RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 USP32Q8NFA0 1604 aa30.37■■■□□ 2.45
SNX18-201ENST00000326277 MORC1Q86VD1 984 aa30.35■■■□□ 2.45
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa30.34■■■□□ 2.45
SNX18-201ENST00000326277 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.34■■■□□ 2.45
SNX18-201ENST00000326277 RRP1P56182 461 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
SNX18-201ENST00000326277 PRAM1Q96QH2 718 aa30.34■■■□□ 2.45
SNX18-201ENST00000326277 ZMYM3Q14202 1370 aa30.32■■■□□ 2.44
SNX18-201ENST00000326277 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.32■■■□□ 2.44
SNX18-201ENST00000326277 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
SNX18-201ENST00000326277 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.31■■■□□ 2.44
SNX18-201ENST00000326277 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
SNX18-201ENST00000326277 POGKQ9P215 609 aa30.31■■■□□ 2.44
SNX18-201ENST00000326277 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
SNX18-201ENST00000326277 CCDC146Q8IYE0 955 aa30.29■■■□□ 2.44
SNX18-201ENST00000326277 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
SNX18-201ENST00000326277 ZNF521Q96K83 1311 aa30.28■■■□□ 2.44
SNX18-201ENST00000326277 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
SNX18-201ENST00000326277 NINLQ9Y2I6 1382 aa30.26■■■□□ 2.43
SNX18-201ENST00000326277 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
SNX18-201ENST00000326277 A0A1W2PP64 1363 aa30.23■■■□□ 2.43
SNX18-201ENST00000326277 NSD2O96028 1365 aa30.23■■■□□ 2.43
SNX18-201ENST00000326277 ATAD2Q6PL18 1390 aa30.23■■■□□ 2.43
SNX18-201ENST00000326277 APAF1O14727 1248 aa30.21■■■□□ 2.43
SNX18-201ENST00000326277 CCDC136Q96JN2 1154 aa30.21■■■□□ 2.43
SNX18-201ENST00000326277 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
SNX18-201ENST00000326277 SHPRHQ149N8 1683 aa30.2■■■□□ 2.43
SNX18-201ENST00000326277 GOLGA2Q08379 1002 aa30.2■■■□□ 2.43
SNX18-201ENST00000326277 DLC1Q96QB1 1528 aa30.19■■■□□ 2.42
SNX18-201ENST00000326277 DUSP27Q5VZP5 1158 aa30.19■■■□□ 2.42
SNX18-201ENST00000326277 ABCC11Q96J66 1382 aa30.18■■■□□ 2.42
SNX18-201ENST00000326277 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.17■■■□□ 2.42
SNX18-201ENST00000326277 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.17■■■□□ 2.42
SNX18-201ENST00000326277 MTHFSP49914 203 aa30.16■■■□□ 2.42
SNX18-201ENST00000326277 CDK19Q9BWU1 502 aa30.16■■■□□ 2.42
SNX18-201ENST00000326277 TNRQ92752 1358 aa30.16■■■□□ 2.42
SNX18-201ENST00000326277 CD163L1Q9NR16 1453 aa30.15■■■□□ 2.42
SNX18-201ENST00000326277 EXOC6Q8TAG9 804 aa30.15■■■□□ 2.42
SNX18-201ENST00000326277 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.14■■■□□ 2.42
SNX18-201ENST00000326277 TERF2IPQ9NYB0 399 aa30.13■■■□□ 2.41
SNX18-201ENST00000326277 SLFN5Q08AF3 891 aa30.13■■■□□ 2.41
SNX18-201ENST00000326277 PLIN1O60240 522 aa30.1■■■□□ 2.41
SNX18-201ENST00000326277 NGEFQ8N5V2 710 aa30.1■■■□□ 2.41
SNX18-201ENST00000326277 CFAP53Q96M91 514 aa30.1■■■□□ 2.41
SNX18-201ENST00000326277 METP08581 1390 aa30.1■■■□□ 2.41
SNX18-201ENST00000326277 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
SNX18-201ENST00000326277 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
SNX18-201ENST00000326277 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.07■■■□□ 2.4
SNX18-201ENST00000326277 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
SNX18-201ENST00000326277 CABP1Q9NZU7 370 aa30.07■■■□□ 2.4
SNX18-201ENST00000326277 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.06■■■□□ 2.4
SNX18-201ENST00000326277 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
SNX18-201ENST00000326277 FYB1O15117 783 aa30.05■■■□□ 2.4
