RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 LAMC1P11047 1609 aa40.78■■■■■ 4.12
ANKRD54-203ENST00000407117 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
ANKRD54-203ENST00000407117 ORAI2Q96SN7 254 aa40.76■■■■■ 4.12
ANKRD54-203ENST00000407117 WAPLQ7Z5K2 1190 aa40.75■■■■■ 4.11
ANKRD54-203ENST00000407117 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
ANKRD54-203ENST00000407117 SIRT1Q96EB6 747 aa40.75■■■■■ 4.11
ANKRD54-203ENST00000407117 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
ANKRD54-203ENST00000407117 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.72■■■■■ 4.11
ANKRD54-203ENST00000407117 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.11
ANKRD54-203ENST00000407117 STAC3Q96MF2 364 aa40.69■■■■■ 4.1
ANKRD54-203ENST00000407117 PNPLA6Q8IY17 1366 aa40.69■■■■■ 4.1
ANKRD54-203ENST00000407117 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.69■■■■■ 4.1
ANKRD54-203ENST00000407117 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
ANKRD54-203ENST00000407117 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
ANKRD54-203ENST00000407117 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
ANKRD54-203ENST00000407117 ESCO1Q5FWF5 840 aa40.64■■■■■ 4.1
ANKRD54-203ENST00000407117 NPHP3Q7Z494 1330 aa40.62■■■■■ 4.09
ANKRD54-203ENST00000407117 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.6■■■■■ 4.09
ANKRD54-203ENST00000407117 DLC1Q96QB1 1528 aa40.57■■■■■ 4.09
ANKRD54-203ENST00000407117 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.55■■■■■ 4.08
ANKRD54-203ENST00000407117 ADGRB1O14514 1584 aa40.55■■■■■ 4.08
ANKRD54-203ENST00000407117 FMN2Q9NZ56 1722 aa40.55■■■■■ 4.08
ANKRD54-203ENST00000407117 PRAM1Q96QH2 718 aa40.53■■■■■ 4.08
ANKRD54-203ENST00000407117 NUTM2FA1L443 756 aa40.52■■■■■ 4.08
ANKRD54-203ENST00000407117 FOXO3O43524 673 aa40.5■■■■■ 4.07
ANKRD54-203ENST00000407117 PXDNQ92626 1479 aa40.5■■■■■ 4.07
ANKRD54-203ENST00000407117 POGKQ9P215 609 aa40.48■■■■■ 4.07
ANKRD54-203ENST00000407117 AFF2P51816 1311 aa40.47■■■■■ 4.07
ANKRD54-203ENST00000407117 KIF1AQ12756 1690 aa40.44■■■■■ 4.06
ANKRD54-203ENST00000407117 C8orf37Q96NL8 207 aa40.44■■■■■ 4.06
ANKRD54-203ENST00000407117 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
ANKRD54-203ENST00000407117 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP40.43■■■■■ 4.06
ANKRD54-203ENST00000407117 TRAK1Q9UPV9 953 aa40.42■■■■■ 4.06
ANKRD54-203ENST00000407117 ADAMTS2O95450 1211 aa40.39■■■■■ 4.06
ANKRD54-203ENST00000407117 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
ANKRD54-203ENST00000407117 ADGRB2O60241 1585 aa40.39■■■■■ 4.06
ANKRD54-203ENST00000407117 RXRBP28702 533 aa40.38■■■■■ 4.05
ANKRD54-203ENST00000407117 NGLY1Q96IV0 654 aa40.36■■■■■ 4.05
ANKRD54-203ENST00000407117 ANKARQ7Z5J8 1434 aa40.35■■■■■ 4.05
ANKRD54-203ENST00000407117 PHF8Q9UPP1 1060 aa40.35■■■■■ 4.05
ANKRD54-203ENST00000407117 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
ANKRD54-203ENST00000407117 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
ANKRD54-203ENST00000407117 KRT28Q7Z3Y7 464 aa40.3■■■■■ 4.04
ANKRD54-203ENST00000407117 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa40.3■■■■■ 4.04
ANKRD54-203ENST00000407117 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
ANKRD54-203ENST00000407117 PSME1Q06323 249 aa40.27■■■■■ 4.04
ANKRD54-203ENST00000407117 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
ANKRD54-203ENST00000407117 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
ANKRD54-203ENST00000407117 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
ANKRD54-203ENST00000407117 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
ANKRD54-203ENST00000407117 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
ANKRD54-203ENST00000407117 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.24■■■■■ 4.03
ANKRD54-203ENST00000407117 USP32Q8NFA0 1604 aa40.24■■■■■ 4.03
ANKRD54-203ENST00000407117 USP21Q9UK80 565 aa40.22■■■■■ 4.03
ANKRD54-203ENST00000407117 WASLO00401 505 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
ANKRD54-203ENST00000407117 TNS3Q68CZ2 1445 aa40.21■■■■■ 4.03
ANKRD54-203ENST00000407117 SBNO1A3KN83 1393 aa40.21■■■■■ 4.03
ANKRD54-203ENST00000407117 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
ANKRD54-203ENST00000407117 TULP4Q9NRJ4 1543 aa40.2■■■■■ 4.03
ANKRD54-203ENST00000407117 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa40.16■■■■■ 4.02
ANKRD54-203ENST00000407117 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
ANKRD54-203ENST00000407117 PRR36Q9H6K5 1346 aa40.15■■■■■ 4.02
ANKRD54-203ENST00000407117 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.02
ANKRD54-203ENST00000407117 ARHGEF10O15013 1369 aa40.13■■■■■ 4.02
ANKRD54-203ENST00000407117 RGS12O14924 1447 aa40.1■■■■■ 4.01
ANKRD54-203ENST00000407117 ATRNO75882 1429 aa40.09■■■■■ 4.01
ANKRD54-203ENST00000407117 GPRASP1Q5JY77 1395 aa40.09■■■■■ 4.01
ANKRD54-203ENST00000407117 NBPF1Q3BBV0 1214 aa40.08■■■■■ 4.01
ANKRD54-203ENST00000407117 BCL9LQ86UU0 1499 aa40.07■■■■■ 4.01
ANKRD54-203ENST00000407117 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.06■■■■■ 4
ANKRD54-203ENST00000407117 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
ANKRD54-203ENST00000407117 LMOD2Q6P5Q4 547 aa40.04■■■■■ 4
ANKRD54-203ENST00000407117 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP40.04■■■■■ 4
ANKRD54-203ENST00000407117 ATP7BP35670 1465 aa40.03■■■■■ 4
ANKRD54-203ENST00000407117 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
ANKRD54-203ENST00000407117 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
ANKRD54-203ENST00000407117 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.01■■■■■ 4
ANKRD54-203ENST00000407117 SLIT2O94813 1529 aa40.01■■■■□ 3.99
ANKRD54-203ENST00000407117 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
ANKRD54-203ENST00000407117 CABLES1Q8TDN4 633 aa39.99■■■■□ 3.99
ANKRD54-203ENST00000407117 CDK19Q9BWU1 502 aa39.99■■■■□ 3.99
ANKRD54-203ENST00000407117 ITSN1Q15811 1721 aa39.99■■■■□ 3.99
ANKRD54-203ENST00000407117 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
ANKRD54-203ENST00000407117 UNC5CLQ8IV45 518 aa39.96■■■■□ 3.99
ANKRD54-203ENST00000407117 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
ANKRD54-203ENST00000407117 NEUROD1Q13562 356 aa39.93■■■■□ 3.98
ANKRD54-203ENST00000407117 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
ANKRD54-203ENST00000407117 ABCA3Q99758 1704 aa39.93■■■■□ 3.98
ANKRD54-203ENST00000407117 ALS2Q96Q42 1657 aa39.92■■■■□ 3.98
ANKRD54-203ENST00000407117 CCDC61Q9Y6R9 512 aa39.91■■■■□ 3.98
ANKRD54-203ENST00000407117 PLEKHG5O94827 1062 aa39.89■■■■□ 3.98
ANKRD54-203ENST00000407117 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa39.86■■■■□ 3.97
ANKRD54-203ENST00000407117 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
ANKRD54-203ENST00000407117 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
ANKRD54-203ENST00000407117 ATAD2Q6PL18 1390 aa39.84■■■■□ 3.97
ANKRD54-203ENST00000407117 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa39.84■■■■□ 3.97
ANKRD54-203ENST00000407117 PLEKHG3A1L390 1219 aa39.84■■■■□ 3.97
ANKRD54-203ENST00000407117 NWD2Q9ULI1 1742 aa39.83■■■■□ 3.97
ANKRD54-203ENST00000407117 RALGAPBQ86X10 1494 aa39.82■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms