RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369031.4

PDSS2-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS2, Length 1,236 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2-201ENST00000369031 RALGAPBQ86X10 1494 aa23■■□□□ 1.27
PDSS2-201ENST00000369031 C19orf44Q9H6X5 657 aa23■■□□□ 1.27
PDSS2-201ENST00000369031 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
PDSS2-201ENST00000369031 PRAM1Q96QH2 718 aa22.99■■□□□ 1.27
PDSS2-201ENST00000369031 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PDSS2-201ENST00000369031 ATF3P18847 181 aa22.96■■□□□ 1.27
PDSS2-201ENST00000369031 MST1RQ04912 1400 aa22.96■■□□□ 1.27
PDSS2-201ENST00000369031 ADGRB2O60241 1585 aa22.96■■□□□ 1.27
PDSS2-201ENST00000369031 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.96■■□□□ 1.27
PDSS2-201ENST00000369031 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.94■■□□□ 1.26
PDSS2-201ENST00000369031 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.94■■□□□ 1.26
PDSS2-201ENST00000369031 SIRT1Q96EB6 747 aa22.94■■□□□ 1.26
PDSS2-201ENST00000369031 POGKQ9P215 609 aa22.94■■□□□ 1.26
PDSS2-201ENST00000369031 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.93■■□□□ 1.26
PDSS2-201ENST00000369031 SLAIN2Q9P270 581 aa22.91■■□□□ 1.26
PDSS2-201ENST00000369031 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
PDSS2-201ENST00000369031 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.89■■□□□ 1.25
PDSS2-201ENST00000369031 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PDSS2-201ENST00000369031 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.88■■□□□ 1.25
PDSS2-201ENST00000369031 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PDSS2-201ENST00000369031 USP32Q8NFA0 1604 aa22.87■■□□□ 1.25
PDSS2-201ENST00000369031 NUTM2FA1L443 756 aa22.86■■□□□ 1.25
PDSS2-201ENST00000369031 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.86■■□□□ 1.25
PDSS2-201ENST00000369031 PHLPP1O60346 1717 aa22.85■■□□□ 1.25
PDSS2-201ENST00000369031 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PDSS2-201ENST00000369031 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.84■■□□□ 1.25
PDSS2-201ENST00000369031 HSPA1LP34931 641 aa22.84■■□□□ 1.25
PDSS2-201ENST00000369031 BRINP3Q76B58 766 aa22.83■■□□□ 1.25
PDSS2-201ENST00000369031 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PDSS2-201ENST00000369031 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PDSS2-201ENST00000369031 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.82■■□□□ 1.24
PDSS2-201ENST00000369031 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PDSS2-201ENST00000369031 ORAI2Q96SN7 254 aa22.8■■□□□ 1.24
PDSS2-201ENST00000369031 KIF1AQ12756 1690 aa22.78■■□□□ 1.24
PDSS2-201ENST00000369031 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.77■■□□□ 1.24
PDSS2-201ENST00000369031 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PDSS2-201ENST00000369031 ATP7BP35670 1465 aa22.77■■□□□ 1.24
PDSS2-201ENST00000369031 ITSN1Q15811 1721 aa22.77■■□□□ 1.23
PDSS2-201ENST00000369031 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.76■■□□□ 1.23
PDSS2-201ENST00000369031 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
PDSS2-201ENST00000369031 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.76■■□□□ 1.23
PDSS2-201ENST00000369031 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.75■■□□□ 1.23
PDSS2-201ENST00000369031 USP47Q96K76 1375 aa22.74■■□□□ 1.23
PDSS2-201ENST00000369031 CDK19Q9BWU1 502 aa22.72■■□□□ 1.23
PDSS2-201ENST00000369031 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.69■■□□□ 1.22
PDSS2-201ENST00000369031 PXDNQ92626 1479 aa22.68■■□□□ 1.22
PDSS2-201ENST00000369031 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PDSS2-201ENST00000369031 CABP2Q9NPB3 220 aa22.67■■□□□ 1.22
PDSS2-201ENST00000369031 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.67■■□□□ 1.22
PDSS2-201ENST00000369031 SHPRHQ149N8 1683 aa22.66■■□□□ 1.22
PDSS2-201ENST00000369031 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.66■■□□□ 1.22
PDSS2-201ENST00000369031 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
PDSS2-201ENST00000369031 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
PDSS2-201ENST00000369031 EVC2Q86UK5 1308 aa22.65■■□□□ 1.22
PDSS2-201ENST00000369031 FOXO3O43524 673 aa22.65■■□□□ 1.22
PDSS2-201ENST00000369031 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.65■■□□□ 1.22
PDSS2-201ENST00000369031 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.63■■□□□ 1.21
PDSS2-201ENST00000369031 TESK2Q96S53 571 aa22.63■■□□□ 1.21
PDSS2-201ENST00000369031 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PDSS2-201ENST00000369031 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa22.62■■□□□ 1.21
PDSS2-201ENST00000369031 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PDSS2-201ENST00000369031 JCADQ9P266 1359 aa22.6■■□□□ 1.21
PDSS2-201ENST00000369031 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PDSS2-201ENST00000369031 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.59■■□□□ 1.21
PDSS2-201ENST00000369031 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.57■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.57■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.56■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 AKAP12Q02952 1782 aa22.55■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.55■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 ALS2Q96Q42 1657 aa22.55■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 LRP6O75581 1613 aa22.54■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.54■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 ACEP12821 1306 aa22.54■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 PSME1Q06323 249 aa22.53■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 ABCA3Q99758 1704 aa22.52■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.52■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 CABP1Q9NZU7 370 aa22.52■■□□□ 1.2
PDSS2-201ENST00000369031 MYOM1P52179 1685 aa22.51■■□□□ 1.19
PDSS2-201ENST00000369031 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.51■■□□□ 1.19
PDSS2-201ENST00000369031 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.51■■□□□ 1.19
PDSS2-201ENST00000369031 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.5■■□□□ 1.19
PDSS2-201ENST00000369031 SBNO1A3KN83 1393 aa22.5■■□□□ 1.19
PDSS2-201ENST00000369031 TMF1P82094 1093 aa22.49■■□□□ 1.19
PDSS2-201ENST00000369031 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.47■■□□□ 1.19
PDSS2-201ENST00000369031 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.47■■□□□ 1.19
PDSS2-201ENST00000369031 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.47■■□□□ 1.19
PDSS2-201ENST00000369031 USP6P35125 1406 aa22.47■■□□□ 1.19
PDSS2-201ENST00000369031 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PDSS2-201ENST00000369031 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PDSS2-201ENST00000369031 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PDSS2-201ENST00000369031 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PDSS2-201ENST00000369031 PLEKHG5O94827 1062 aa22.45■■□□□ 1.18
PDSS2-201ENST00000369031 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.45■■□□□ 1.18
PDSS2-201ENST00000369031 TMC1Q8TDI8 760 aa22.45■■□□□ 1.18
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