RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382387.3

C9orf66-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 66, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf66, Length 2,918 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf66-201ENST00000382387 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.09■■□□□ 1.29
C9orf66-201ENST00000382387 ASXL2Q76L83 1435 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 IFT172Q9UG01 1749 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.07■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 PDE3AQ14432 1141 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 SLC24A1O60721 1099 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 USP19O94966 1318 aa23.06■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 RUNDC1Q96C34 613 aa23.05■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.05■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 NPATQ14207 1427 aa23.04■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.04■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.04■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.04■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 SHPRHQ149N8 1683 aa23.03■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
C9orf66-201ENST00000382387 ADGRB3O60242 1522 aa23.01■■□□□ 1.27
C9orf66-201ENST00000382387 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23■■□□□ 1.27
C9orf66-201ENST00000382387 CABP2Q9NPB3 220 aa23■■□□□ 1.27
C9orf66-201ENST00000382387 GSE1Q14687 1217 aa23■■□□□ 1.27
C9orf66-201ENST00000382387 NGEFQ8N5V2 710 aa22.99■■□□□ 1.27
C9orf66-201ENST00000382387 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.99■■□□□ 1.27
C9orf66-201ENST00000382387 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
C9orf66-201ENST00000382387 ADGRB1O14514 1584 aa22.98■■□□□ 1.27
C9orf66-201ENST00000382387 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
C9orf66-201ENST00000382387 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
C9orf66-201ENST00000382387 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.97■■□□□ 1.27
C9orf66-201ENST00000382387 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.97■■□□□ 1.27
C9orf66-201ENST00000382387 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.95■■□□□ 1.27
C9orf66-201ENST00000382387 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
C9orf66-201ENST00000382387 STK26Q9P289 416 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf66-201ENST00000382387 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf66-201ENST00000382387 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf66-201ENST00000382387 RAPGEF3O95398 923 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf66-201ENST00000382387 WDR63Q8IWG1 891 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf66-201ENST00000382387 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf66-201ENST00000382387 PPLO60437 1756 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf66-201ENST00000382387 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf66-201ENST00000382387 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
C9orf66-201ENST00000382387 CFAP53Q96M91 514 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf66-201ENST00000382387 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf66-201ENST00000382387 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.9■■□□□ 1.26
C9orf66-201ENST00000382387 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
C9orf66-201ENST00000382387 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.89■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 EVC2Q86UK5 1308 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.88■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 CD109Q6YHK3 1445 aa22.87■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.86■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 NLRP1Q9C000 1473 aa22.86■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.85■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 CCDC27Q2M243 656 aa22.85■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa22.85■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 GLI2P10070 1586 aa22.85■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 IDI1Q13907 227 aa22.85■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.84■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 A0A1W2PP64 1363 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 ABCC3O15438 1527 aa22.83■■□□□ 1.25
C9orf66-201ENST00000382387 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 FBLN1P23142 703 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.81■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.8■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.8■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.8■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.8■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 TRIM27P14373 513 aa22.79■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.79■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.78■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 POGKQ9P215 609 aa22.78■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 FYB1O15117 783 aa22.77■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.77■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 USP32Q8NFA0 1604 aa22.77■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.77■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.77■■□□□ 1.24
C9orf66-201ENST00000382387 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf66-201ENST00000382387 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf66-201ENST00000382387 PRAM1Q96QH2 718 aa22.75■■□□□ 1.23
C9orf66-201ENST00000382387 BECN1Q14457 450 aa22.74■■□□□ 1.23
C9orf66-201ENST00000382387 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
C9orf66-201ENST00000382387 ABCC11Q96J66 1382 aa22.73■■□□□ 1.23
C9orf66-201ENST00000382387 RIPK4P57078 832 aa22.73■■□□□ 1.23
C9orf66-201ENST00000382387 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms