RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322175.7

TPRX1-201, Transcript of tetrapeptide repeat homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPRX1, Length 1,924 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRX1-201ENST00000322175 TOM1O60784 492 aa21.81■■□□□ 1.08
TPRX1-201ENST00000322175 ATF3P18847 181 aa21.8■■□□□ 1.08
TPRX1-201ENST00000322175 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.8■■□□□ 1.08
TPRX1-201ENST00000322175 MIER1Q8N108 512 aa21.8■■□□□ 1.08
TPRX1-201ENST00000322175 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TPRX1-201ENST00000322175 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TPRX1-201ENST00000322175 DLC1Q96QB1 1528 aa21.78■■□□□ 1.08
TPRX1-201ENST00000322175 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.78■■□□□ 1.08
TPRX1-201ENST00000322175 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.78■■□□□ 1.08
TPRX1-201ENST00000322175 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TPRX1-201ENST00000322175 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.78■■□□□ 1.08
TPRX1-201ENST00000322175 NUTM2FA1L443 756 aa21.77■■□□□ 1.08
TPRX1-201ENST00000322175 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.77■■□□□ 1.08
TPRX1-201ENST00000322175 SLAIN2Q9P270 581 aa21.77■■□□□ 1.08
TPRX1-201ENST00000322175 FBXO41Q8TF61 875 aa21.76■■□□□ 1.07
TPRX1-201ENST00000322175 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TPRX1-201ENST00000322175 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TPRX1-201ENST00000322175 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
TPRX1-201ENST00000322175 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
TPRX1-201ENST00000322175 DCCP43146 1447 aa21.7■■□□□ 1.06
TPRX1-201ENST00000322175 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.68■■□□□ 1.06
TPRX1-201ENST00000322175 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
TPRX1-201ENST00000322175 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
TPRX1-201ENST00000322175 MST1RQ04912 1400 aa21.68■■□□□ 1.06
TPRX1-201ENST00000322175 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
TPRX1-201ENST00000322175 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
TPRX1-201ENST00000322175 ORAI2Q96SN7 254 aa21.67■■□□□ 1.06
TPRX1-201ENST00000322175 CDK19Q9BWU1 502 aa21.66■■□□□ 1.06
TPRX1-201ENST00000322175 USP47Q96K76 1375 aa21.65■■□□□ 1.06
TPRX1-201ENST00000322175 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.65■■□□□ 1.06
TPRX1-201ENST00000322175 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.65■■□□□ 1.06
TPRX1-201ENST00000322175 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.65■■□□□ 1.06
TPRX1-201ENST00000322175 BRINP3Q76B58 766 aa21.65■■□□□ 1.06
TPRX1-201ENST00000322175 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.63■■□□□ 1.05
TPRX1-201ENST00000322175 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TPRX1-201ENST00000322175 CABP2Q9NPB3 220 aa21.62■■□□□ 1.05
TPRX1-201ENST00000322175 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
TPRX1-201ENST00000322175 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.61■■□□□ 1.05
TPRX1-201ENST00000322175 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.61■■□□□ 1.05
TPRX1-201ENST00000322175 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TPRX1-201ENST00000322175 ADGRB2O60241 1585 aa21.6■■□□□ 1.05
TPRX1-201ENST00000322175 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.6■■□□□ 1.05
TPRX1-201ENST00000322175 TESK2Q96S53 571 aa21.6■■□□□ 1.05
TPRX1-201ENST00000322175 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.59■■□□□ 1.05
TPRX1-201ENST00000322175 HSPA1LP34931 641 aa21.59■■□□□ 1.05
TPRX1-201ENST00000322175 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TPRX1-201ENST00000322175 EVC2Q86UK5 1308 aa21.58■■□□□ 1.05
TPRX1-201ENST00000322175 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.58■■□□□ 1.04
TPRX1-201ENST00000322175 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
TPRX1-201ENST00000322175 FOXO3O43524 673 aa21.56■■□□□ 1.04
TPRX1-201ENST00000322175 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.56■■□□□ 1.04
TPRX1-201ENST00000322175 USP32Q8NFA0 1604 aa21.55■■□□□ 1.04
TPRX1-201ENST00000322175 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.54■■□□□ 1.04
TPRX1-201ENST00000322175 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.53■■□□□ 1.04
TPRX1-201ENST00000322175 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TPRX1-201ENST00000322175 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.52■■□□□ 1.04
TPRX1-201ENST00000322175 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.52■■□□□ 1.04
TPRX1-201ENST00000322175 ATP7BP35670 1465 aa21.52■■□□□ 1.03
TPRX1-201ENST00000322175 CCDC7Q96M83 1385 aa21.51■■□□□ 1.03
TPRX1-201ENST00000322175 CABP1Q9NZU7 370 aa21.5■■□□□ 1.03
TPRX1-201ENST00000322175 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.5■■□□□ 1.03
TPRX1-201ENST00000322175 TMF1P82094 1093 aa21.49■■□□□ 1.03
TPRX1-201ENST00000322175 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
TPRX1-201ENST00000322175 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.47■■□□□ 1.03
TPRX1-201ENST00000322175 PSME1Q06323 249 aa21.47■■□□□ 1.03
TPRX1-201ENST00000322175 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.46■■□□□ 1.03
TPRX1-201ENST00000322175 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.46■■□□□ 1.03
TPRX1-201ENST00000322175 PHLPP1O60346 1717 aa21.46■■□□□ 1.03
TPRX1-201ENST00000322175 SLC24A1O60721 1099 aa21.45■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.45■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 TMC1Q8TDI8 760 aa21.45■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 ACEP12821 1306 aa21.45■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.44■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.44■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.43■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.43■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.42■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 KIF1AQ12756 1690 aa21.4■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.4■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 PXDNQ92626 1479 aa21.4■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 ITSN1Q15811 1721 aa21.39■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
TPRX1-201ENST00000322175 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
TPRX1-201ENST00000322175 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
TPRX1-201ENST00000322175 ANP32CO43423 234 aa21.37■■□□□ 1.01
TPRX1-201ENST00000322175 PLEKHG5O94827 1062 aa21.37■■□□□ 1.01
TPRX1-201ENST00000322175 CDCA8Q53HL2 280 aa21.37■■□□□ 1.01
TPRX1-201ENST00000322175 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.37■■□□□ 1.01
TPRX1-201ENST00000322175 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
TPRX1-201ENST00000322175 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.34■■□□□ 1.01
TPRX1-201ENST00000322175 JCADQ9P266 1359 aa21.34■■□□□ 1.01
TPRX1-201ENST00000322175 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
TPRX1-201ENST00000322175 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.32■■□□□ 1
TPRX1-201ENST00000322175 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.31■■□□□ 1
TPRX1-201ENST00000322175 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
TPRX1-201ENST00000322175 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms