■■□□□ 1.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLTCL1P53675 1640 aa25.31■■□□□ 1.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.31■■□□□ 1.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FOXO3O43524 673 aa25.3■■□□□ 1.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.3■■□□□ 1.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLIT2O94813 1529 aa25.28■■□□□ 1.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.28■■□□□ 1.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLI3P10071 1580 aa25.27■■□□□ 1.64
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF1BO60333 1816 aa25.26■■□□□ 1.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.26■■□□□ 1.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITGAEP38570 1179 aa25.25■■□□□ 1.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.23■■□□□ 1.63
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.2■■□□□ 1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VPS72Q15906 364 aa25.19■■□□□ 1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BAG6P46379 1132 aa25.18■■□□□ 1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.18■■□□□ 1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NAIPQ13075 1403 aa25.18■■□□□ 1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.17■■□□□ 1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.17■■□□□ 1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP32Q8NFA0 1604 aa25.16■■□□□ 1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HRCP23327 699 aa25.16■■□□□ 1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUTM2FA1L443 756 aa25.14■■□□□ 1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.12■■□□□ 1.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TECPR2O15040 1411 aa25.11■■□□□ 1.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF1AQ12756 1690 aa25.1■■□□□ 1.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSME1Q06323 249 aa25.09■■□□□ 1.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.09■■□□□ 1.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPLO60437 1756 aa25.08■■□□□ 1.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.08■■□□□ 1.61
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.07■■□□□ 1.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A0G2JS52 829 aa25.07■■□□□ 1.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYT1Q01538 1121 aa25.07■■□□□ 1.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STK26Q9P289 416 aa25.07■■□□□ 1.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCC11Q96J66 1382 aa25.05■■□□□ 1.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.04■■□□□ 1.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.03■■□□□ 1.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.03■■□□□ 1.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SBNO1A3KN83 1393 aa25.02■■□□□ 1.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGEF10O15013 1369 aa25.02■■□□□ 1.6
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.01■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.01■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM83GA6ND36 823 aa24.98■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.98■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.98■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.96■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.96■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHG5O94827 1062 aa24.96■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIRT1Q96EB6 747 aa24.96■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DISP2A7MBM2 1401 aa24.95■■□□□ 1.59
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.95■■□□□ 1.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.94■■□□□ 1.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABCA3Q99758 1704 aa24.93■■□□□ 1.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BTG4Q9NY30 223 aa24.93■■□□□ 1.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 YY1P25490 414 aa24.9■■□□□ 1.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGL3Q3MIN7 710 aa24.9■■□□□ 1.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NRAPQ86VF7 1730 aa24.89■■□□□ 1.58
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIK3C2GO75747 1445 aa24.88■■□□□ 1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFT172Q9UG01 1749 aa24.88■■□□□ 1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM182BQ5T319 152 aa24.87■■□□□ 1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.86■■□□□ 1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.86■■□□□ 1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.86■■□□□ 1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADGRB2O60241 1585 aa24.85■■□□□ 1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.85■■□□□ 1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.84■■□□□ 1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.83■■□□□ 1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.82■■□□□ 1.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.82■■□□□ 1.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.81■■□□□ 1.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.8■■□□□ 1.56
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
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