RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 PRDM2Q13029 1718 aa24.62■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 GNAI3P08754 354 aa24.62■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 CDC45O75419 566 aa24.61■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 CFTRP13569 1480 aa24.6■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.59■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.59■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.59■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 PRKAR2BP31323 418 aa24.58■■□□□ 1.53
CCSAP-203ENST00000366687 ERICH2A1L162 156 aa24.58■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.58■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.58■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.57■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.56■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 ABTB2Q8N961 1025 aa24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 PDE4CQ08493 712 aa24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 PRAM1Q96QH2 718 aa24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.55■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 PDE3AQ14432 1141 aa24.54■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 RAD21O60216 631 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.53■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 WASHC4Q2M389 1173 aa24.52■■□□□ 1.52
CCSAP-203ENST00000366687 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 CNTROBQ8N137 903 aa24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.5■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 PSMA5P28066 241 aa24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.48■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 PRXQ9BXM0 1461 aa24.47■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 FSD1Q9BTV5 496 aa24.47■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.46■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 GCC1Q96CN9 775 aa24.46■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CCSAP-203ENST00000366687 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 WWC1Q8IX03 1113 aa24.45■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.44■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.44■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 CABP1Q9NZU7 370 aa24.43■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 GPS2Q13227 327 aa24.43■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF592Q92610 1267 aa24.43■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 MCM2P49736 904 aa24.42■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 CDK19Q9BWU1 502 aa24.42■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 GNAI2P04899 355 aa24.42■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 NFKBIBQ15653 356 aa24.42■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.42■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 WDR63Q8IWG1 891 aa24.41■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 FBXW7Q969H0 707 aa24.41■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 HIP1O00291 1037 aa24.41■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.41■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 IFT140Q96RY7 1462 aa24.41■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 HOMER1Q86YM7 354 aa24.41■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.41■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.4■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 SYNJ1O43426 1573 aa24.4■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.39■■□□□ 1.5
CCSAP-203ENST00000366687 XBP1P17861 261 aa24.39■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 NEK4P51957 841 aa24.39■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 SLC4A2P04920 1241 aa24.39■■□□□ 1.49
CCSAP-203ENST00000366687 PDCP20941 246 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms