RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 LCE2BO14633 110 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 MMP16P51512 607 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIM66O15016 1216 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 GDF9O60383 454 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 GUCA2AQ02747 115 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 AK7Q96M32 723 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-601P-201ENST00000384540 FDX1P10109 184 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 RETREG3Q86VR2 466 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 TNFRSF10AO00220 468 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 JUNDP17535 347 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 BEGAINQ9BUH8 593 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 DGAT1O75907 488 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 MS4A1P11836 297 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 GJA5P36382 358 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC24A1O60721 1099 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 NDUFV2P19404 249 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 PDE4DQ08499 809 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 FOXC1Q12948 553 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIM32Q13049 653 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 PKDCCQ504Y2 493 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM187AA6NFU0 413 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 C6orf229H3BNL8 230 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYT1Q01538 1121 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 BCANQ96GW7 911 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 WNT7AO00755 349 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPTLC1O15269 473 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 MTMR2Q13614 643 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 PTPRNQ16849 979 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 CYP4X1Q8N118 509 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 WNT7BP56706 349 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 DESI1Q6ICB0 168 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRR7Q8TB68 274 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 AVPP01185 164 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 SKOR1P84550 965 aa6.91□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-601P-201ENST00000384540 HRCP23327 699 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 CFAP99D6REC4 459 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 AAASQ9NRG9 546 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.88□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 ST8SIA5O15466 376 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMPD1P17405 629 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 KCNH2Q12809 1159 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF787Q6DD87 383 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 LYPD8Q6UX82 237 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 CABLES1Q8TDN4 633 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 SH3BP2P78314 561 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 J3QL48 77 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 AXIN1O15169 862 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 LILRB3O75022 631 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 QPCTQ16769 361 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-601P-201ENST00000384540 SIAH2O43255 324 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-601P-201ENST00000384540 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-601P-201ENST00000384540 LINC01559Q495D7 138 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF511Q8NB15 262 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-601P-201ENST00000384540 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-601P-201ENST00000384540 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-601P-201ENST00000384540 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-601P-201ENST00000384540 POTECB2RU33 542 aa6.81□□□□□ -1.32
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