RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 DDIT3P35638 169 aa27.63■■■□□ 2.01
CLDN5-201ENST00000403084 RLBP1P12271 317 aa27.63■■■□□ 2.01
CLDN5-201ENST00000403084 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
CLDN5-201ENST00000403084 PDCL3Q9H2J4 239 aa27.6■■■□□ 2.01
CLDN5-201ENST00000403084 CEP152O94986 1710 aa27.6■■■□□ 2.01
CLDN5-201ENST00000403084 HSCBQ8IWL3 235 aa27.59■■■□□ 2.01
CLDN5-201ENST00000403084 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.59■■■□□ 2.01
CLDN5-201ENST00000403084 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.59■■■□□ 2.01
CLDN5-201ENST00000403084 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.59■■■□□ 2.01
CLDN5-201ENST00000403084 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.58■■■□□ 2.01
CLDN5-201ENST00000403084 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
CLDN5-201ENST00000403084 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.58■■■□□ 2.01
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CLDN5-201ENST00000403084 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
CLDN5-201ENST00000403084 TNNQ9UQP3 1299 aa27.57■■■□□ 2
CLDN5-201ENST00000403084 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.56■■■□□ 2
CLDN5-201ENST00000403084 GAS2L3Q86XJ1 694 aa27.56■■■□□ 2
CLDN5-201ENST00000403084 SHPRHQ149N8 1683 aa27.55■■■□□ 2
CLDN5-201ENST00000403084 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.55■■■□□ 2
CLDN5-201ENST00000403084 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CLDN5-201ENST00000403084 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
CLDN5-201ENST00000403084 SNX21Q969T3 373 aa27.52■■■□□ 2
CLDN5-201ENST00000403084 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
CLDN5-201ENST00000403084 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.52■■■□□ 2
CLDN5-201ENST00000403084 PTMSP20962 102 aa27.52■■■□□ 2
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CLDN5-201ENST00000403084 KANK1Q14678 1352 aa27.5■■□□□ 1.99
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CLDN5-201ENST00000403084 GBP4Q96PP9 640 aa27.5■■□□□ 1.99
CLDN5-201ENST00000403084 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.49■■□□□ 1.99
CLDN5-201ENST00000403084 WDR63Q8IWG1 891 aa27.49■■□□□ 1.99
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CLDN5-201ENST00000403084 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
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CLDN5-201ENST00000403084 STAC3Q96MF2 364 aa27.47■■□□□ 1.99
CLDN5-201ENST00000403084 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.47■■□□□ 1.99
CLDN5-201ENST00000403084 RUNDC1Q96C34 613 aa27.46■■□□□ 1.99
CLDN5-201ENST00000403084 TERF1P54274 439 aa27.44■■□□□ 1.98
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CLDN5-201ENST00000403084 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
CLDN5-201ENST00000403084 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
CLDN5-201ENST00000403084 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.44■■□□□ 1.98
CLDN5-201ENST00000403084 ERVK-7P63135 1459 aa27.43■■□□□ 1.98
CLDN5-201ENST00000403084 ZSCAN30Q86W11 494 aa27.43■■□□□ 1.98
CLDN5-201ENST00000403084 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27.43■■□□□ 1.98
CLDN5-201ENST00000403084 CCDC27Q2M243 656 aa27.42■■□□□ 1.98
CLDN5-201ENST00000403084 TRPM2O94759 1503 aa27.41■■□□□ 1.98
CLDN5-201ENST00000403084 SLC24A1O60721 1099 aa27.4■■□□□ 1.98
CLDN5-201ENST00000403084 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.4■■□□□ 1.98
CLDN5-201ENST00000403084 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
CLDN5-201ENST00000403084 NEUROD2Q15784 382 aa27.39■■□□□ 1.98
CLDN5-201ENST00000403084 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa27.39■■□□□ 1.98
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CLDN5-201ENST00000403084 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CLDN5-201ENST00000403084 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
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CLDN5-201ENST00000403084 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CLDN5-201ENST00000403084 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.34■■□□□ 1.97
CLDN5-201ENST00000403084 RIPK4P57078 832 aa27.34■■□□□ 1.97
CLDN5-201ENST00000403084 CLTCL1P53675 1640 aa27.33■■□□□ 1.97
CLDN5-201ENST00000403084 CLEC17AQ6ZS10 378 aa27.33■■□□□ 1.96
CLDN5-201ENST00000403084 MAP7D2Q96T17 732 aa27.33■■□□□ 1.96
CLDN5-201ENST00000403084 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CLDN5-201ENST00000403084 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.32■■□□□ 1.96
CLDN5-201ENST00000403084 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CLDN5-201ENST00000403084 MSNP26038 577 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
CLDN5-201ENST00000403084 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.3■■□□□ 1.96
CLDN5-201ENST00000403084 HS1BP3Q53T59 392 aa27.3■■□□□ 1.96
CLDN5-201ENST00000403084 PRDM4Q9UKN5 801 aa27.3■■□□□ 1.96
CLDN5-201ENST00000403084 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.3■■□□□ 1.96
CLDN5-201ENST00000403084 PTPRTO14522 1441 aa27.3■■□□□ 1.96
CLDN5-201ENST00000403084 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.3■■□□□ 1.96
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CLDN5-201ENST00000403084 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.28■■□□□ 1.96
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CLDN5-201ENST00000403084 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.27■■□□□ 1.96
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CLDN5-201ENST00000403084 TRIM27P14373 513 aa27.25■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 MORC1Q86VD1 984 aa27.25■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 ADGRL1O94910 1474 aa27.25■■□□□ 1.95
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CLDN5-201ENST00000403084 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.23■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF445P59923 1031 aa27.23■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 ABCA6Q8N139 1617 aa27.23■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.23■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 USP32Q8NFA0 1604 aa27.23■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.22■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 SSFA2P28290 1259 aa27.22■■□□□ 1.95
CLDN5-201ENST00000403084 RBM10P98175 930 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
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