RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 EVC2Q86UK5 1308 aa25.38■■□□□ 1.65
TM7SF3-201ENST00000343028 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TM7SF3-201ENST00000343028 MLECQ14165 292 aa25.37■■□□□ 1.65
TM7SF3-201ENST00000343028 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.37■■□□□ 1.65
TM7SF3-201ENST00000343028 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
TM7SF3-201ENST00000343028 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TM7SF3-201ENST00000343028 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.35■■□□□ 1.65
TM7SF3-201ENST00000343028 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TM7SF3-201ENST00000343028 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.35■■□□□ 1.65
TM7SF3-201ENST00000343028 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.35■■□□□ 1.65
TM7SF3-201ENST00000343028 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TM7SF3-201ENST00000343028 PDE4AP27815 886 aa25.34■■□□□ 1.65
TM7SF3-201ENST00000343028 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
TM7SF3-201ENST00000343028 TSPOAP1O95153 1857 aa25.33■■□□□ 1.65
TM7SF3-201ENST00000343028 WWC1Q8IX03 1113 aa25.33■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.33■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 PIK3C2BO00750 1634 aa25.32■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 PRAM1Q96QH2 718 aa25.32■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.32■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 E9PSI1 815 aa25.31■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.3■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.3■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 POGKQ9P215 609 aa25.3■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 NBR1Q14596 966 aa25.28■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TM7SF3-201ENST00000343028 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 RUNDC1Q96C34 613 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 BACH2Q9BYV9 841 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 A0A1W2PP64 1363 aa25.24■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 SHPRHQ149N8 1683 aa25.23■■□□□ 1.63
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TM7SF3-201ENST00000343028 CFAP53Q96M91 514 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.22■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 PANK1Q8TE04 598 aa25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 RGS3P49796 1198 aa25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-201ENST00000343028 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.2■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 FBLN1P23142 703 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 COG6Q9Y2V7 657 aa25.19■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 MS4A1P11836 297 aa25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 TNNQ9UQP3 1299 aa25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 CDK19Q9BWU1 502 aa25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 CABP1Q9NZU7 370 aa25.16■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 PTPRMP28827 1452 aa25.15■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.14■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.14■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.14■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 FYB1O15117 783 aa25.14■■□□□ 1.62
TM7SF3-201ENST00000343028 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TM7SF3-201ENST00000343028 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.13■■□□□ 1.61
TM7SF3-201ENST00000343028 ZFYVE9O95405 1425 aa25.12■■□□□ 1.61
TM7SF3-201ENST00000343028 IGHDP01880 384 aa25.12■■□□□ 1.61
TM7SF3-201ENST00000343028 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.11■■□□□ 1.61
TM7SF3-201ENST00000343028 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TM7SF3-201ENST00000343028 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
TM7SF3-201ENST00000343028 DIP2BQ9P265 1576 aa25.1■■□□□ 1.61
TM7SF3-201ENST00000343028 NGEFQ8N5V2 710 aa25.1■■□□□ 1.61
TM7SF3-201ENST00000343028 ABCC11Q96J66 1382 aa25.1■■□□□ 1.61
TM7SF3-201ENST00000343028 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
TM7SF3-201ENST00000343028 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.09■■□□□ 1.61
TM7SF3-201ENST00000343028 USP32Q8NFA0 1604 aa25.08■■□□□ 1.61
TM7SF3-201ENST00000343028 ALKQ9UM73 1620 aa25.08■■□□□ 1.61
TM7SF3-201ENST00000343028 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
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TM7SF3-201ENST00000343028 NSD2O96028 1365 aa25.06■■□□□ 1.6
TM7SF3-201ENST00000343028 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.06■■□□□ 1.6
TM7SF3-201ENST00000343028 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TM7SF3-201ENST00000343028 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TM7SF3-201ENST00000343028 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.05■■□□□ 1.6
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TM7SF3-201ENST00000343028 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.02■■□□□ 1.6
TM7SF3-201ENST00000343028 SLC4A3P48751 1232 aa25.01■■□□□ 1.59
TM7SF3-201ENST00000343028 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TM7SF3-201ENST00000343028 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.01■■□□□ 1.59
TM7SF3-201ENST00000343028 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.01■■□□□ 1.59
TM7SF3-201ENST00000343028 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TM7SF3-201ENST00000343028 A2ML1A8K2U0 1454 aa25■■□□□ 1.59
TM7SF3-201ENST00000343028 C8orf34Q49A92 452 aa24.99■■□□□ 1.59
TM7SF3-201ENST00000343028 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.99■■□□□ 1.59
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