RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 CABP2Q9NPB3 220 aa27.76■■■□□ 2.03
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ODC1-202ENST00000405333 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.73■■■□□ 2.03
ODC1-202ENST00000405333 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
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ODC1-202ENST00000405333 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.68■■■□□ 2.02
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ODC1-202ENST00000405333 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.47■■□□□ 1.99
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ODC1-202ENST00000405333 C14orf37Q86TY3 774 aa27.35■■□□□ 1.97
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ODC1-202ENST00000405333 PPP2R1AP30153 589 aa27.31■■□□□ 1.96
ODC1-202ENST00000405333 NLRP13Q86W25 1043 aa27.31■■□□□ 1.96
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ODC1-202ENST00000405333 ACEP12821 1306 aa27.3■■□□□ 1.96
ODC1-202ENST00000405333 TMEM94Q12767 1356 aa27.3■■□□□ 1.96
ODC1-202ENST00000405333 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
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ODC1-202ENST00000405333 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
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ODC1-202ENST00000405333 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
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ODC1-202ENST00000405333 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.21■■□□□ 1.95
ODC1-202ENST00000405333 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
ODC1-202ENST00000405333 USP6P35125 1406 aa27.21■■□□□ 1.95
ODC1-202ENST00000405333 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
ODC1-202ENST00000405333 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.18■■□□□ 1.94
ODC1-202ENST00000405333 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.17■■□□□ 1.94
ODC1-202ENST00000405333 ORAI2Q96SN7 254 aa27.17■■□□□ 1.94
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