RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360476.7

NMB-201, Transcript of neuromedin B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NMB, Length 1,007 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMB-201ENST00000360476 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
NMB-201ENST00000360476 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
NMB-201ENST00000360476 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.43■■■■■ 4.06
NMB-201ENST00000360476 WAPLQ7Z5K2 1190 aa40.42■■■■■ 4.06
NMB-201ENST00000360476 C8orf37Q96NL8 207 aa40.42■■■■■ 4.06
NMB-201ENST00000360476 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa40.42■■■■■ 4.06
NMB-201ENST00000360476 FMN2Q9NZ56 1722 aa40.4■■■■■ 4.06
NMB-201ENST00000360476 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
NMB-201ENST00000360476 RXRBP28702 533 aa40.38■■■■■ 4.05
NMB-201ENST00000360476 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.36■■■■■ 4.05
NMB-201ENST00000360476 ABCC11Q96J66 1382 aa40.35■■■■■ 4.05
NMB-201ENST00000360476 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
NMB-201ENST00000360476 PXDNQ92626 1479 aa40.35■■■■■ 4.05
NMB-201ENST00000360476 ADAMTS2O95450 1211 aa40.35■■■■■ 4.05
NMB-201ENST00000360476 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
NMB-201ENST00000360476 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
NMB-201ENST00000360476 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.34■■■■■ 4.05
NMB-201ENST00000360476 ESCO1Q5FWF5 840 aa40.33■■■■■ 4.05
NMB-201ENST00000360476 NUTM2FA1L443 756 aa40.32■■■■■ 4.05
NMB-201ENST00000360476 MYOM2P54296 1465 aa40.31■■■■■ 4.04
NMB-201ENST00000360476 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
NMB-201ENST00000360476 RGS12O14924 1447 aa40.28■■■■■ 4.04
NMB-201ENST00000360476 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
NMB-201ENST00000360476 NPHP3Q7Z494 1330 aa40.26■■■■■ 4.04
NMB-201ENST00000360476 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP40.25■■■■■ 4.03
NMB-201ENST00000360476 KIF1AQ12756 1690 aa40.24■■■■■ 4.03
NMB-201ENST00000360476 NGLY1Q96IV0 654 aa40.24■■■■■ 4.03
NMB-201ENST00000360476 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
NMB-201ENST00000360476 FOXO3O43524 673 aa40.23■■■■■ 4.03
NMB-201ENST00000360476 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
NMB-201ENST00000360476 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.22■■■■■ 4.03
NMB-201ENST00000360476 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
NMB-201ENST00000360476 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
NMB-201ENST00000360476 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
NMB-201ENST00000360476 ADGRB1O14514 1584 aa40.11■■■■■ 4.01
NMB-201ENST00000360476 USP21Q9UK80 565 aa40.11■■■■■ 4.01
NMB-201ENST00000360476 USP32Q8NFA0 1604 aa40.09■■■■■ 4.01
NMB-201ENST00000360476 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP40.09■■■■■ 4.01
NMB-201ENST00000360476 SIRT1Q96EB6 747 aa40.09■■■■■ 4.01
NMB-201ENST00000360476 ATRNO75882 1429 aa40.08■■■■■ 4.01
NMB-201ENST00000360476 DLC1Q96QB1 1528 aa40.08■■■■■ 4.01
NMB-201ENST00000360476 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP40.07■■■■■ 4.01
NMB-201ENST00000360476 PRAM1Q96QH2 718 aa40.07■■■■■ 4.01
NMB-201ENST00000360476 ADGRB2O60241 1585 aa40.03■■■■■ 4
NMB-201ENST00000360476 ABCA3Q99758 1704 aa40.02■■■■■ 4
NMB-201ENST00000360476 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
NMB-201ENST00000360476 BCL9LQ86UU0 1499 aa40.02■■■■■ 4
NMB-201ENST00000360476 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
NMB-201ENST00000360476 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa40.01■■■■■ 4
NMB-201ENST00000360476 KRT28Q7Z3Y7 464 aa39.97■■■■□ 3.99
NMB-201ENST00000360476 PHF8Q9UPP1 1060 aa39.97■■■■□ 3.99
NMB-201ENST00000360476 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa39.96■■■■□ 3.99
NMB-201ENST00000360476 TNS3Q68CZ2 1445 aa39.95■■■■□ 3.99
NMB-201ENST00000360476 POGKQ9P215 609 aa39.93■■■■□ 3.98
NMB-201ENST00000360476 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
NMB-201ENST00000360476 DCAF11Q8TEB1 546 aa39.92■■■■□ 3.98
NMB-201ENST00000360476 TRAK1Q9UPV9 953 aa39.92■■■■□ 3.98
NMB-201ENST00000360476 PLCH1Q4KWH8 1693 aa39.91■■■■□ 3.98
NMB-201ENST00000360476 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP39.91■■■■□ 3.98
NMB-201ENST00000360476 ANKARQ7Z5J8 1434 aa39.9■■■■□ 3.98
NMB-201ENST00000360476 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP39.89■■■■□ 3.98
NMB-201ENST00000360476 SLIT2O94813 1529 aa39.89■■■■□ 3.98
NMB-201ENST00000360476 EP400Q96L91 3159 aa39.89■■■■□ 3.98
NMB-201ENST00000360476 GLI3P10071 1580 aa39.88■■■■□ 3.97
NMB-201ENST00000360476 PLEKHG5O94827 1062 aa39.86■■■■□ 3.97
NMB-201ENST00000360476 ATAD2Q6PL18 1390 aa39.85■■■■□ 3.97
NMB-201ENST00000360476 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa39.85■■■■□ 3.97
NMB-201ENST00000360476 CABLES1Q8TDN4 633 aa39.85■■■■□ 3.97
NMB-201ENST00000360476 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
NMB-201ENST00000360476 BRWD3Q6RI45 1802 aa39.84■■■■□ 3.97
NMB-201ENST00000360476 SBNO1A3KN83 1393 aa39.83■■■■□ 3.97
NMB-201ENST00000360476 HRCP23327 699 aa39.82■■■■□ 3.97
NMB-201ENST00000360476 ALS2Q96Q42 1657 aa39.82■■■■□ 3.96
NMB-201ENST00000360476 TULP4Q9NRJ4 1543 aa39.81■■■■□ 3.96
NMB-201ENST00000360476 NWD2Q9ULI1 1742 aa39.81■■■■□ 3.96
NMB-201ENST00000360476 PRR36Q9H6K5 1346 aa39.81■■■■□ 3.96
NMB-201ENST00000360476 PSME1Q06323 249 aa39.8■■■■□ 3.96
NMB-201ENST00000360476 RALGAPBQ86X10 1494 aa39.8■■■■□ 3.96
NMB-201ENST00000360476 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP39.79■■■■□ 3.96
NMB-201ENST00000360476 LMOD2Q6P5Q4 547 aa39.77■■■■□ 3.96
NMB-201ENST00000360476 UNC5CLQ8IV45 518 aa39.77■■■■□ 3.96
NMB-201ENST00000360476 ITSN1Q15811 1721 aa39.74■■■■□ 3.95
NMB-201ENST00000360476 ARHGEF10O15013 1369 aa39.74■■■■□ 3.95
NMB-201ENST00000360476 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
NMB-201ENST00000360476 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa39.74■■■■□ 3.95
NMB-201ENST00000360476 NRAPQ86VF7 1730 aa39.71■■■■□ 3.95
NMB-201ENST00000360476 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa39.71■■■■□ 3.95
NMB-201ENST00000360476 WASLO00401 505 aaPredicted RBP39.69■■■■□ 3.94
NMB-201ENST00000360476 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
NMB-201ENST00000360476 STAC3Q96MF2 364 aa39.67■■■■□ 3.94
NMB-201ENST00000360476 ATP7BP35670 1465 aa39.67■■■■□ 3.94
NMB-201ENST00000360476 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa39.63■■■■□ 3.93
NMB-201ENST00000360476 GPRASP1Q5JY77 1395 aa39.62■■■■□ 3.93
NMB-201ENST00000360476 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
NMB-201ENST00000360476 FAM83GA6ND36 823 aa39.59■■■■□ 3.93
NMB-201ENST00000360476 VPS72Q15906 364 aa39.58■■■■□ 3.93
NMB-201ENST00000360476 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
NMB-201ENST00000360476 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
NMB-201ENST00000360476 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
NMB-201ENST00000360476 SEPT12Q8IYM1 358 aa39.52■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms