RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375850.3

C9orf47-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 47, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene C9orf47, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47-202ENST00000375850 TECPR2O15040 1411 aa34.59■■■■□ 3.13
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C9orf47-202ENST00000375850 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
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C9orf47-202ENST00000375850 ABCC11Q96J66 1382 aa34.54■■■■□ 3.12
C9orf47-202ENST00000375850 ADAMTS2O95450 1211 aa34.52■■■■□ 3.12
C9orf47-202ENST00000375850 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.52■■■■□ 3.12
C9orf47-202ENST00000375850 PIK3C2GO75747 1445 aa34.5■■■■□ 3.11
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C9orf47-202ENST00000375850 IFT172Q9UG01 1749 aa34.47■■■■□ 3.11
C9orf47-202ENST00000375850 RGS12O14924 1447 aa34.46■■■■□ 3.11
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C9orf47-202ENST00000375850 SIRT1Q96EB6 747 aa34.45■■■■□ 3.11
C9orf47-202ENST00000375850 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
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C9orf47-202ENST00000375850 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.43■■■■□ 3.1
C9orf47-202ENST00000375850 MYOM2P54296 1465 aa34.41■■■■□ 3.1
C9orf47-202ENST00000375850 PXDNQ92626 1479 aa34.41■■■■□ 3.1
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C9orf47-202ENST00000375850 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.4■■■■□ 3.1
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C9orf47-202ENST00000375850 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.34■■■■□ 3.09
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C9orf47-202ENST00000375850 NUTM2FA1L443 756 aa34.31■■■■□ 3.08
C9orf47-202ENST00000375850 ATAD2Q6PL18 1390 aa34.31■■■■□ 3.08
C9orf47-202ENST00000375850 KIF1AQ12756 1690 aa34.29■■■■□ 3.08
C9orf47-202ENST00000375850 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
C9orf47-202ENST00000375850 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.29■■■■□ 3.08
C9orf47-202ENST00000375850 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.27■■■■□ 3.08
C9orf47-202ENST00000375850 CFAP70Q5T0N1 1121 aa34.25■■■■□ 3.07
C9orf47-202ENST00000375850 BCL9LQ86UU0 1499 aa34.24■■■■□ 3.07
C9orf47-202ENST00000375850 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa34.23■■■■□ 3.07
C9orf47-202ENST00000375850 PSME1Q06323 249 aa34.22■■■■□ 3.07
C9orf47-202ENST00000375850 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.22■■■■□ 3.07
C9orf47-202ENST00000375850 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.21■■■■□ 3.07
C9orf47-202ENST00000375850 DLC1Q96QB1 1528 aa34.2■■■■□ 3.06
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C9orf47-202ENST00000375850 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
C9orf47-202ENST00000375850 STAC3Q96MF2 364 aa34.18■■■■□ 3.06
C9orf47-202ENST00000375850 PRAM1Q96QH2 718 aa34.18■■■■□ 3.06
C9orf47-202ENST00000375850 POGKQ9P215 609 aa34.16■■■■□ 3.06
C9orf47-202ENST00000375850 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.15■■■■□ 3.06
C9orf47-202ENST00000375850 UNC5CLQ8IV45 518 aa34.15■■■■□ 3.06
C9orf47-202ENST00000375850 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.14■■■■□ 3.06
C9orf47-202ENST00000375850 SBNO1A3KN83 1393 aa34.14■■■■□ 3.06
C9orf47-202ENST00000375850 CCDC125Q86Z20 511 aa34.14■■■■□ 3.06
C9orf47-202ENST00000375850 SLIT2O94813 1529 aa34.14■■■■□ 3.06
C9orf47-202ENST00000375850 ARHGEF10O15013 1369 aa34.11■■■■□ 3.05
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C9orf47-202ENST00000375850 LMOD2Q6P5Q4 547 aa33.99■■■■□ 3.03
C9orf47-202ENST00000375850 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa33.98■■■■□ 3.03
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C9orf47-202ENST00000375850 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.97■■■■□ 3.03
C9orf47-202ENST00000375850 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa33.97■■■■□ 3.03
C9orf47-202ENST00000375850 GLI3P10071 1580 aa33.97■■■■□ 3.03
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C9orf47-202ENST00000375850 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
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C9orf47-202ENST00000375850 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
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C9orf47-202ENST00000375850 ATP7BP35670 1465 aa33.76■■■□□ 2.99
C9orf47-202ENST00000375850 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
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