RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 QPCTQ16769 361 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.27□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 LILRB3O75022 631 aa8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 GFRA3O60609 400 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 NR1I2O75469 434 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 HRCP23327 699 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 COPS2P61201 443 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 MTRQ99707 1265 aa8.25□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 LAPTM4AQ15012 233 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 Q3C1V9 767 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 C6orf229H3BNL8 230 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 MTMR2Q13614 643 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 BRICD5Q6PL45 260 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 THAP11Q96EK4 314 aa8.23□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.22□□□□□ -1.09
RABGGTB-202ENST00000370826 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 ZPR1O75312 459 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 RFC5P40937 340 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF516Q92618 1163 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 IL21Q9HBE4 155 aa8.21□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 LCE2BO14633 110 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 RETREG3Q86VR2 466 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 CFAP99D6REC4 459 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 SPSB2Q99619 263 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 PRR7Q8TB68 274 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 TLL1O43897 1013 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 AP1G2O75843 785 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 ADH1BP00325 375 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 BANK1Q8NDB2 785 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGGTB-202ENST00000370826 CTDSPL2Q05D32 466 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 MSS51Q4VC12 460 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 DESI1Q6ICB0 168 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 TSC1Q92574 1164 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
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RABGGTB-202ENST00000370826 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 SNRKQ9NRH2 765 aa8.12□□□□□ -1.11
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RABGGTB-202ENST00000370826 MMP16P51512 607 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 FLIIQ13045 1269 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 LYPD8Q6UX82 237 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.11□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 USP17L8P0C7I0 530 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 MCM6Q14566 821 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 S1PR4O95977 384 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGGTB-202ENST00000370826 PTPRNQ16849 979 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-202ENST00000370826 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGGTB-202ENST00000370826 GGCXP38435 758 aa8.07□□□□□ -1.12
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF787Q6DD87 383 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-202ENST00000370826 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-202ENST00000370826 SOCS7O14512 581 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-202ENST00000370826 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-202ENST00000370826 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-202ENST00000370826 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-202ENST00000370826 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-202ENST00000370826 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-202ENST00000370826 EPS8L1Q8TE68 723 aa8.04□□□□□ -1.12
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM34Q9BYJ4 488 aa8.04□□□□□ -1.12
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RABGGTB-202ENST00000370826 C14orf37Q86TY3 774 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.03□□□□□ -1.12
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNH2Q12809 1159 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP10Q9P2G4 905 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-202ENST00000370826 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-202ENST00000370826 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
RABGGTB-202ENST00000370826 APBB1O00213 710 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-202ENST00000370826 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-202ENST00000370826 CTHP32929 405 aa8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-202ENST00000370826 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
RABGGTB-202ENST00000370826 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.01□□□□□ -1.13
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