RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 POGKQ9P215 609 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 ZMYM3Q14202 1370 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 CRBNQ96SW2 442 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.64■■□□□ 1.54
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.64■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGA2Q08379 1002 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 MS4A1P11836 297 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 EVC2Q86UK5 1308 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 SLFN5Q08AF3 891 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BP1-201ENST00000357436 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE4AP27815 886 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 MORC1Q86VD1 984 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 AGLP35573 1532 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 BACH2Q9BYV9 841 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 FBLN1P23142 703 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 NUTM2FA1L443 756 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 APAF1O14727 1248 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP1-201ENST00000357436 CDK19Q9BWU1 502 aa24.51■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 METP08581 1390 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NEUROD2Q15784 382 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CABP1Q9NZU7 370 aa24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NGEFQ8N5V2 710 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ALKQ9UM73 1620 aa24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFYVE9O95405 1425 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 REREQ9P2R6 1566 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPRMP28827 1452 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 TNRQ92752 1358 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 MTHFSP49914 203 aa24.47■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 LTKP29376 864 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NBR1Q14596 966 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PP64 1363 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 E9PSI1 815 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SKAP1Q86WV1 359 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 SHPRHQ149N8 1683 aa24.43■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 USP32Q8NFA0 1604 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SH3BP1-201ENST00000357436 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 BCAR3O75815 825 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 FYB1O15117 783 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 WWC1Q8IX03 1113 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 RUNDC1Q96C34 613 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.484e-6■■■■□ 20.8
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE3AQ14432 1141 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP1-201ENST00000357436 NSD2O96028 1365 aa24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms