RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 ALKQ9UM73 1620 aa28.49■■■□□ 2.15
MESP1-201ENST00000300057 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
MESP1-201ENST00000300057 CABP2Q9NPB3 220 aa28.48■■■□□ 2.15
MESP1-201ENST00000300057 PTPRMP28827 1452 aa28.47■■■□□ 2.15
MESP1-201ENST00000300057 PDE3BQ13370 1112 aa28.47■■■□□ 2.15
MESP1-201ENST00000300057 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.47■■■□□ 2.15
MESP1-201ENST00000300057 ZMYM3Q14202 1370 aa28.46■■■□□ 2.15
MESP1-201ENST00000300057 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.46■■■□□ 2.15
MESP1-201ENST00000300057 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.45■■■□□ 2.15
MESP1-201ENST00000300057 PRAM1Q96QH2 718 aa28.45■■■□□ 2.14
MESP1-201ENST00000300057 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
MESP1-201ENST00000300057 POGKQ9P215 609 aa28.43■■■□□ 2.14
MESP1-201ENST00000300057 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
MESP1-201ENST00000300057 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
MESP1-201ENST00000300057 MORC1Q86VD1 984 aa28.42■■■□□ 2.14
MESP1-201ENST00000300057 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
MESP1-201ENST00000300057 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.39■■■□□ 2.14
MESP1-201ENST00000300057 USP32Q8NFA0 1604 aa28.39■■■□□ 2.14
MESP1-201ENST00000300057 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.39■■■□□ 2.14
MESP1-201ENST00000300057 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.38■■■□□ 2.13
MESP1-201ENST00000300057 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.37■■■□□ 2.13
MESP1-201ENST00000300057 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.37■■■□□ 2.13
MESP1-201ENST00000300057 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.35■■■□□ 2.13
MESP1-201ENST00000300057 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
MESP1-201ENST00000300057 TNRQ92752 1358 aa28.32■■■□□ 2.12
MESP1-201ENST00000300057 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
MESP1-201ENST00000300057 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
MESP1-201ENST00000300057 A0A1W2PP64 1363 aa28.31■■■□□ 2.12
MESP1-201ENST00000300057 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
MESP1-201ENST00000300057 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.3■■■□□ 2.12
MESP1-201ENST00000300057 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.3■■■□□ 2.12
MESP1-201ENST00000300057 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.29■■■□□ 2.12
MESP1-201ENST00000300057 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.28■■■□□ 2.12
MESP1-201ENST00000300057 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.28■■■□□ 2.12
MESP1-201ENST00000300057 CDK19Q9BWU1 502 aa28.27■■■□□ 2.12
MESP1-201ENST00000300057 NSD2O96028 1365 aa28.26■■■□□ 2.11
MESP1-201ENST00000300057 DLC1Q96QB1 1528 aa28.26■■■□□ 2.11
MESP1-201ENST00000300057 APAF1O14727 1248 aa28.25■■■□□ 2.11
MESP1-201ENST00000300057 ZNF521Q96K83 1311 aa28.25■■■□□ 2.11
MESP1-201ENST00000300057 SHPRHQ149N8 1683 aa28.24■■■□□ 2.11
MESP1-201ENST00000300057 ABCC11Q96J66 1382 aa28.23■■■□□ 2.11
MESP1-201ENST00000300057 MTHFSP49914 203 aa28.23■■■□□ 2.11
MESP1-201ENST00000300057 METP08581 1390 aa28.23■■■□□ 2.11
MESP1-201ENST00000300057 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.22■■■□□ 2.11
MESP1-201ENST00000300057 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.22■■■□□ 2.11
MESP1-201ENST00000300057 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.21■■■□□ 2.11
MESP1-201ENST00000300057 GOLGA2Q08379 1002 aa28.21■■■□□ 2.11
MESP1-201ENST00000300057 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
MESP1-201ENST00000300057 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.19■■■□□ 2.1
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MESP1-201ENST00000300057 GGNBP2Q9H3C7 697 aa28.18■■■□□ 2.1
MESP1-201ENST00000300057 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.18■■■□□ 2.1
MESP1-201ENST00000300057 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.18■■■□□ 2.1
MESP1-201ENST00000300057 CABP1Q9NZU7 370 aa28.18■■■□□ 2.1
MESP1-201ENST00000300057 CFAP53Q96M91 514 aa28.17■■■□□ 2.1
MESP1-201ENST00000300057 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
MESP1-201ENST00000300057 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
MESP1-201ENST00000300057 NBR1Q14596 966 aa28.16■■■□□ 2.1
MESP1-201ENST00000300057 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.16■■■□□ 2.1
MESP1-201ENST00000300057 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.15■■■□□ 2.1
MESP1-201ENST00000300057 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.15■■■□□ 2.1
MESP1-201ENST00000300057 PLIN1O60240 522 aa28.14■■■□□ 2.1
MESP1-201ENST00000300057 SLFN5Q08AF3 891 aa28.13■■■□□ 2.09
MESP1-201ENST00000300057 FYB1O15117 783 aa28.12■■■□□ 2.09
MESP1-201ENST00000300057 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
MESP1-201ENST00000300057 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.11■■■□□ 2.09
MESP1-201ENST00000300057 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
MESP1-201ENST00000300057 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
MESP1-201ENST00000300057 NLRP1Q9C000 1473 aa28.09■■■□□ 2.09
MESP1-201ENST00000300057 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.09■■■□□ 2.09
MESP1-201ENST00000300057 C3P01024 1663 aa28.09■■■□□ 2.09
MESP1-201ENST00000300057 RUNDC1Q96C34 613 aa28.08■■■□□ 2.09
MESP1-201ENST00000300057 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
MESP1-201ENST00000300057 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
MESP1-201ENST00000300057 NGEFQ8N5V2 710 aa28.07■■■□□ 2.08
MESP1-201ENST00000300057 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.07■■■□□ 2.08
MESP1-201ENST00000300057 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.07■■■□□ 2.08
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MESP1-201ENST00000300057 NEUROD2Q15784 382 aa28.06■■■□□ 2.08
MESP1-201ENST00000300057 MED14O60244 1454 aa28.06■■■□□ 2.08
MESP1-201ENST00000300057 TECPR2O15040 1411 aa28.06■■■□□ 2.08
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MESP1-201ENST00000300057 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
MESP1-201ENST00000300057 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.03■■■□□ 2.08
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MESP1-201ENST00000300057 WWC1Q8IX03 1113 aa28.03■■■□□ 2.08
MESP1-201ENST00000300057 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.03■■■□□ 2.08
MESP1-201ENST00000300057 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.02■■■□□ 2.08
MESP1-201ENST00000300057 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
MESP1-201ENST00000300057 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
MESP1-201ENST00000300057 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.02■■■□□ 2.08
MESP1-201ENST00000300057 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
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