RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 MST1RQ04912 1400 aa29.29■■■□□ 2.28
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CLDN3-201ENST00000395145 PRAM1Q96QH2 718 aa29.27■■■□□ 2.28
CLDN3-201ENST00000395145 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.24■■■□□ 2.27
CLDN3-201ENST00000395145 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
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CLDN3-201ENST00000395145 HSPA1LP34931 641 aa29.22■■■□□ 2.27
CLDN3-201ENST00000395145 ADGRB2O60241 1585 aa29.22■■■□□ 2.27
CLDN3-201ENST00000395145 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.21■■■□□ 2.27
CLDN3-201ENST00000395145 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.2■■■□□ 2.26
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CLDN3-201ENST00000395145 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.17■■■□□ 2.26
CLDN3-201ENST00000395145 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.17■■■□□ 2.26
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CLDN3-201ENST00000395145 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
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CLDN3-201ENST00000395145 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
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CLDN3-201ENST00000395145 KIF1AQ12756 1690 aa29.02■■■□□ 2.24
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CLDN3-201ENST00000395145 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
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CLDN3-201ENST00000395145 SHPRHQ149N8 1683 aa28.93■■■□□ 2.22
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CLDN3-201ENST00000395145 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.82■■■□□ 2.2
CLDN3-201ENST00000395145 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.82■■■□□ 2.2
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CLDN3-201ENST00000395145 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
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CLDN3-201ENST00000395145 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
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CLDN3-201ENST00000395145 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
CLDN3-201ENST00000395145 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
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