RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327347.9

SEPHS1-201, Transcript of selenophosphate synthetase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEPHS1, Length 3,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPHS1-201ENST00000327347 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SEPHS1-201ENST00000327347 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.99■■□□□ 1.11
SEPHS1-201ENST00000327347 ABCA6Q8N139 1617 aa21.99■■□□□ 1.11
SEPHS1-201ENST00000327347 FANCAO15360 1455 aa21.99■■□□□ 1.11
SEPHS1-201ENST00000327347 SHROOM2Q13796 1616 aa21.98■■□□□ 1.11
SEPHS1-201ENST00000327347 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SEPHS1-201ENST00000327347 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SEPHS1-201ENST00000327347 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.97■■□□□ 1.11
SEPHS1-201ENST00000327347 BECN1Q14457 450 aa21.97■■□□□ 1.11
SEPHS1-201ENST00000327347 CABP2Q9NPB3 220 aa21.96■■□□□ 1.11
SEPHS1-201ENST00000327347 ATP7AQ04656 1500 aa21.96■■□□□ 1.11
SEPHS1-201ENST00000327347 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SEPHS1-201ENST00000327347 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.95■■□□□ 1.1
SEPHS1-201ENST00000327347 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SEPHS1-201ENST00000327347 STK26Q9P289 416 aa21.95■■□□□ 1.1
SEPHS1-201ENST00000327347 TET3O43151 1660 aa21.94■■□□□ 1.1
SEPHS1-201ENST00000327347 CFAP53Q96M91 514 aa21.94■■□□□ 1.1
SEPHS1-201ENST00000327347 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.94■■□□□ 1.1
SEPHS1-201ENST00000327347 ADGRL1O94910 1474 aa21.94■■□□□ 1.1
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SEPHS1-201ENST00000327347 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.9■■□□□ 1.1
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SEPHS1-201ENST00000327347 WDR63Q8IWG1 891 aa21.88■■□□□ 1.09
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SEPHS1-201ENST00000327347 MYOM2P54296 1465 aa21.86■■□□□ 1.09
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SEPHS1-201ENST00000327347 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SEPHS1-201ENST00000327347 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.86■■□□□ 1.09
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SEPHS1-201ENST00000327347 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.86■■□□□ 1.09
SEPHS1-201ENST00000327347 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.86■■□□□ 1.09
SEPHS1-201ENST00000327347 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.86■■□□□ 1.09
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SEPHS1-201ENST00000327347 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.82■■□□□ 1.08
SEPHS1-201ENST00000327347 SHPRHQ149N8 1683 aa21.82■■□□□ 1.08
SEPHS1-201ENST00000327347 TRIM27P14373 513 aa21.82■■□□□ 1.08
SEPHS1-201ENST00000327347 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SEPHS1-201ENST00000327347 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.82■■□□□ 1.08
SEPHS1-201ENST00000327347 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.82■■□□□ 1.08
SEPHS1-201ENST00000327347 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.81■■□□□ 1.08
SEPHS1-201ENST00000327347 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.81■■□□□ 1.08
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SEPHS1-201ENST00000327347 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa21.8■■□□□ 1.08
SEPHS1-201ENST00000327347 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.79■■□□□ 1.08
SEPHS1-201ENST00000327347 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.79■■□□□ 1.08
SEPHS1-201ENST00000327347 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SEPHS1-201ENST00000327347 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.79■■□□□ 1.08
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SEPHS1-201ENST00000327347 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SEPHS1-201ENST00000327347 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.77■■□□□ 1.08
SEPHS1-201ENST00000327347 RIPK4P57078 832 aa21.76■■□□□ 1.07
SEPHS1-201ENST00000327347 CCDC27Q2M243 656 aa21.75■■□□□ 1.07
SEPHS1-201ENST00000327347 TRIM35Q9UPQ4 493 aa21.75■■□□□ 1.07
SEPHS1-201ENST00000327347 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.75■■□□□ 1.07
SEPHS1-201ENST00000327347 LNPKQ9C0E8 428 aa21.75■■□□□ 1.07
SEPHS1-201ENST00000327347 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
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SEPHS1-201ENST00000327347 ASXL2Q76L83 1435 aa21.74■■□□□ 1.07
SEPHS1-201ENST00000327347 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.73■■□□□ 1.07
SEPHS1-201ENST00000327347 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.73■■□□□ 1.07
SEPHS1-201ENST00000327347 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SEPHS1-201ENST00000327347 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.72■■□□□ 1.07
SEPHS1-201ENST00000327347 A0A1W2PP64 1363 aa21.71■■□□□ 1.07
SEPHS1-201ENST00000327347 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.71■■□□□ 1.07
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SEPHS1-201ENST00000327347 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SEPHS1-201ENST00000327347 CD109Q6YHK3 1445 aa21.7■■□□□ 1.07
SEPHS1-201ENST00000327347 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.7■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.7■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 IFT172Q9UG01 1749 aa21.7■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.7■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 ADGRB1O14514 1584 aa21.7■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 AAMPQ13685 434 aa21.69■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.69■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 MCM4P33991 863 aa21.68■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.68■■□□□ 1.06
SEPHS1-201ENST00000327347 FYB1O15117 783 aa21.68■■□□□ 1.06
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