SNX18-201ENST00000326277 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.04■■■□□ 2.4
SNX18-201ENST00000326277 NLRP1Q9C000 1473 aa30.04■■■□□ 2.4
SNX18-201ENST00000326277 RUNDC1Q96C34 613 aa30.03■■■□□ 2.4
SNX18-201ENST00000326277 MED14O60244 1454 aa30.03■■■□□ 2.4
SNX18-201ENST00000326277 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa30.02■■■□□ 2.4
SNX18-201ENST00000326277 DMRT2Q9Y5R5 561 aa30.02■■■□□ 2.4
SNX18-201ENST00000326277 E9PSI1 815 aa30.02■■■□□ 2.4
SNX18-201ENST00000326277 IQSEC2Q5JU85 1478 aa30■■■□□ 2.39
SNX18-201ENST00000326277 WWC1Q8IX03 1113 aa30■■■□□ 2.39
SNX18-201ENST00000326277 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
SNX18-201ENST00000326277 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.99■■■□□ 2.39
SNX18-201ENST00000326277 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.97■■■□□ 2.39
SNX18-201ENST00000326277 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.97■■■□□ 2.39
SNX18-201ENST00000326277 CRBNQ96SW2 442 aa29.97■■■□□ 2.39
SNX18-201ENST00000326277 TECPR2O15040 1411 aa29.97■■■□□ 2.39
SNX18-201ENST00000326277 ATP7BP35670 1465 aa29.97■■■□□ 2.39
SNX18-201ENST00000326277 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
SNX18-201ENST00000326277 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
SNX18-201ENST00000326277 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.95■■■□□ 2.39
SNX18-201ENST00000326277 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.95■■■□□ 2.38
SNX18-201ENST00000326277 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
SNX18-201ENST00000326277 KIF20BQ96Q89 1820 aa29.95■■■□□ 2.38
SNX18-201ENST00000326277 NEUROD2Q15784 382 aa29.94■■■□□ 2.38
SNX18-201ENST00000326277 SIRT1Q96EB6 747 aa29.94■■■□□ 2.38
SNX18-201ENST00000326277 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
SNX18-201ENST00000326277 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
SNX18-201ENST00000326277 CPS1P31327 1500 aa29.93■■■□□ 2.38
SNX18-201ENST00000326277 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
SNX18-201ENST00000326277 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
SNX18-201ENST00000326277 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.91■■■□□ 2.38
SNX18-201ENST00000326277 LTKP29376 864 aa29.89■■■□□ 2.38
SNX18-201ENST00000326277 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.89■■■□□ 2.38
SNX18-201ENST00000326277 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.37
SNX18-201ENST00000326277 C3P01024 1663 aa29.88■■■□□ 2.37
SNX18-201ENST00000326277 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
SNX18-201ENST00000326277 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.87■■■□□ 2.37
SNX18-201ENST00000326277 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
SNX18-201ENST00000326277 CCDC27Q2M243 656 aa29.86■■■□□ 2.37
SNX18-201ENST00000326277 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
SNX18-201ENST00000326277 ADGRB2O60241 1585 aa29.85■■■□□ 2.37
SNX18-201ENST00000326277 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.84■■■□□ 2.37
SNX18-201ENST00000326277 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
SNX18-201ENST00000326277 WDR63Q8IWG1 891 aa29.84■■■□□ 2.37
SNX18-201ENST00000326277 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.83■■■□□ 2.37
SNX18-201ENST00000326277 BCAR3O75815 825 aa29.83■■■□□ 2.37
SNX18-201ENST00000326277 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
SNX18-201ENST00000326277 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.82■■■□□ 2.36
SNX18-201ENST00000326277 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
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