RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q3C1V9 767 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 NYAP1Q6ZVC0 841 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYT1LQ9UL68 1186 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPDYE5A6NIY4 337 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 NR1I2O75469 434 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 MCM6Q14566 821 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM259Q4ZIN3 620 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 AP1G2O75843 785 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPN5P54829 565 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 BANK1Q8NDB2 785 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSC1Q92574 1164 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDH10Q9P2E7 1040 aa5.49□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 RETREG3Q86VR2 466 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFAP99D6REC4 459 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 APBB1O00213 710 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP17L8P0C7I0 530 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBTFP17480 764 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 COPS2P61201 443 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRR7Q8TB68 274 aa5.47□□□□□ -1.53
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCUBE3Q8IX30 993 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTRQ99707 1265 aa5.46□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 BRICD5Q6PL45 260 aa5.45□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTMR14Q8NCE2 650 aa5.45□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNRKQ9NRH2 765 aa5.45□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 SOCS7O14512 581 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 TLL1O43897 1013 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAD21O60216 631 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPNS2Q8IVW8 549 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 THAP11Q96EK4 314 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPSB2Q99619 263 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZMYND15Q9H091 742 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL21Q9HBE4 155 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZPR1O75312 459 aa5.43□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTDSPL2Q05D32 466 aa5.43□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 DESI1Q6ICB0 168 aa5.43□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 HCSTQ9UBK5 93 aa5.43□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADH1BP00325 375 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 JUNDP17535 347 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 MSS51Q4VC12 460 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 TJAP1Q5JTD0 557 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRN4Q8WUT4 740 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLUAP1Q96AJ1 413 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRM3Q9NNZ6 103 aa5.42□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 A6NJR5 290 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 POM121Q96HA1 1249 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRDM9Q9NQV7 894 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 COG6Q9Y2V7 657 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 DXOO77932 396 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPRNQ16849 979 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 LYPD8Q6UX82 237 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF516Q92618 1163 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABL2P42684 1182 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 WWC1Q8IX03 1113 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM34Q9BYJ4 488 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC6A16Q9GZN6 736 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 GDPD2Q9HCC8 539 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCNYL3P0C7X3 344 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMP16P51512 607 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNC4Q03721 635 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNMA1Q8ND90 353 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUDT12Q9BQG2 462 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 S1PR4O95977 384 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 CTHP32929 405 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 MMRN1Q13201 1228 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 NR6A1Q15406 480 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAP10Q9P2G4 905 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAK2O60296 914 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 F12P00748 615 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 NKX2-3Q8TAU0 364 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPS8L1Q8TE68 723 aa5.36□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC24Q8N4L8 307 aa5.35□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPR37L1O60883 481 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 GGCXP38435 758 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNH2Q12809 1159 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 EVA1BQ9NVM1 165 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 FKBPLQ9UIM3 349 aa5.34□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms