RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 FBXO41Q8TF61 875 aa42.9■■■■■ 4.46
PKDCC-202ENST00000401498 POGKQ9P215 609 aa42.9■■■■■ 4.46
PKDCC-202ENST00000401498 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP42.89■■■■■ 4.46
PKDCC-202ENST00000401498 DCCP43146 1447 aa42.87■■■■■ 4.45
PKDCC-202ENST00000401498 ATF3P18847 181 aa42.86■■■■■ 4.45
PKDCC-202ENST00000401498 CADPS2Q86UW7 1296 aa42.85■■■■■ 4.45
PKDCC-202ENST00000401498 CARD11Q9BXL7 1154 aa42.84■■■■■ 4.45
PKDCC-202ENST00000401498 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa42.79■■■■■ 4.44
PKDCC-202ENST00000401498 PIP4K2BP78356 416 aa42.78■■■■■ 4.44
PKDCC-202ENST00000401498 SLAIN2Q9P270 581 aa42.78■■■■■ 4.44
PKDCC-202ENST00000401498 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
PKDCC-202ENST00000401498 MST1RQ04912 1400 aa42.73■■■■■ 4.43
PKDCC-202ENST00000401498 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
PKDCC-202ENST00000401498 ADGRB2O60241 1585 aa42.72■■■■■ 4.43
PKDCC-202ENST00000401498 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP42.72■■■■■ 4.43
PKDCC-202ENST00000401498 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
PKDCC-202ENST00000401498 QRICH2Q9H0J4 1663 aa42.68■■■■■ 4.42
PKDCC-202ENST00000401498 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
PKDCC-202ENST00000401498 FMN2Q9NZ56 1722 aa42.67■■■■■ 4.42
PKDCC-202ENST00000401498 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa42.65■■■■■ 4.42
PKDCC-202ENST00000401498 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
PKDCC-202ENST00000401498 C1orf167Q5SNV9 1468 aa42.64■■■■■ 4.42
PKDCC-202ENST00000401498 NUTM2FA1L443 756 aa42.61■■■■■ 4.41
PKDCC-202ENST00000401498 WASLO00401 505 aaPredicted RBP42.6■■■■■ 4.41
PKDCC-202ENST00000401498 BRINP3Q76B58 766 aa42.56■■■■■ 4.4
PKDCC-202ENST00000401498 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP42.55■■■■■ 4.4
PKDCC-202ENST00000401498 USP47Q96K76 1375 aa42.55■■■■■ 4.4
PKDCC-202ENST00000401498 ORAI2Q96SN7 254 aa42.53■■■■■ 4.4
PKDCC-202ENST00000401498 USP32Q8NFA0 1604 aa42.52■■■■■ 4.4
PKDCC-202ENST00000401498 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa42.52■■■■■ 4.4
PKDCC-202ENST00000401498 CDK19Q9BWU1 502 aa42.51■■■■■ 4.4
PKDCC-202ENST00000401498 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa42.49■■■■■ 4.39
PKDCC-202ENST00000401498 TULP4Q9NRJ4 1543 aa42.49■■■■■ 4.39
PKDCC-202ENST00000401498 ESCO1Q5FWF5 840 aa42.48■■■■■ 4.39
PKDCC-202ENST00000401498 ANKARQ7Z5J8 1434 aa42.47■■■■■ 4.39
PKDCC-202ENST00000401498 PRR36Q9H6K5 1346 aa42.46■■■■■ 4.39
PKDCC-202ENST00000401498 HSPA1LP34931 641 aa42.44■■■■■ 4.38
PKDCC-202ENST00000401498 TESK2Q96S53 571 aa42.43■■■■■ 4.38
PKDCC-202ENST00000401498 EVC2Q86UK5 1308 aa42.42■■■■■ 4.38
PKDCC-202ENST00000401498 ATP7BP35670 1465 aa42.41■■■■■ 4.38
PKDCC-202ENST00000401498 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
PKDCC-202ENST00000401498 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
PKDCC-202ENST00000401498 CABP2Q9NPB3 220 aa42.39■■■■■ 4.38
PKDCC-202ENST00000401498 NHSL1Q5SYE7 1610 aa42.38■■■■■ 4.38
PKDCC-202ENST00000401498 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
PKDCC-202ENST00000401498 PHLPP1O60346 1717 aa42.36■■■■■ 4.37
PKDCC-202ENST00000401498 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
PKDCC-202ENST00000401498 KIF1AQ12756 1690 aa42.34■■■■■ 4.37
PKDCC-202ENST00000401498 PHF8Q9UPP1 1060 aa42.34■■■■■ 4.37
PKDCC-202ENST00000401498 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP42.33■■■■■ 4.37
