RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 SNPHO15079 494 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-272P-201ENST00000411028 SOX11P35716 441 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-272P-201ENST00000411028 GUCA2AQ02747 115 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-272P-201ENST00000411028 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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RNU6-272P-201ENST00000411028 BRD1O95696 1058 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-272P-201ENST00000411028 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC4A3P48751 1232 aa7.54□□□□□ -1.2
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RNU6-272P-201ENST00000411028 VAC14Q08AM6 782 aa7.54□□□□□ -1.2
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RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.54□□□□□ -1.2
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RNU6-272P-201ENST00000411028 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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RNU6-272P-201ENST00000411028 RFX1P22670 979 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-272P-201ENST00000411028 POTEHQ6S545 545 aa7.52□□□□□ -1.21
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RNU6-272P-201ENST00000411028 FUT2Q10981 343 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLF2Q8IX21 1173 aa7.51□□□□□ -1.21
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RNU6-272P-201ENST00000411028 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.5□□□□□ -1.21
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RNU6-272P-201ENST00000411028 PNMA1Q8ND90 353 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-272P-201ENST00000411028 PRR7Q8TB68 274 aa7.49□□□□□ -1.21
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RNU6-272P-201ENST00000411028 PSEN2P49810 448 aa7.48□□□□□ -1.21
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RNU6-272P-201ENST00000411028 DESI1Q6ICB0 168 aa7.48□□□□□ -1.21
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RNU6-272P-201ENST00000411028 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-272P-201ENST00000411028 RETREG3Q86VR2 466 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-272P-201ENST00000411028 MTMR7Q9Y216 660 aa7.47□□□□□ -1.21
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RNU6-272P-201ENST00000411028 LYPD8Q6UX82 237 aa7.44□□□□□ -1.22
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RNU6-272P-201ENST00000411028 PBX2P40425 430 aa7.43□□□□□ -1.22
RNU6-272P-201ENST00000411028 NR1H3Q13133 447 aa7.43□□□□□ -1.22
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RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.41□□□□□ -1.22
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RNU6-272P-201ENST00000411028 CDCA8Q53HL2 280 aa7.4□□□□□ -1.22
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RNU6-272P-201ENST00000411028 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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RNU6-272P-201ENST00000411028 RNF40O75150 1001 aa7.38□□□□□ -1.23
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RNU6-272P-201ENST00000411028 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCDC27Q2M243 656 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 BRICD5Q6PL45 260 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 TK2O00142 265 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.35□□□□□ -1.23
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.35□□□□□ -1.23
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