RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 STRCQ7RTU9 1775 aa32.27■■■□□ 2.76
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CNN3-202ENST00000394202 EVC2Q86UK5 1308 aa32.24■■■□□ 2.75
CNN3-202ENST00000394202 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
CNN3-202ENST00000394202 PTCH1Q13635 1447 aa32.23■■■□□ 2.75
CNN3-202ENST00000394202 CABP2Q9NPB3 220 aa32.22■■■□□ 2.75
CNN3-202ENST00000394202 CDK19Q9BWU1 502 aa32.18■■■□□ 2.74
CNN3-202ENST00000394202 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
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CNN3-202ENST00000394202 MYOM1P52179 1685 aa32.12■■■□□ 2.73
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CNN3-202ENST00000394202 STRCP1A6NGW2 1772 aa32.05■■■□□ 2.72
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CNN3-202ENST00000394202 NUTM2FA1L443 756 aa32.01■■■□□ 2.72
CNN3-202ENST00000394202 PRR36Q9H6K5 1346 aa32.01■■■□□ 2.71
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CNN3-202ENST00000394202 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.99■■■□□ 2.71
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CNN3-202ENST00000394202 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.96■■■□□ 2.71
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CNN3-202ENST00000394202 C14orf37Q86TY3 774 aa31.93■■■□□ 2.7
CNN3-202ENST00000394202 CCDC61Q9Y6R9 512 aa31.93■■■□□ 2.7
CNN3-202ENST00000394202 TMEM94Q12767 1356 aa31.92■■■□□ 2.7
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CNN3-202ENST00000394202 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa31.9■■■□□ 2.7
CNN3-202ENST00000394202 KNSTRNQ9Y448 316 aa31.9■■■□□ 2.7
CNN3-202ENST00000394202 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa31.89■■■□□ 2.7
CNN3-202ENST00000394202 A0A1W2PP64 1363 aa31.89■■■□□ 2.7
CNN3-202ENST00000394202 USP32Q8NFA0 1604 aa31.88■■■□□ 2.69
CNN3-202ENST00000394202 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
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CNN3-202ENST00000394202 C19orf44Q9H6X5 657 aa31.84■■■□□ 2.69
CNN3-202ENST00000394202 TERF2IPQ9NYB0 399 aa31.84■■■□□ 2.69
CNN3-202ENST00000394202 FMN2Q9NZ56 1722 aa31.83■■■□□ 2.69
CNN3-202ENST00000394202 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.82■■■□□ 2.68
CNN3-202ENST00000394202 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
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CNN3-202ENST00000394202 ANKARQ7Z5J8 1434 aa31.79■■■□□ 2.68
CNN3-202ENST00000394202 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa31.79■■■□□ 2.68
CNN3-202ENST00000394202 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
CNN3-202ENST00000394202 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
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CNN3-202ENST00000394202 PARD3Q8TEW0 1356 aa31.74■■■□□ 2.67
CNN3-202ENST00000394202 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa31.72■■■□□ 2.67
CNN3-202ENST00000394202 CCDC184Q52MB2 194 aa31.72■■■□□ 2.67
CNN3-202ENST00000394202 RALBP1Q15311 655 aa31.71■■■□□ 2.67
CNN3-202ENST00000394202 CGNL1Q0VF96 1302 aa31.71■■■□□ 2.67
CNN3-202ENST00000394202 ATF3P18847 181 aa31.7■■■□□ 2.67
CNN3-202ENST00000394202 ESCO1Q5FWF5 840 aa31.7■■■□□ 2.66
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CNN3-202ENST00000394202 ITSN1Q15811 1721 aa31.69■■■□□ 2.66
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CNN3-202ENST00000394202 CCER2I3L3R5 266 aa31.68■■■□□ 2.66
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CNN3-202ENST00000394202 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.63■■■□□ 2.65
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CNN3-202ENST00000394202 SSH2Q76I76 1423 aa31.59■■■□□ 2.65
CNN3-202ENST00000394202 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa31.59■■■□□ 2.65
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