PKDCC-202ENST00000401498 ITSN1Q15811 1721 aa42.33■■■■■ 4.37
PKDCC-202ENST00000401498 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa42.31■■■■■ 4.36
PKDCC-202ENST00000401498 FOXO3O43524 673 aa42.3■■■■■ 4.36
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC61Q9Y6R9 512 aa42.3■■■■■ 4.36
PKDCC-202ENST00000401498 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
PKDCC-202ENST00000401498 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa42.29■■■■■ 4.36
PKDCC-202ENST00000401498 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
PKDCC-202ENST00000401498 SLC24A1O60721 1099 aa42.26■■■■■ 4.36
PKDCC-202ENST00000401498 NPHP3Q7Z494 1330 aa42.24■■■■■ 4.35
PKDCC-202ENST00000401498 DISP3Q9P2K9 1392 aa42.22■■■■■ 4.35
PKDCC-202ENST00000401498 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
PKDCC-202ENST00000401498 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa42.21■■■■■ 4.35
PKDCC-202ENST00000401498 PXDNQ92626 1479 aa42.2■■■■■ 4.35
PKDCC-202ENST00000401498 TMF1P82094 1093 aa42.19■■■■■ 4.34
PKDCC-202ENST00000401498 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
PKDCC-202ENST00000401498 PLEKHG3A1L390 1219 aa42.18■■■■■ 4.34
PKDCC-202ENST00000401498 ATAD2Q6PL18 1390 aa42.17■■■■■ 4.34
PKDCC-202ENST00000401498 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
PKDCC-202ENST00000401498 CABP1Q9NZU7 370 aa42.17■■■■■ 4.34
PKDCC-202ENST00000401498 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
PKDCC-202ENST00000401498 KRT28Q7Z3Y7 464 aa42.14■■■■■ 4.34
PKDCC-202ENST00000401498 PSME1Q06323 249 aa42.13■■■■■ 4.33
PKDCC-202ENST00000401498 ACEP12821 1306 aa42.13■■■■■ 4.33
PKDCC-202ENST00000401498 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP42.13■■■■■ 4.33
PKDCC-202ENST00000401498 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
PKDCC-202ENST00000401498 JCADQ9P266 1359 aa42.06■■■■■ 4.32
PKDCC-202ENST00000401498 CDCA8Q53HL2 280 aa42.04■■■■■ 4.32
PKDCC-202ENST00000401498 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
PKDCC-202ENST00000401498 SHPRHQ149N8 1683 aa42.03■■■■■ 4.32
PKDCC-202ENST00000401498 TMC1Q8TDI8 760 aa42.02■■■■■ 4.32
PKDCC-202ENST00000401498 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa42.02■■■■■ 4.32
PKDCC-202ENST00000401498 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa42■■■■■ 4.31
PKDCC-202ENST00000401498 SBNO1A3KN83 1393 aa42■■■■■ 4.31
PKDCC-202ENST00000401498 AKAP12Q02952 1782 aa41.98■■■■■ 4.31
PKDCC-202ENST00000401498 PNPLA6Q8IY17 1366 aa41.98■■■■■ 4.31
PKDCC-202ENST00000401498 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
PKDCC-202ENST00000401498 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
PKDCC-202ENST00000401498 TNS3Q68CZ2 1445 aa41.96■■■■■ 4.31
PKDCC-202ENST00000401498 CD163L1Q9NR16 1453 aa41.96■■■■■ 4.31
PKDCC-202ENST00000401498 NINLQ9Y2I6 1382 aa41.94■■■■■ 4.3
PKDCC-202ENST00000401498 USP6P35125 1406 aa41.93■■■■■ 4.3
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP41.93■■■■■ 4.3
PKDCC-202ENST00000401498 ALS2Q96Q42 1657 aa41.92■■■■■ 4.3
PKDCC-202ENST00000401498 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
PKDCC-202ENST00000401498 MYOM1P52179 1685 aa41.9■■■■■ 4.3
PKDCC-202ENST00000401498 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
PKDCC-202ENST00000401498 MON2Q7Z3U7 1717 aa41.88■■■■■ 4.3
PKDCC-202ENST00000401498 SSH2Q76I76 1423 aa41.87■■■■■ 4.29
PKDCC-202ENST00000401498 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP41.87■■■■■ 4.29
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